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2009 Fiscal Year Annual Research Report

窒素固定放線菌フランキアの共生関連遺伝子の研究

Research Project

Project/Area Number 21770053
Research InstitutionKagoshima University

Principal Investigator

九町 健一  Kagoshima University, 理工学研究科, 助教 (70404473)

Keywords共生 / 窒素固定 / 根粒 / フランキア / 形質転換 / マイクロアレイ
Research Abstract

コドン使用頻度をフランキアに最適化したゲンタマイシン耐性遺伝子を人工合成し、形質転換を試みた。その結果、形質転換の成功率が有意に向上したことから、コドン使用頻度はフランキア細胞内での外来遺伝子の発現に重要であることが分かった。しかしながら、得られた形質転換体は依然不安定であり、spontaneous mutantの存在が示唆された。
自殺基質5-fluoroorotic acid (5-FOA)を用いたスクリーニングにより、ウラシル要求性を示すフランキア変異株の単離に成功した。塩基配列解析により、pyrEもしくはpyrF遺伝子に点突然変異が起こっていることを確認した。これはフランキアにおいて塩基配列レベルで変異箇所が特定された初めての変異体である。この株に対して野生型のpyrF伝子をマーカー遺伝子として形質転換を行った結果、ウラシル要求性が相補された株が得られた。現在、得られた形質転換体の分子レベルでの特徴づけを行っている。
根粒でのマイクロアレイ解析の結果、フランキアの染色体には根粒菌の共生アイランド様の領域は存在しないことが示唆された。系統的に遠縁の4種の宿主植物に着生した根粒中のトランスクリプトームは非常に似通っていた。フランキアと根粒菌の双方で根粒中で発現が誘導される遺伝子は極めて少なかった。そのほとんどは窒素固定酵素遺伝子であったが、電子伝達や窒素代謝に関わる遺伝子も含まれた。また、根粒中で活性化されるフランキア特異的な遺伝子も多数同定された。これらの遺伝子は共生窒素固定で重要な役割を担う可能性が高い。これらの結果を論文にまとめて投稿し、受理された。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 2009

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] The Frankia alni Symbiotic Transcriptome2010

    • Author(s)
      Alloisio N, Queiroux C, Fournier P, Pujie P, Normand P, Vallenet D, Medigue C, Yamaura M, Kakoi K, Kucho K
    • Journal Title

      Mol Plant Microbe Interact (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant peptides govern terminal differentiation of bacteria in symbiosis2010

    • Author(s)
      Van de Velde W, Zehirov G, Szatmari A, Debreczeny M, Ishihare H, Kevei Z, Farkas H, Satiat-Jeunemaitre B, Alunni B, Bourge M, Kucho K, Abe M, Kereszt A, ,Maroti G, Uchiumi T, Kondorosi E, Mergaert P
    • Journal Title

      Science 327

      Pages: 1122-1126

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification by suppression subtractive hybridization of Frankia genes induced under nitrogen-fixing conditions2009

    • Author(s)
      Yamaura M, Uchiumi T, Higashi S, Abe M, Kucho K
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 76

      Pages: 1962-1964

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enhanced nodulation and nitrogen fixation in the ABC low-sensitive mutantenf1 (enhanced nitrogen fixation 1) of Lotus japonicus2009

    • Author(s)
      Tominaga A, Nagata M, Futsuki K, Abe H, Uchiumi T, Abe M, Kucho KI, Hashiguchi M, Akashi R, Hirsch AM, Arima S, Suzuki A
    • Journal Title

      Plant Physiol 151

      Pages: 1965-1976

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transient transformation of Frankia by fusion marker genes in liquid culture2009

    • Author(s)
      Kucho K, Kakoi K, Yamaura M, Higashi S, Uchiumi T Abe M
    • Journal Title

      Microbes Environ 24

      Pages: 231-240

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 樹木と共生窒素固定を行う放線菌フランキアのトランスクリプトーム解析2010

    • Author(s)
      九町健一、Alloisio N、Queiroux C、Fournier P、Pujic P、Vallenet D、Medigue C、山浦真稔、栫健太郎、内海俊樹、阿部美紀子、Normand P
    • Organizer
      日本植物生理学会第51回大会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      2010-03-20
  • [Presentation] Nitrogen-fixing Symbiosis between the Actinobacterium Frankia and Trees2010

    • Author(s)
      Kucho K
    • Organizer
      7th Okazaki Biology Conferences
    • Place of Presentation
      ヤマハリゾートつま恋(静岡)
    • Year and Date
      2010-01-13
  • [Presentation] 共生窒素固定細菌Frankiaの形質転換法への高発現プロモーターの利用2009

    • Author(s)
      栫健太郎、山浦真稔、東四郎、内海俊樹、阿部美紀子、九町健一
    • Organizer
      植物微生物研究会第19回研究交流会
    • Place of Presentation
      あがたの森文化会館(長野県)
    • Year and Date
      2009-09-09
  • [Presentation] 単生で窒素固定するFrankiaで誘導される遺伝子の同定2009

    • Author(s)
      山浦真稔、東四郎、内海俊樹、阿部美紀子、九町健一
    • Organizer
      植物微生物研究会第19回研究交流会
    • Place of Presentation
      あがたの森文化会館(長野県)
    • Year and Date
      2009-09-09
  • [Presentation] 共生窒素固定細菌フランキアの形質転換法の確立2009

    • Author(s)
      九町健一、栫健太郎、山浦真稔、内海俊樹、阿部美紀子
    • Organizer
      2009年度 日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      秋田ビューホテル(秋田県)
    • Year and Date
      2009-07-17
  • [Presentation] Suppression subtractive hybtidization法の細菌への応用-単生で窒素固定を行うFrankiaで特異的に誘導される遺伝子の探索2009

    • Author(s)
      栫健太郎、山浦真稔、東四郎、内海俊樹、阿部美紀子、九町健一
    • Organizer
      2009年度 日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      秋田ビューホテル(秋田県)
    • Year and Date
      2009-07-17
  • [Presentation] 共生窒素固定細菌Frankiaの形質転換法への高発現プロモーターの利用2009

    • Author(s)
      山浦真稔、東四郎、内海俊樹、阿部美紀子、九町健一
    • Organizer
      2009年度 日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      秋田ビューホテル(秋田県)
    • Year and Date
      2009-07-17

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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