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2010 Fiscal Year Annual Research Report

微量試料からの高効率クロマチンプルダウン法の開発

Research Project

Project/Area Number 21770251
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

栗本 一基  京都大学, 医学研究科, 助教 (20415152)

KeywordsChIP / エピジェネティクス / 転写制御因子 / Blimp1 / 免疫沈降
Research Abstract

本年度は前年度に引き続きノックンマウスの作成と、その検証を行った。Blimp1のlocusにタグをコードするDNAを挿入し(EGFPおよびAvitag)、タグ付きBlimp1を発現するようにデザインしたES細胞(前年度作出)をマウス初期胚に移植しキメラマウスを作成した(理化学研究所動物資源開発室との共同研究)。これらキメラマウスよりヘテロ、ホモマウスを順次作成した。Blimp1は、その遺伝子が欠失すると胚性致死となる重要な転写因子であるが、タグ付きBlimp1のホモマウスは一見して健常であり、かつ正常な生殖器官と繁殖能力を保持しており、Blimp1の機能が付加したタグによって損なわれていないことが判明した。また始原生殖細胞におけるBlimp1の発現が正常であるか否かを免疫染色により検証した。その結果、Blimp1が発現する全ての発生ステージにおいてタグ付きBlimp1は核に局在しており、その発現は既知の知見と一致した。さらにWestern Blotting解析により始原生殖細胞(発生12.5日)を解析し、付加したEGFPが分解を受けることなくタグ付きBlimp1タンパク質として合成されていることを確認した(Avitagについても検証中)。以上の解析から、タグ付きBlimp1について、その発現、局在、タグ付加、機能すべてにおいて、当初の計画通りのノックインマウスを作出することができたと結論付けられる。このマウスはChIPのみならずBlimp1のあらゆる生化学的解析に有用であると考えられる。また、Oct4-Linker-Avitagを用いたChIPおよびChIP DNA増幅実験から、10^4~10^5個のES細胞から転写因子Oct4のChIP解析が可能であるという一次的な解析結果を得た。ChIPに用いるビーズに対する非特異的吸着の最小化、DNA増幅に用いるべきキャリアの選定は完了しつつあると考えられる。

  • Research Products

    (5 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] TDRD5 is required for retrotransposon silencing, chromatoid body assembly, and spermiogenesis in mice2011

    • Author(s)
      Yabuta, Y Ohta, H.Abe, T., Kurimoto, K.Chuma, S, Saitou, M.
    • Journal Title

      J Cell Biol

      Volume: 192 Pages: 781-95

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A global single-cell cDNA amplification method for quantitative microarray analysis2011

    • Author(s)
      Kurimoto, K., Saitou, M.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 687 Pages: 91-111

  • [Journal Article] Single-cell cDNA microarray profiling of complex biological processes of differentiation2010

    • Author(s)
      Kurimoto, K., Saitou, M.
    • Journal Title

      Curr Opin Genet Dev

      Volume: 20 Pages: 470-477

  • [Presentation] Global transcription profiling of complex biological processes of cellular differentiation at the single-cell resolution2010

    • Author(s)
      Kurimoto, K., Saitou, M.
    • Organizer
      Pacifichem 2010, Recent Advances in Bioanalysis : Ultra-Small Volumes, Global Metabolite Profiling and Single Cells (#56)[4A]
    • Place of Presentation
      Room 305A, Convention Center, Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2010-12-19
  • [Book] 新遺伝子工学ハンドブック(改訂第5版)2010

    • Author(s)
      栗本一基、斎藤通紀
    • Total Pages
      34-41
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2012-07-19  

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