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2010 Fiscal Year Annual Research Report

SAIL法を用いたジスルフィド架橋結合の位置および立体配座決定法の開発

Research Project

Project/Area Number 21770110
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

武田 光広  名古屋大学, 理学研究科, 研究員 (90508558)

Keywordsタンパク質 / SAIL法 / NMR / ジスルフィド結合
Research Abstract

本課題は、メチレン基のpro-Rあるいはpro-Sの^1Hを^2Hに置き換えた二種類の立体整列同位体標識(Stereo-array isotope labeling : SAIL)システインを同時に取り込ませた蛋白質を利用して、S-SをはさんだHβ^s(i)-Hβ^s(j)間,Hβ^s(i)-Hβ^r(j)間,Hβ^r(i)-Hβ^s(j)間,Hβ^r(i)-Hβ^r(j)間の4つのNOEシグナルをNMRにより検出してS-S結合の位置を同定し、さらにそれらの相対強度からS-S結合の立体配座を決定する手法の開発を目指すものである。本年度は、3つのS-S結合を含む分子量6.5kDaのウシ膵臓由来トリプシン阻害剤(Bovine pancreas trypsin inhibitor : BPTI)蛋白質に対して、SAIL、システインを取り込ませた重水素化試料および均一^<13>C標識システインを取り込ませた従来型の非重水素化試料を調製し、両者のNMRスペクトルを比較した。その結果、SAILシステイン標識試料は均一標識試料と比較して、ジェミナルNOEを含む不要なNOEシグナルとの縮重がなくなり、S-SをはさんだHβ-Hβ間NOEの観測が格段に容易となった。さらにSAILシステイン標識タンパク質では周囲のプロトンの重水素化によりスピン拡散現象が抑えられ、NOE強度が実際の水素原子間距離を正しく反映し、均一標識試料では不可能であったNOEに基づく正確なプロトン間距離情報の抽出に成功した。本手法の確立は、既存のペプチド分析などと比較して、解析試料を分解せずにS-S結合の位置を決定し、さらに従来不可能であったS-S結合の立体配座情報を得ることを可能とする。この事はS-S結合タンパク質の構造、機能解析に大きく貢献すると期待される。

  • Research Products

    (5 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Construction and performance of an NMR tube with a sample cavity formed within magnetic susceptibility-matched glass.2011

    • Author(s)
      Takeda M, Hallenga K, Shigezane M, Waelchli M, Lohr F, Markley JL, Kainosho M.
    • Journal Title

      Journal of Magnetic Resonance

      Volume: 209 Pages: 167-173

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of stereoarray isotope labeled (SAIL) lysine via the head-to-tail conversion of SAIL glutamic acid2011

    • Author(s)
      Terauchi T, Kamikawai T, Vinogradov MG, Starodubtseva EV, Takeda M, Kainosho M.
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 13 Pages: 161-163

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of the sulfhydryl groups in proteins with slow hydrogen exchange rates and determination of their proton/deuteron fractionation factors using the deuterium-induced effects on the 13C(beta)NMR signals.2010

    • Author(s)
      Takeda M, Jee J, Terauchi T, Kainosho M
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 132 Pages: 6254-6260

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 蛋白質側鎖OH/SHの水素交換速度の解析2010

    • Author(s)
      武田光広、Chun-Jiun Yang、JunGoo Jee、小野明、寺内勉、甲斐荘正恒
    • Organizer
      第49回NMR討論会
    • Place of Presentation
      東京タワーホール船堀
    • Year and Date
      2010-11-15
  • [Presentation] NMR Hydrogen Exchange Study of Tyrosine Hydroxyl and Cysteine Sulfhydryl Groups by Deuterium Isotope Shift Effects2010

    • Author(s)
      Mitsuhiro Takeda, Akira Mono, Tsutomu Terauchi, JunGoo Jee, Masatsune Kainosho
    • Organizer
      Joint EUROMAR 2010 and 17th ISMAR Conference
    • Place of Presentation
      Palazzo dei Congressi and Palazzo degli Affari, Florence Italy
    • Year and Date
      2010-07-04

URL: 

Published: 2012-07-19  

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