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2010 Fiscal Year Final Research Report

Development of inhibitors based on short helical peptides for protein-protein interactions

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 21750167
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

FUJIMOTO Kazuhisa  University of Toyama, 大学院・医学薬学研究部, 助教 (40334718)

Project Period (FY) 2009 – 2010
Keywordsα-ヘリックス / タンパク間相互作用 / 阻害剤 / 生体高分子
Research Abstract

I explored the effect of α-helical stabilization upon the binding of short peptides to DNAs. When a cross-linked peptide based on the homeodomain of transcription factor was titrated with a target DNA duplex, its dissociation constant (Kd) was calculated to be ca. 0.5 nM. This value was the double-digit smaller than that of the corresponding non-cross-linked peptide. The cross-linked peptide showed high substrate specificity for DNAs at the same level as the original DNA-binding protein.

  • Research Products

    (25 results)

All 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (17 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Side Chain Cross-linked α-Helices That Behave Like Original Proteins in Biomacromolecular Interactions2011

    • Author(s)
      Masaoki Kajino, Kazuhisa Fujimoto, Masahiko Inouye
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 133巻

      Pages: 656-659

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Highly emissive pyrene-based fluorophores and highly sensitive fluorescent sensors using pyrene emission switching2010

    • Author(s)
      Kazuhisa Fujimoto
    • Journal Title

      Yakugaku Zasshi 130巻

      Pages: 1283-1287

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific Induced Circular Dichroism and Enhanced B to Z Transitions of Duplexes Stabilized by Chromophore-Linked Alkynylnucleoside Residues2010

    • Author(s)
      Kazuhisa Fujimoto, Sayaka Aizawa, Ikko Oota, Junya Chiba, Masahiko Inouye
    • Journal Title

      Chem.-Eur.J. 16巻

      Pages: 2401-2406

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photophysical Properties of 1,3,6,8-Tetrakis(arylethynyl)pyrenes with Donor or Acceptor Substituents: Their Fluorescence Solvatochromism and Lightfastness2009

    • Author(s)
      Kazuhisa Fujimoto, Hisao Shimizu, Masaru Furusyo, Seiji Akiyama, Mio Ishida, Utako Furukawa, Toshiaki Yokoo, Masahiko Inouye
    • Journal Title

      Tetrahedron 65巻

      Pages: 9357-9361

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of Versatile Fluorescent Sensors Based on Click Chemistry: Detection of Fatty Acids by their Pyrene-Emission Switching2009

    • Author(s)
      Kazuhisa Fujimoto, Shogo Yamada, Masahiko Inouye
    • Journal Title

      Chem.Commun.

      Pages: 7164-7166

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characteristic Fluorescence Behavior of Dialkynylpyrene Derivatives in Hydrophobic Cavity of Protein2009

    • Author(s)
      Hideyuki Shinmori, Hirotoshi Furukawa, Kazuhisa Fujimoto, Hisao Shimizu, Masahiko Inouye, Toshifumi Takeuchi
    • Journal Title

      Chem.Lett 38巻

      Pages: 84-85

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの電子移動2011

    • Author(s)
      藤原匡志・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第91春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20110326-20110329
  • [Presentation] 様々なタンパクをミニチュア化したヘリカルペプチドとDNAとの相互作用解析2011

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第91春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学
    • Year and Date
      20110326-20110329
  • [Presentation] 金電極上におけるフェロセンラベル化ペプチドのダイナミクスと電気化学応答2010

    • Author(s)
      藤原匡志・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      平成22年度有機合成化学北陸セミナー
    • Place of Presentation
      石川県青少年総合研修センター
    • Year and Date
      20101008-20101009
  • [Presentation] 金基板上に固定化したフェロセンラベル化ペプチドの二次構造とその電気化学応答との関係2010

    • Author(s)
      藤原匡志・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学豊中キャンパス
    • Year and Date
      20100924-20100926
  • [Presentation] ミニチュア化タンパク"としての架橋ヘリカルペプチドとDNAの相互作用2010

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学豊中キャンパス
    • Year and Date
      20100924-20100926
  • [Presentation] ヘリカルペプチドを用いたペプチド-DNA間相互作用の安定化2010

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      ケミカルバイオロジー学会第5回年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      20100518-20100519
  • [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のFRETによる定量解析2010

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第90春季年会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      20100326-20100329
  • [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸残基をもつ新規光応答性ペプチドの開発2010

    • Author(s)
      岡田洋平・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第90春季年会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      20100326-20100329
  • [Presentation] フェロセン骨格を有する短鎖ヘリカルペプチドの金基板上への固定化とその電気化学応答2010

    • Author(s)
      深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      日本化学会第90春季年会
    • Place of Presentation
      近畿大学本部キャンパス
    • Year and Date
      20100326-20100329
  • [Presentation] ジアリールエテンを利用したヘリカルペプチド/DNA相互作用の光制御2010

    • Author(s)
      藤本和久・梶野雅起・河合博和・井上将彦
    • Organizer
      第12回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      芦原温泉清風荘
    • Year and Date
      20100108-20100109
  • [Presentation] ジアリールエテンの光異性化を利用した生体分子間相互作用の制御2010

    • Author(s)
      藤本和久・梶野雅起・井上将彦
    • Organizer
      平成22年度北陸地区講演会と研究発表会
    • Place of Presentation
      富山大学五福キャンパス
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] ジアリールエテンを骨格とする非天然アミノ酸を有するフォトクロミックペプチドの開発2009

    • Author(s)
      岡田洋平・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      平成21年度有機合成化学北陸セミナー
    • Place of Presentation
      富山観光ホテル
    • Year and Date
      20091009-20091010
  • [Presentation] クロスリンク剤で架橋したヘリカルペプチドの基板への固定化とその応用2009

    • Author(s)
      深澤聡晃・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      平成21年度有機合成化学北陸セミナー
    • Place of Presentation
      富山観光ホテル
    • Year and Date
      20091009-20091010
  • [Presentation] 光応答性DNA結合ペプチドの開発2009

    • Author(s)
      河合博和・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      20090914-20090915
  • [Presentation] 短鎖ヘリカルペプチドとDNAとの相互作用のスペクトル解析2009

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      第24回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      20090914-20090915
  • [Presentation] ジアリールエテンで架橋したペプチドの DNA認識能の光制御2009

    • Author(s)
      河合博和・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      ケミカルバイオロジー学会第4回年会
    • Place of Presentation
      神戸市産業振興センター
    • Year and Date
      20090518-20090519
  • [Presentation] 架橋ヘリカルペプチドの蛍光標識化とその核酸との相互作用の評価2009

    • Author(s)
      梶野雅起・藤本和久・井上将彦
    • Organizer
      ケミカルバイオロジー学会第4回年会
    • Place of Presentation
      神戸市産業振興センター
    • Year and Date
      20090518-20090519
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.pha.u-toyama.ac.jp/yakka/index-j.html

  • [Remarks] ReaD研究者情報

    • URL

      http://jglobal.jst.go.jp/detail.php?JGLOBAL_ID=200901013658317736&t=1&d=1&q=1000370583

URL: 

Published: 2012-02-13   Modified: 2016-04-21  

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