• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

水-イオン流束比から解析するイオンチャネルのイオン選択的透過機構

Research Project

Project/Area Number 21790198
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

岩本 真幸  福井大学, 医学部, 助教 (40452122)

Keywords生体膜 / チャネル / 透過
Research Abstract

1.イオン透過様式の変化を流動電位から解析
KcsAカリウムイオンチャネルのイオン透過様式が透過イオン種やその濃度によって変化することを、流動電位の解析から得られる水-イオン流束比から明らかにした。カリウムイオン200mM存在下ではチャネル内を等モル数の水分子を伴ってカリウムイオンが透過するのに対し、同濃度のルビジウムイオンが透過する場合はモル比で2倍量の水分子を伴うことが分かった。またイオン濃度の低下とともに伴って透過する水が増加することがわかり、20mMではカリウムイオンに対するモル比で1.8倍量、3mMでは2.2倍量の水分子が同時に透過することを明らかにした。カリウムチャネル結晶構造中のイオンや水分子がイオン濃度によって変化する報告はあるが、低イオン濃度ではイオンを透過させない構造の結晶しか得られず、その構造を基に透過の問題を扱うことはできなかった。本研究結果はイオン透過構造をとっているチャネルのダイナミックなイオン透過様式の変化を捉えた直接的な証拠である。
2.ダイナミックなイオン透過モデルの構築
イオン透過をいくつかのステップに分け、各状態間の遷移をダイヤグラムと速度定数で示したものがイオンチャネルにおける従来の透過モデルである。イオン透過における水-イオン流束比という新しい情報が得られたことから、サイクルフラックスという概念を導入してダイナミックで直観的にわかりやすいイオン透過モデルの構築を試みた。新しい透過モデルでは実験結果を基にダイヤグラム上の各ルートにそれぞれ固有の水-イオン流束比が付与され、溶液条件ごとに使用するルートが変化していく様子を視覚的にシミュレーションすることができた。

  • Research Products

    (6 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Cycle flux algebra for ion and water flux through the KcsA channel single-filepore links microscopic trajectories and macroscopic observables2011

    • Author(s)
      S.Oiki, et al.
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 6 Pages: e16578

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A cytotoxic peptide from a marine sponge exhibits ion channel activity through vectorial-insertion into the membrane2010

    • Author(s)
      M.Iwamoto, et al.
    • Journal Title

      FEBS Lett.

      Volume: 584 Pages: 3995-3999

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A mesoscopic approach to understanding the mechanisms underlying the ion permeation on the discrete-state diagram2010

    • Author(s)
      S.Oiki, et al.
    • Journal Title

      J.Gen.Physiol.

      Volume: 136 Pages: 363-365

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 新奇βヘリックス型ペプチド・ポリセオナミドBのイオンチャネル活性2010

    • Author(s)
      岩本真幸
    • Organizer
      次世代スーパーコンピュータプロジェクト ナノ分野グランドチャレンジ研究開発ナノ統合拠点第20回連続研究会 イオンチャネルNo.2
    • Place of Presentation
      福井
    • Year and Date
      2010-12-02
  • [Presentation] 新奇異常ペプチドの一方向膜挿入による一価陽イオン選択性ポアの形成2010

    • Author(s)
      岩本真幸, 清水啓史, 村松郁延, 松永茂樹, 老木成稔
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] 海綿由来細胞毒性ペプチドポリセオナミドBのイオンチャネル活性および細胞膜挿入機構2010

    • Author(s)
      岩本真幸, 清水啓史, 村松郁延, 松永茂樹, 老木成稔
    • Organizer
      第87回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      盛岡
    • Year and Date
      2010-05-20

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi