2010 Fiscal Year Annual Research Report
自然生態系におけるアンモニア酸化アーキアの二酸化炭素固定に関する分子生態学的研究
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21770028
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| Research Institution | Nihon University |
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Principal Investigator |
中川 達功 日本大学, 生物資源科学部, 講師 (40434104)
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| Keywords | アンモニア酸化性アーキア / 二酸化炭素固定 / 安定同位体DNAプローブ法 / アンモニア酸化性バクテリア / 密度勾配遠心分離法 / 古細菌 / 硝化 / アセチルCoAカルボキシラーゼ |
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| Research Abstract |
アンモニア酸化アーキアの分離菌株は世界で1菌株のみであることと、その培養方法が確立されていないことから、自然生態系においてアンモニア酸化性アーキアが二酸化炭素の固定にどの程度関与しているのかは、全くの未知である。そこで、本研究では、近年、技術の普及が見られる安定同位体DNAプローブ法を用い、海洋や土壌中の難培養性アンモニア酸化アーキアの二酸化炭素固定能を解明することを目的とした。平成22年度の研究実施計画は次の3点とした。1安定同位体の重い重炭酸ナトリウムを用いたインキュベーション実験と遺伝子定量解析、2遺伝子定量解析、多様性解析、塩基配列の決定、3亜硝酸、硝酸濃度の測定。当初の計画より環境試料への安定同位体DNAプローブ法の適用に時間を要した結果、計画1と2のみ実施した。実施計画1については、森林土壌を試料とし安定同位体DNAプローブ法の超遠心を実施した。^<12>C-DNAと^<13>C-DNAの分別は目視では認められなかった。2遺伝子定量解析等については、アーキアの炭酸固定酵素アセチルCoAカルボキシラーゼを特異的にPCR増幅するプライマーの開発を試みた。
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