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2010 Fiscal Year Annual Research Report

阻害剤の作用機構研究を基盤とするミトコンドリア複合体-Iの動態解明

Research Project

Project/Area Number 21880024
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村井 正俊  京都大学, 農学研究科, 助教 (80543925)

Keywordsミトコンドリア / 複合体-I / アセトゲニン / キナゾリン / 光親和性標識 / ユビキノン
Research Abstract

ミトコンドリアNADH-ユビキノン酸化還元酵素(複合体-I)は、細胞のエネルギー代謝において重要な役割を担う呼吸鎖酵素である。本研究は複合体-Iにおける阻害剤/ユビキノン結合部位の同定と相互作用の解析を行うことを研究の目標とした。
前年度に引き続き、好気性酵母(Y.lipolitica)に由来する精製複合体-Iを用いて、光親和性キナゾリン型プローブ([^<125>I]AzQ)による光親和性標識実験を行った。本プローブは49kDaサブユニットを特異的に標識したものの,それ以降の解析に十分な標識量を達成することが出来なかった。
そこで、実験材料をウシ心筋由来の単離複合体-Iに変更したところ、本酵素は一定量のリン脂質存在下でAzQに対して高い感受性を示した。49kDaおよびND1サブユニットに対する[^<125>I]AzQの標識反応の特異性も、リン脂質存在下で顕著に認められた。これらの結果は、単離酵素の構造がリン脂質によって保持・安定化されていることを示すものである。続いて、[^<125>I]AzQによって標識された49kDaおよびND1サブユニットを単離し、プロテアーゼ消化によるマッピングを行った。
その結果49kDaサブユニットはN末端領域に(Asp41-Arg63)、ND1サブユニットはマトリックス側第3ループ領域(Asp199-Lys262)に、[^<125>I]AzQが結合していることが明らかになった。当研究室の先行研究から、本ループ領域は他の阻害剤の結合部位でもあることがわかっている。このことから、本ループ領域が阻害剤結合部位を構成すると同時に、膜ドメイン(ND1)と親水性ドメイン(49kDa)との接触点となって両ドメインの相互作用において重要な機能を果たしていることが示唆された。本成果は現在、論文発表の準備中である。

  • Research Products

    (13 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 呼吸鎖酵素最後の秘境-複合体-I(NADH-ユビキノン酸化還元酵素)の構造と機能2011

    • Author(s)
      村井正俊、三芳秀人
    • Journal Title

      化学

      Volume: 66 Pages: 72-73

  • [Journal Article] Exploring the Binding Site of Δlac-Acetogenin in Bovine Heart Mitochondrial NADH-Ubiquinone Oxidoreductase2010

    • Author(s)
      Kakutani, N., Murai, M., Sakiyama, N., Miyoshi, H.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 49 Pages: 4794-4803

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Complementation of coenzyme Q-deficient yeast by coenzyme Q analogues requires the isoprenoid side chain2010

    • Author(s)
      James, A.M., Cocheme H.M, Murai, M., Miyoshi, H., Murphy, M.P.
    • Journal Title

      FEBS.Journal

      Volume: 277 Pages: 2067-2082

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定2011

    • Author(s)
      村井正俊、崎山直人、白石悠祐、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)(東日本大震災により中止)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 光親和性ユビキノンプローブの合成と標的タンパク質の解析2011

    • Author(s)
      土生沙綾子、横山実、村井正俊、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都府京都市)(東日本大震災により中止)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I)2011

    • Author(s)
      村井正俊、崎山直人、白石悠祐、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第36回大会
    • Place of Presentation
      玉川大学(東京都町田市)(東日本大震災により中止)
    • Year and Date
      2011-03-18
  • [Presentation] ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(II)2011

    • Author(s)
      崎山直人、村井正俊、白石悠祐、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第36回大会
    • Place of Presentation
      玉川大学(東京都町田市)(東日本大震災により中止)
    • Year and Date
      2011-03-18
  • [Presentation] 機能性ユビキノンプルーブの合成とユビキノン結合性タンパク質の探索2011

    • Author(s)
      横山実、土生沙綾子、村井正俊、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部例会(第468回講演会)
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府京都市)
    • Year and Date
      2011-02-05
  • [Presentation] ミトコンドリア複合体-I阻害剤Δlac-アセトゲニンの結合部位の解明2010

    • Author(s)
      村井正俊、角谷信至、崎山直人、安部真人、三芳秀人
    • Organizer
      第36回日本生体エネルギー研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] 酵母の非プロトン輸送性NADH-ユビキノン酸化還元酵素(Ndi1)のユビキノン結合部位の解明2010

    • Author(s)
      真下佑子、村井正俊、山下哲生、三芳秀人
    • Organizer
      第36回日本生体エネルギー研究会
    • Place of Presentation
      大阪大学(大阪府吹田市)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Characterization of the binding site of Δlac-acetogenin in bovine mitochondrial complex I by photoaffinity labeling2010

    • Author(s)
      Murai, M., Kakutani, N., Sakiyama, N., Miyoshi, H.
    • Organizer
      16^<th>European Bioenergetics Conference (EBEC2010)
    • Place of Presentation
      Warsaw University(Poland)
    • Year and Date
      2010-07-17
  • [Presentation] ミトコンドリア複合体-I阻害剤Δlac-アセトゲニンの結合部位の同定2010

    • Author(s)
      村井正俊、角谷信至、崎山直人、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第35回大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2010-05-29
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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