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2009 Fiscal Year Annual Research Report

モデル植物を用いたアブラナ科自家不和合性の分子遺伝学的解析

Research Project

Project/Area Number 21880022
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)

Research InstitutionMie University

Principal Investigator

諏訪部 圭太  Mie University, 大学院・生物資源学研究科, 准教授 (50451612)

Keywordsアブラナ科 / 自家不和合性 / 花粉-柱頭認識反応 / シロイヌナズナ / モデル植物 / 遺伝地図 / 花粉因子 / 柱頭因子
Research Abstract

自家不和合性を有するシロイヌナズナ近縁種Arabidopsis halleriより、シロイヌナズナと同じ自家不和合性遺伝子型を有する系統を選抜し、自家不和合性雄性認識因子SP11について単離・塩基配列比較を行った。その結果、コード領域における相同性は99.6%と非常に高く、両種間で相同なSP11を有することを明らかにした。シロイヌナズナSP11においては第2エキソン内にタンパク質翻訳を妨げる逆位が推定されているが、A.halleriにおいては翻訳を妨げるような変異は存在しなかった。次に遺伝子発現領域(プロモーター)について比較するために、シロイヌナズナの塩基配列情報を基に設計した数種プライマーを用いてPCRを行った。シロイヌナズナにおいては推定通りのDNA断片が増幅されるものの、A.halleriからはSP11プロモーターの増幅は見られなかった。これは両種のSP11プロモーターの塩基配列は大きく異なっていることを示唆している。以上より、両種間のSP11には、第2エキソンの逆位の有無とプロモーター配列に違いがあり、これらが自家不和合性機構の維持あるいは崩壊の原因の1つであると考えられた。そこで、正常に機能するSP11とそのプロモーターを獲得するために、A.halleriよりゲノムライブラリーを作成しスクリーニングを行った。数種のゲノムクローンを獲得し、これらクローンの塩基配列を解読中である。
現在までに同定されているアブラナ科自家不和合性関連因子(SP11・SRK・MLPK・ARC1・THL)のゲノム上の存在位置を遺伝学的に同定した。近縁アブラナ属植物種との将来的なクロストークを見据え、研究の先行するアブラナ属モデル種Brassica rapaの国際共通遺伝地図へのマッピングにより、前述の因子がそれぞれ別々の連鎖群(染色体)に存在することを明らかにした。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (11 results)

  • [Journal Article] Novel self-compatible lines of Brassica rapa L. isolated from the Japanese bulk-populations2010

    • Author(s)
      Isokawa, et al.
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      金子芙美, ら
    • Journal Title

      温度と生命システムの相関学(東海大学出版会)

      Pages: 176-191

  • [Presentation] イネの遺伝子発現ネットワーク構築2010

    • Author(s)
      浜田, ら
    • Organizer
      日本育種学会第117会講演会
    • Place of Presentation
      京都大学 (京都府)
    • Year and Date
      20100326-20100327
  • [Presentation] シロイヌナズナの糖代謝における UGPase の役割2010

    • Author(s)
      須藤, ら
    • Organizer
      日本植物生理学会第51回年会
    • Place of Presentation
      熊本大学 (熊本県)
    • Year and Date
      20100318-20100321
  • [Presentation] Evolution of breeding systems in Arabidopsis relatives2010

    • Author(s)
      Tsuchimatsu, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] A comprehensive analysis of small RNAs in rice male reproductive organs2010

    • Author(s)
      Fujioka, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] The UGPases are important players in Arabidopsis thaliana2010

    • Author(s)
      須藤, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] Morphological and molecular basis of low temperature tolerance in rice anther development2010

    • Author(s)
      小田, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] Novel self-compatible lines of Brassica rapa L isolated from the Japanese bulk-populations2010

    • Author(s)
      Osaka, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] Database construction of gene expression networks in rice2010

    • Author(s)
      浜田, et al.
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction
    • Place of Presentation
      Nara, Japan
    • Year and Date
      20100311-20100312
  • [Presentation] Gene expression network construction in rice2010

    • Author(s)
      浜田, et al.
    • Organizer
      Plant and Animal Genome Conference XVIII
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      20100109-20100113
  • [Presentation] イネの低温ストレス耐性に関わる遺伝子群の網羅的解析2009

    • Author(s)
      小田, ら
    • Organizer
      日本分子生物学会第32回年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (神奈川県)
    • Year and Date
      20091209-20091212
  • [Presentation] Genetic characterization of self-compatible mutants in Brassica rapa2009

    • Author(s)
      Suwabe, et al.
    • Organizer
      Plant Biology 2009
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      20090718-20090722

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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