• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト胎児用超高分解能MRIの開発と標準胎児脳高精細アトラスの構築

Research Project

Project/Area Number 21H01333
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

寺田 康彦  筑波大学, 数理物質系, 准教授 (20400640)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 仲村 高志  国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学研究センター, 専任技師 (60321791)
山田 重人  京都大学, 医学研究科, 教授 (80432384)
山口 雅之  国立研究開発法人国立がん研究センター, 先端医療開発センター, ユニット長 (90450577)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords超高分解能MRI / ヒト胚子・胎児 / 脳の神経発達機構
Outline of Annual Research Achievements

脳は複雑な構造と機能をもち,その神経発達のメカニズムには未解明な部分が多い.特に妊娠初期の胚子期,胎児期では,主要な器官の原基が次々と急速に形成され,異常発生の確率も高まるため,その神経発達機構を解明することがきわめて重要である.形態観察には,非侵襲的に3次元的な観察が可能な,磁気共鳴画像(MRI)装置が主に用いられている.これまで1204体の3次元MRI画像データベースが作成された.しかし,このMRIデータベースの画像は空間分解能が低く,10μm程度の小さな構造が描出されず,構造解析に必要な解剖学的特徴点を見つけることが困難であった.そのため,脳内部の中枢神経系の解剖学的特徴点や超微細構造が,いつどこで出現し,どのように成長するのか,それらが発生学上どの程度重要なのかということがわかっていなかった.そこで本研究では,世界最高レベルの空間分解能(10μm)をもつMRIを開発し,先天異常標本解析センターに所蔵される貴重なヒト胎児標本を用いて,成長段階ごとの三次元構造を観察することを目的としている.
本年度は,上記の目的を達成するため、世界最高レベルの超高精細MRIの開発を行った。9.4T磁場用の高感度の高周波プローブを新たに開発し、撮像シーケンスの開発やスパースモデリングとの複合化により、撮像視野1cmで空間分解能10μmを達成した。今回は、撮像試験試料として、比較的若い成長段階のカーネギーステージ16のヒト胚子標本を用いた。今後は、後の成長段階の大きな試料を対象とした高周波プローブの開発や撮像シーケンスの最適化を行う。さらに様々な成長段階の試料の横断的な撮像を行う。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は、世界最高レベルの超高精細MRIの開発を行った。具体的には、9.4Tの磁場を使って撮像視野1㎝で空間分解能10μmを達成した。そのため、試料サイズにフィットしたソレノイド型高周波プローブと、最大48 G/cmの磁場勾配をもつ勾配磁場コイルを開発した。また、脳の各組織と周辺組織のコントラスト対雑音比が最大となるよう、撮像方法や条件を最適化した。長時間にわたる撮像において安定に動作するように、トランシーバーとソフトウェアの改良を行った。また、短時間に低雑音なデータを取得するため、スパースモデリング技術の一つである圧縮センシングデータサンプリングと再構成を適用し、再構成パラメタやサンプリングパターンの最適化を行った。これらの結果、1㎝大のヒト胚子標本の10μm分解能での3次元撮像を実証した。これとは別に、2cm程度の標本を目標に高精細MRIの開発に着手した。
また、より高い信号対雑音比が期待される11.7Tのシステムに対しては、高周波プローブの開発途中であり、9.4Tのシステムと同等のコントラスト対雑音比が得られることを確認した。現在、雑音対策の強化を行っている。

Strategy for Future Research Activity

①世界最高レベルの超高精細MRIの開発
昨年度に引き続き、高周波プローブの高感度化技術の開発を行う。9.4Tと11.7Tの磁場を使い、高感度のボリュームコイルであるソレノイド型高周波コイルの開発とスパースモデリング技術を用いて、2cmサイズの標本に対して、10~20μmの空間分解能での撮像テストを行う。圧縮センシング再構成/超分解/雑音除去を、深層学習を使って高性能化する技術を開発する。
② 数理的構造解析と胎児標準脳のアトラス構築
発達段階ごとに1体ずつ標本を撮像する。切片試料の光学顕微鏡画像と撮像データを比較しながら、解剖学的特徴点(神経核群、神経管、神経節、軸索、脳神経(I~XII)、大脳基底核、錐体路を代表とする神経線維など)の抽出を行い、必要な解剖学的情報が描出されているかを評価する。

  • Research Products

    (24 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (22 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Development of an Add-on 23Na-MRI Radiofrequency Platform for a 1H-MRI System Using a Crossband Repeater: Proof-of-concept2023

    • Author(s)
      Michiru Kajiwara, Tomoyuki Haishi, Dwi Prananto, Susumu Sasaki, Ryohei Kaseda, Ichiei Narita, Yasuhiko Terada
    • Journal Title

      Magn Reson Med Sci

      Volume: 22 Pages: 103-115

    • DOI

      10.2463/mrms.tn.2021-0094

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bloch Simulation of a Three-point Dixon Experiment Using a Four-dimensional Numerical Phantom2022

    • Author(s)
      Kose Ryoichi、Kose Katsumi、Terada Yasuhiko
    • Journal Title

      Magnetic Resonance in Medical Sciences

      Volume: 21 Pages: 649~654

    • DOI

      10.2463/mrms.tn.2021-0054

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Low-Field Versus High-Field Hardware: Magnets, Coils & Spectrometers.2021

