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2009 Fiscal Year Annual Research Report

べん毛モーター固定子複合体の相互作用・イオン透過・構造変化の解析

Research Project

Project/Area Number 21770166
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

須藤 雄気  Nagoya University, 理学研究科, 准教授 (10452202)

Keywords膜タンパク質 / 生物物理学 / 相互作用 / 生化学 / 分光法 / べん毛モーター
Research Abstract

細菌は好む環境に集合し、好まざる環境から逃避する性質(走性)を示し過酷な環境を生き抜く。これは環境を認識する受容体(レセプター)と運動器官(べん毛モーター)により担われる。本研究ではレセプター研究での経験を生かし、べん毛モーター研究(相互作用・イオン透過・構造変化)に踏み出した。今年度は以下のことに取り組んだ。
1) PomA、PomB、FliGの発現・精制:様々な発現系・精製系の立ち上げを試み、純度の高い標品を得た。これによりPomBの部分結晶構造を明らかにした[Mol.Microbiol.2009]
2) PomA-FliG間の定量的相互作用解析:PomA-FliGの化学量論比・解離定数を求める定量的相互作用系を確立を試みた。溶液NMR法を用いた解析から、1)の成果による^<15>Nラベル化試料の調製・相互作用に伴う信号消失から、結合パラメーターを算出した。
3)チャネル複合体(PomA/PomB)の構造変化・イオン透過機構:構造変化・イオン透過機構解析は、NMR法とFTIR法の2つに力を入れた。FTIRにおいて、Na^+存在下・非存在下での差スペクトルから、PomBのAsp24がNa^+との結合部位であることを証明した[Biochemistry 2009]。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Spectroscopic studies of a sensory rhodopsin I homologue from the archaeon Haloarcula vallismortis2010

    • Author(s)
      Yagasaki J, Suzuki D, Ihara K, Inoue K, Kikukawa T, Sakai M, Fujii M, Homma M, Kandori H, ^*Sudo Y.
    • Journal Title

      Biochemistry 49

      Pages: 1183-1190

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phototactic and chemotactic signal transduction by transmembrane receptors and transducers in microorganisms [Review]2010

    • Author(s)
      Suzuki D, Irieda H, Homma M, Kawaqishi I, ^*Sudo Y.
    • Journal Title

      Sensors 10

      Pages: 4010-4039

  • [Journal Article] ロドプシン研究はどこへ行くのか?2010

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Journal Title

      生物物理学会誌・特集「日本発の生物物理学」 (未定)(印刷中)

  • [Journal Article] Interaction between Na^+ ion and carboxylates of the PomA-PomB stator unit studied by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      Sudo Y, Kitade Y, Furutani Y, Kojima M, Kojima S, Homma M, ^*Kandori H.
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 11699-11705

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a signaling complex composed of sensory rhodopsin I and its cognate transducer protein from the eubacterium Salinibacter ruber2009

    • Author(s)
      ^*Sudo Y, Okada A, Suzuki D, Inoue K, Irieda H, Sakai M, Fujii M, Furutani Y, Kandori H, Homma M.
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 10136-10145

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stator assembly and activation mechanism of the flagellar motor by the periplasmic region of MotB2009

    • Author(s)
      Kojima S, ^*Imada K, Sakuma M, Sudo Y, Kojima C, Minamino T, ^*Homma M, ^*Namba K.
    • Journal Title

      Mol.Microbiol. 73

      Pages: 710-718

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of chloride ion binding on the photochemical properties of salinibacter sensory rhodopsin I2009

    • Author(s)
      Suzuki D, Furutani Y, Inoue K, Kikukawa T, Sakai M, Fujii M, Kandori H, Homma M, ^*Sudo Y.
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 392

      Pages: 48-62

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細菌が緑色を感じる仕組み-色素タンパク質の新しい色決定機構-2009

    • Author(s)
      須藤雄気
    • Journal Title

      名大トピックス 198

      Pages: 12-13

  • [Presentation] 細菌の緑色光受容レセプター、センサリーロドプシンIの光エネルギー変換・情報伝達メカニズムの解析2009

    • Author(s)
      須藤雄気、本間道夫
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会 第35回研究会
    • Place of Presentation
      北海道旭川市
    • Year and Date
      2009-12-19
  • [Presentation] Assignment of the essential Na+ binding of a stator unit for torque generation of bacterial flagellar motor by ATR-FTIR spectroscopy2009

    • Author(s)
      Sudo Y, Kitade Y, Furutani Y, Kojima M, Kojima S, Homma M, Kandori H.
    • Organizer
      The 47th annual meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      徳島県徳島市
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] 細菌型・緑色光認識レセプターの色認識と構造変化2009

    • Author(s)
      須藤雄気、本間道夫
    • Organizer
      第15回 光生物学協会 年会
    • Place of Presentation
      愛知県岡崎市
    • Year and Date
      2009-08-19
  • [Remarks]

    • URL

      http://kenpro.mynu.jp:8001/Profiles/0054/0005480/profile.html

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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