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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Holographic optical coherence microscope for high-penetration and label free imaging of intracellular activities

Research Project

Project/Area Number 21H01836
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

安野 嘉晃  筑波大学, 医学医療系, 教授 (10344871)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松阪 諭  筑波大学, 医学医療系, 教授 (00372665)
巻田 修一  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (50533345)
三浦 雅博  東京医科大学, 医学部, 教授 (60199958)
福田 慎一  筑波大学, 医学医療系, 准教授 (80643246)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords光コヒーレンストモグラフィー / OCT顕微鏡 / label-free imaging / in vitro model
Outline of Annual Research Achievements

1) 定量的組織ダイナミクスイメージングアルゴリズムの開発:本研究では LIVと呼ばれるアルゴリズムを用いて光干渉断層計(OCT)信号のゆらぎを定量化することで代謝イメージングを行ってきた。しかし、LIVは計測条件(計測時間幅)に大きく依存し、特定の活動に対する得意性を持たない。この問題を解決するため、Variable time-window LIV (VLIV)と呼ぶアルゴリズムを開発し、それによる生体計測に成功した。
具体的には、VLIV 法を用いて腫瘍スフェロイドと肺胞オルガノイドのイメージング・評価を行った。前者では、スフェロイド中心部で壊死過程を示す早いダイナミクスが観察された。また、後者では、肺胞上皮における不均一なダイナミクスが観察された。これは、肺胞上皮細胞の異常リモデリングを表しているものと考えられる。
2) 腫瘍スフェロイドのイメージング: 人乳がん由来のスフェロイドに3種類の抗癌剤を作用させイメージングを行った。それぞれの抗がん剤でスフェロイドの形態とダイナミクスに異なった変化が見られた。特に、Tamoxifen 投与では、低濃度では対照スフェロイドと比べて変化が見られず、高濃度ではスフェロイドの体積縮小が確認された。これは、Tamoxifen の機序が低・高濃度で異なること、また、低濃度での作用に欠かせないエストロゲンがスフェロイド中に存在しないことが理由であると考えられる。
3) 肺胞オルガノイドのイメージング: ヒトiPS 細胞から培養された肺胞オルガノイドの擬似経時的なイメージングを行った。一部のオルガノイドで肺胞上皮が肥厚化し、その部位にまだら状のLIV パターンが見られ、これは肺胞上皮の異常リモデルングによるものであると結論付けられた。( https://doi.org/10.1364/BOE.488097 )

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の予定では、2022年から2023年にスフェロイドを用いた translational study を行う予定であった。実際には、スフェロイドに加えて肺胞オルガノイドを用いたスタディーも行い、また、定量的なダイナミクス計測法の基本も完成した。以上より、本課題は、当初の計画以上に進展している、と考えられる。

Strategy for Future Research Activity

技術面においては、上記VLIV法の高速化(理論レベルのアルゴリズム単純化と、実装レベルのソースコード最適化とGPUの利用)を行い、これによって、VLIVを用いた translational study を実現する。
また、LIV、VLIV信号と生体内での微小な動き(intracellular motility)関係を解明する。そのために、まず、生体内の動きを分類し、数理モデル化する。次に、そのモデルとOCTのイメージング理論から疑似ダイナミックOCT信号(シミュレーションOCT信号)を生成する。
最後に、そのシミュレーションされたダイナミックOCT信号と、その生成の際の組織特性パラメターをセットにして機械学習を行い、ダイナミックOCT信号から組織のダイナミクスに関連したパラメターの決定を実現する。

  • Research Products

    (21 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Damietta University(エジプト)

    • Country Name
      EGYPT
    • Counterpart Institution
      Damietta University
  • [Int'l Joint Research] King Mongkut's Institute of Technology(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      King Mongkut's Institute of Technology
  • [Int'l Joint Research] Medical University of Vienna(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      Medical University of Vienna
  • [Int'l Joint Research] National Taiwan University/Chang Gung University(その他の国・地域)

    • Country Name
      その他の国・地域
    • Counterpart Institution
      National Taiwan University/Chang Gung University
  • [Journal Article] Dynamic OCT to visualize development of cotyledon vessels in sprouts2023

    • Author(s)
      Lim Yiheng、Kojima Shumpei、Mukherjee Pradipta、Abd El-Sadek Ibrahim、Makita Shuichi、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Proc. SPIE

      Volume: 12391 Pages: 123910O

    • DOI

      10.1117/12.2648801

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] B-scan-wise multi-focus averaging method to suppress multiple scattering signal2023

    • Author(s)
      Zhu Yiqiang、Zhu Lida、Makita Shuichi、Lim Yiheng、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Proc. SPIE

      Volume: 12367 Pages: 1236713

    • DOI

      10.1117/12.2652555

  • [Journal Article] Multi-Contrast Jones-Matrix Optical Coherence Tomography?The Concept, Principle, Implementation, and Applications2023

    • Author(s)
      Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics

      Volume: 29 Pages: 1~18

    • DOI

      10.1109/JSTQE.2023.3248148

  • [Journal Article] Computational refocusing of Jones matrix polarization-sensitive optical coherence tomography and investigation of defocus-induced polarization artifacts2022

    • Author(s)
      Zhu Lida、Makita Shuichi、Oida Daisuke、Miyazawa Arata、Oikawa Kensuke、Mukherjee Pradipta、Lichtenegger Antonia、Distel Martin、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Biomedical Optics Express

      Volume: 13 Pages: 2975~2975

    • DOI

      10.1364/BOE.454975

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multicontrast investigation of in vivo wildtype zebrafish in three development stages using polarization-sensitive optical coherence tomography2022

    • Author(s)
      Lichtenegger Antonia、Mukherjee Pradipta、Tamaoki Junya、Bian Lixuan、Zhu Lida、El-Sadek Ibrahim Abd、Makita Shuichi、Leskovar Konrad、Kobayashi Makoto、Baumann Bernhard、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Journal of Biomedical Optics

      Volume: 27 Pages: 016001

    • DOI

      10.1117/1.JBO.27.1.016001

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Non-destructive characterization of adult zebrafish models using Jones matrix optical coherence tomography2022

    • Author(s)
      Lichtenegger Antonia、Mukherjee Pradipta、Zhu Lida、Morishita Rion、Tomita Kiriko、Oida Daisuke、Leskovar Konrad、Abd El-Sadek Ibrahim、Makita Shuichi、Kirchberger Stefanie、Distel Martin、Baumann Bernhard、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Biomedical Optics Express

      Volume: 13 Pages: 2202~2202

    • DOI

      10.1364/BOE.455876

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Optical Coherence Tomography Is a Promising Tool for Zebrafish-Based Research?A Review2022

    • Author(s)
      Lichtenegger Antonia、Baumann Bernhard、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Bioengineering

      Volume: 10 Pages: 5~5

    • DOI

      10.3390/bioengineering10010005

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Longitudinal investigation of a xenograft tumor zebrafish model using polarization-sensitive optical coherence tomography2022

    • Author(s)
      Lichtenegger Antonia、Tamaoki Junya、Licandro Roxane、Mori Tomoko、Mukherjee Pradipta、Bian Lixuan、Greutter Lisa、Makita Shuichi、W?hrer Adelheid、Matsusaka Satoshi、Kobayashi Makoto、Baumann Bernhard、Yasuno Yoshiaki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 15381

    • DOI

      10.1038/s41598-022-19483-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Renal tubular structure and metabolism revealed by dynamic optical coherence tomography and OCT angiography2023

    • Author(s)
      Pradipta Mukherjee, Shinichi Fukuda, Donny Lukmanto, Toshiharu Yamashita, Kosuke Okada, Shuichi Makita, Ibrahim G. Abd El-Sadek, Yiheng Lim, Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan)
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dynamic optical coherence tomography for tumorspheroid-based anti-cancer-drug testing2023

    • Author(s)
      Ibrahim G. Abd El-Sadek, Univ. of Tsukuba (Japan), Damietta Univ. (Egypt); Rion Morishita, Tomoko Mori, Shuichi Makita, Pradipta Mukherjee, Satoshi Matsusaka, Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan)
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Dynamic OCT to visualize development of cotyledon vessels in sprouts2023

    • Author(s)
      Yiheng Lim, Shumpei Kojima, Pradipta Mukherjee, Univ. of Tsukuba (Japan); Ibrahim Abd El-Sadek, Univ. of Tsukuba (Japan), Damietta Univ. (Egypt); Shuichi Makita, Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan)
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] "Multiple scattering suppression by multi-focus averaging in Jones-matrix optical coherence tomography"2023

    • Author(s)
      Lida Zhu, Shuichi Makita, Yiheng Lim, Junya Tamaoki, Yiqiang Zhu, Makoto Kobayashi, Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Improving the estimation accuracy of the scatterer density estimation by accounting for the spatial property of the noise in optical coherence tomography2023

    • Author(s)
      Thitiya Seesan, Pradipta Mukherjee, Ibrahim G. Abd ElSadek, Yiheng Lim, Shuichi Makita, Univ. of Tsukuba (Japan); Prathan Buranasiri, King Mongkut’s Institute of Technology Ladkrabang (Thailand); Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan)
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Volumetric differential contrast imaging by computationally augmented optical coherence tomography microscopy2023

    • Author(s)
      Kiriko Tomita, Shuichi Makita, Naoki Fukutake, Rion Morishita,Ibrahim Abd El-Sadek, Pradipta Mukherjee, Antonia Lichtengger,Junya Tamaoki, Lixuan Bian, Makoto Kobayashi, Tomoko Mori, Satoshi Matsusaka, Yoshiaki Yasuno
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Synthesizing retinal degree of polarization uniformity from OCT with OCT-angiography by deep learning2023

    • Author(s)
      Yusong Liu, Shuichi Makita, Univ. of Tsukuba (Japan); Masahiro Miura, Takuya Iwasaki, Tokyo Medical Univ. (Japan); Shinnosuke Azuma, Toshihiro Mino, Tatsuo Yamaguchi, Topcon Technohouse Corp. (Japan); Yoshiaki Yasuno, Univ. of Tsukuba (Japan)
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Non-invasive and label-free zebrafish investigations using polarization-sensitive optical coherence tomography2023

    • Author(s)
      Antonia Lichtenegger,Lida Zhu, Tomoko Mori, Rion Morishita, Lixuan Bian, Ibrahim Abd El-Sadek, Shuichi Makita, Satoshi Matsusaka,Makoto Kobayashi,Yoshiaki Yasuno
    • Organizer
      Photonics West2023
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      https://cog-news.blogspot.com/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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