    • Author(s)
      Yasuhiko Terada
    • Organizer
      ISMRM & SMRT Annual Meeting & Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of a multi-turn double helix dipole coil for magnetic resonance microimaging of chemically-fixed human embryos at 7T.2021

    • Author(s)
      Yuto Murakami and Yasuhiko Terada
    • Organizer
      ISMRM & SMRT Annual Meeting & Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multi-contrast CS reconstruction using data-driven and model-based deep neural networks.2021

    • Author(s)
      Tomoki Miyasaka, Satoshi Funayama, Daiki Tamada, Utaroh Motosugi, Hiroyuki Morisaka, Hiroshi Onishi, and Yasuhiko Terada
    • Organizer
      ISMRM & SMRT Annual Meeting & Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of an add-on 23Na MRI platform for an existing 1H MRI scanner using a crossband repeater: Proof-of-concept.2021

    • Author(s)
      Michiru Kajiwara, Tomoyuki Haishi, and Yasuhiko Terada
    • Organizer
      ISMRM & SMRT Annual Meeting & Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A new image clustering method for assessing tumor heterogeneity induced by a drug treatment in DCE-MRI.2021

    • Author(s)
      Kazuyuki Makihara, Kazuya Sakaguchi, Masayuki Yamaguchi, Ken Ito, Yusaku Hori, Taro Semba, Yasuhiro Funabashi, Hirofumi Fujii, and Yasuhiko Terada
    • Organizer
      ISMRM & SMRT Annual Meeting & Exhibition
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Improved performance of deep-learning-based super-resolution of clinical brain images improved by decreasing reduction factor2021

    • Author(s)
      Erika Takahashi, Tomoki Miyasaka, Satoshi Funayama, Daiki Tamada, Utaroh Motosugi, Hiroyuki Morisaka, Hiroshi Onishi, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] MR microimaging of marsupial embryo and neonate specimens using a 4.7T vertical superconducting magnet2021

    • Author(s)
      Tomoki Miyasaka, Erika Takahashi, Sayaka Tojima, Shigehito Yamada, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Distortion correction of diffusion-weighted image by FSL learning model using 3D U-net2021

    • Author(s)
      Tsuyoshi Ueyama, Keisuke Yoshida, Yuichi Suzuki, Hideyuki Iwanaga, Osamu Abe, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Image restoration for spiral imaging using dAUTOMAP and GIRF2021

    • Author(s)
      Keisuke Yoshida, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Bloch simulation of the 3-point Dixon method on biological systems2021

    • Author(s)
      Katsumi Kose, Ryoichi Kose, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Evaluation of drug activity of a novel anticancer drug E7130 in different human breast cancer models by DCE-MRI clustering analysis2021

    • Author(s)
      Kazuyuki Makihara, Kazuya Sakaguchi, Masayuki Yamaguchi, Ken Ito, Yusaku Hori, Taro Semba, Yasuhiro Funahashi, Hirofumi Fujii, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Development of double helix dipole (DHD) coils for 7T MR microscopy2021

    • Author(s)
      Kazuki Kunieda, Yuto Murakami, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Multi-coil CS reconstruction using deep learning under parallel imaging constraints2021

    • Author(s)
      Tomoki Miyasaka, Satoshi Funayama, Daiki Tamada, Utaroh Motosugi, Hiroyuki Morisaka, Hiroshi Onishi, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Initial study of DTI of a chemically fixed human fetus2021

    • Author(s)
      Mari Minami, Shigehito Yamada, Yasuhiko Terada
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] 9.4T縦型超電導磁石を用いたヒト胚子化学固定標本の高分解能イメージング2021

    • Author(s)
      牧原和幸,寺田康彦
    • Organizer
      第25回NMRマイクロイメージング研究会
  • [Presentation] MR マイクロスコピー用 double helix dipole 型 RF コイルの開発2021

    • Author(s)
      國枝和輝,村上雄斗,寺田康彦
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] 教師なし深層学習を用いた拡散強調画像における 3 次元歪み補正2021

    • Author(s)
      吉田圭佑,上山毅, 寺田康彦
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] Deep learning を用いたマルチコイル compressed sensing 再構成2021

    • Author(s)
      宮坂知樹,舟山慧,玉田大輝,本杉宇太郎,森阪裕之,大西洋,寺田康彦
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] QRAPMASTER 法の実装と 磁化移動 効果の影響評価2021

    • Author(s)
      巨瀬勝美, 巨瀬亮一, 寺田康彦
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] 温度可変 MRI による植物および食品サンプルの低温撮像2021

    • Author(s)
      宮坂知樹, 髙川直也, 石井寛崇, 石川雅也, 寺田康彦
    • Organizer
      第49回日本磁気共鳴医学会大会
  • [Presentation] 花芽凍結観察用温度可変MRマイクロイメージングシステムの開発2021

    • Author(s)
      宮坂知樹,髙川直也,石川雅也,寺田康彦
    • Organizer
      第66 回低温生物工学会大会
  • [Presentation] 深層学習を用いた頭部MRI検査の高速化の試み2021

    • Author(s)
      寺田康彦
    • Organizer
      JSMRMスタディG「生成型学習等を活用した定量的MRイメージング」ニューイヤーセミナー(1)
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi