創薬ターゲットとしてのトリインフルエンザ抵抗性分子の同定

2009 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21710204
• Research Institution: Tokai University
• Principal Investigator: 細道 一善 Tokai University, 医学部, 特定研究員 (50420948)
• Keywords: ニワトリ / MHC / ゲノム / 多様性 / SNP / トリインフルエンザ

Research Abstract

既報の知見より、トリインフルエンザに感染したニワトリのMHC遺伝子型がハプロタイプB13のホモおよびヘテロ接合体のものは生存率が1%であったのに対し、ハプロタイプB21のホモおよびヘテロ接合体は生存率が98%であったことから、MHC領域にトリインフルエンザ抵抗性遺伝子が存在する可能性が高いと考えられる。本研究ではMHCハプロタイプB13とB21のMHC領域のリシークエンスを行い、両ハプロタイプ間の多様性を明らかにし、トリインフルエンザ抵抗性遺伝子を同定、その機能を明らかにすることを目的とした。B13およびB21のKIGC1～C4遺伝子までの約160kbの塩基配列を決定し、比較したところ、TRIM7.2またはLAO遺伝子に過去に起きた組み換え点が存在し、MHCハプロタイプの遺伝的連鎖領域は少なくともLAO～C4遺伝子までの約130kbに絞り込まれることを明らかにした。さらに、B13とB21間で比較し、この領域に含まれるアミノ酸変異を伴う非同義置換のSNPを検索したところ、LAO、TRIM7.1、TRIM39.2、TRIM27.2、TRIM39.1、TRIM27.1、GNB2L1、BTN1、Blec2、TAPBP、BLB2、DMB1、DMB2、BF1、TAP1、TAP2およびBF2の17遺伝子がトリインフルエンザウイルス抵抗性遺伝子の候補として絞り込まれた。これらのうち、機能的ドメインとしてのアミノ酸変異を精査したところ、TRIM27.2のSPRYドメインにおいて3ヶ所のアミノ酸置換が認められた。これらの変異はタンパク質の二次構造のαヘリックスおよびβシートを破壊する傾向があること、霊長類においてTRIM遺伝子の一つであるTRIM5αはHIVウィルス感染と関連が報告されていることから、TRIM27.2のSPRYドメインはウィルス感染との関連する可能性が考えられた。

Research Products

• [Journal Article] Positional effects of polymorphisms in probe-target sequences on genoplot images of oligonucleotide microarrays (2010)
  • Author(s): Cui TL, Nakaoka H, Akiyama K, Kamura H, Hosomichi K, Bae J, Cheong H, Shin H, Yada T, Inoue I
  • Journal Title: Genet.Mol.Res. 9 Pages: 524-531
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] BG1 has a major role in MHC-linked resistance to malignant lymphoma in the chicken. (2009)
  • Author(s): Goto RM, Wang Y, Taylor RL Jr, Wakenell PS, Hosomichi K, Shiina T, Blackmore CS, Briles WE, Miller MM.
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci USA. 106 Pages: 16740-16745
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The HLA genomic loci map : expression, interaction, diversity and disease. (2009)
  • Author(s): Shiina T, Hosomichi K, Inoko H, Kulski JK.
  • Journal Title: J Hum Genet. 54 Pages: 15-39
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] MHC class I A loci polymorphism and diversity in three Southeast Asian populations of cynomolgus macaque. (2009)
  • Author(s): Kita YF, Hosomichi K, Kohara S, Itoh Y, Ogasawara K, Tsuchiya H, Torii R, Inoko H, Blancher A, Kulski .TK, Shiina T.
  • Journal Title: Immunogenetics. 61 Pages: 635-648
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] HLA-A allele associations with viral MER9-LTR nucleotide sequences at two distinct loci within the MHC alpha block. (2009)
  • Author(s): Kulski JK, Shigenari A, Shiina T, Hosomichi K, Yawata M, Inoko H.
  • Journal Title: Immunogenetics. 61 Pages: 257-270
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nutritional and hormonal regulation of uncoupling protein 2. (2009)
  • Author(s): Yonezawa T, Kurata R, Hosomichi K, Kono A, Kimura M, Inoko H.
  • Journal Title: IUBMB Life. 61 Pages: 1123-1231
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ニホンウズラTRIM領域の塩基配列の決定 (2010)
  • Author(s): 鈴木進悟、細道一善、椎名隆、原ひろみ、吉田豊、半澤恵
  • Organizer: 日本畜産学会第112回大会
  • Place of Presentation: 明治大学リバティタワー(東京)
  • Year and Date: 2010-03-29
• [Presentation] Haplotype analysis that added new genetic polymorphic marker of the Japanese Quail Mhc region (2009)
  • Author(s): Suzuki S, Hosomichi K, Shiina T, Mizutani M, Fujiwara A, Watari K, Hara H, Yoshida Y, Hanzawa K
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川)
  • Year and Date: 2009-12-12
• [Presentation] Development of personal genome analysis method on the entire HLA region (2009)
  • Author(s): Hosomichi K, Shiina T, Wang T, Kawata H, Indko H, Inoue I
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川)
  • Year and Date: 2009-12-09
• [Presentation] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発と疾患関連解析への応用 (2009)
  • Author(s): 細道一善
  • Organizer: 第4回バイオインフォマティクス研究者と医学研究者の交流会
  • Place of Presentation: 東京大学柏キャンパス(千葉)
  • Year and Date: 2009-11-20
• [Presentation] SNP association study of Behcet' s disease to unravel the genetic susceptibility and pathoetiology. (2009)
  • Author(s): Kurata R, Nakaoka H, Tajima A, Saito T, Hosomichi K, Shiina T, Meguro A, Mizuki N, Inoko H, Inoue I
  • Organizer: The American Society of Human Genetics 59th Annual Meeting
  • Place of Presentation: Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii
  • Year and Date: 2009-10-22
• [Presentation] ニホンウズラMHCクラス1領域に座位するTAPI遺伝子の多様性解析 (2009)
  • Author(s): 池田正規、朝治桜子、鈴木進悟、細道一善、椎名隆、原ひろみ、吉田豊、半澤恵
  • Organizer: 日本畜産学会第111回大会
  • Place of Presentation: 琉球大学千原キャンパス(沖縄)
  • Year and Date: 2009-09-28
• [Presentation] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • Author(s): 細道一善、猪子英俊、河田寿子、井ノ上逸朗、椎名隆
  • Organizer: 第18回日本組織適合性学会大会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場(愛知)
  • Year and Date: 2009-09-26
• [Presentation] HLA領域のパーソナルゲノム解析法の開発 (2009)
  • Author(s): 細道一善、椎名隆、王〓、河田寿子、猪子英俊、井ノ上逸朗
  • Organizer: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • Place of Presentation: グランドプリンスホテル高輪(東京)
  • Year and Date: 2009-09-25
• [Presentation] ベーチェット病感受性領域のSNP関連解析から病態解明 (2009)
  • Author(s): 倉田里穂、中岡博史、田嶋敦、斉藤卓磨、細道一善、椎名隆、目黒明、水木信久、井ノ上逸朗、猪子英俊
  • Organizer: 日本人類遺伝学会第54回大会
  • Place of Presentation: グランドプリンスホテル高輪(東京)
  • Year and Date: 2009-09-24