• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

繁殖様式の違いが遺伝構造に与える影響を分子植物地理学的に解明する

Research Project

Project/Area Number 21770092
Research InstitutionResearch Institute for Humanity and Nature

Principal Investigator

瀬尾 明弘  総合地球環境学研究所, 研究部, プロジェクト研究員 (30378567)

Keywords分子植物地理 / 遺伝構造 / 繁殖様式 / 被子植物 / 日本列島
Research Abstract

平成22年度は,ウワバミソウならびにヤマトキホコリの葉緑体DNA塩基配列多型解析を行った。本州の青森県から広島県にかけた地域において収集した9カ所のサンプルを使用した。予備的解析で多型があることがわかっている葉緑体DNAの領域を用いて解析を行った。ウワバミソウについてはpsbC-trnS(UGA)遺伝子間領域を,ヤマトキホコリについてはrp116遺伝子間領域をユニバーサルプライマーを用いてPCRで増幅し,3100ジェネテックアナライザーで,それぞれの葉緑体DNA塩基配列を決定した。その後,Phred/Phrap/Consedならびにseaview4を用いて決定した塩基配列を比較して,塩基配列の多型を検出した。
その結果,ウワバミソウにおいては8タイプの葉緑体DNA塩基配列多型を検出した。塩基配列を決定できた279塩基対のうち,5箇所の塩基置換ならびに2カ所の長さ違いによる多型である。検出された葉緑体DNAハプロタイプのうち一つは広く本州に分布していた。その他は青森県,石川県および兵庫県のサンプルにはそれぞれの地点でユニークなハプロタイプが検出できた。また,近畿地方の地点からのみ検出された葉緑体DNAハプロタイプがあった。一方,ヤマトキホコリはサンプルが少なく京都府産のサンプルを解析することしかできなかった。さらに,今回解析を行ったヤマトキホコリについては葉緑体DNA塩基配列多型を検出することができなかった。ヤマトキホコリを採集した地点のウワバミソウでは葉緑体DNAハプロタイプの多型があった。

  • Research Products

    (3 results)

All 2011 2010

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Phylogeography of Carpinus japonica Blume and Carpinus tschonoskii Maxim.growing in Japanese deciduous broad-leaved forests, based on chloroplasta DNA variation.2010

    • Author(s)
      Iwasaki, T., A.Tono, K.Aoki, A.Seo, N.Murakami
    • Journal Title

      Acta Phytotaxonomica et Geobotanica

      Volume: 61 Pages: 1-20

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic structure of an endemic Japanese conifer, Sciadopitys verticillata (Sciadopityaceae), by using microsatellite markers.2010

    • Author(s)
      Kawase, D., Y.Tsumura, N.Tomaru, A.Seo, T.Yumoto
    • Journal Title

      Journal of Heredity

      Volume: 101 Pages: 292-297

    • Peer Reviewed
  • [Book] DNA情報からみた植物の分布変遷.湯本貴和編・高原光・村上哲明責任編.「環境史をみる技術」2011

    • Author(s)
      瀬尾明弘・村上哲明
    • Total Pages
      246
    • Publisher
      文一総合出版

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi