2021 Fiscal Year Annual Research Report
ゲノムワイド関連解析を用いたマツノザイセンチュウの病原性因子の探索
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21H02249
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| Research Institution | Forest Research and Management Organization |
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Principal Investigator |
秋庭 満輝 国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (50353553)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
菊地 泰生 宮崎大学, 医学部, 准教授 (20353659)
新屋 良治 明治大学, 農学部, 専任准教授 (30802798)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | マツノザイセンチュウ / 病原力 / GWAS / マツ材線虫病 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
マツ材線虫病はマツノザイセンチュウを病原体とするマツの伝染病である。世界的に極めて重要な樹木病害であるが、未だにマツノザイセンチュウがマツを枯死させる仕組みについては完全には明らかにされていない。本課題では、日本国内から収集された約200系統の野生型マツノザイセンチュウのゲノム配列情報と病原性に関連する表現型形質のデータを基にゲノムワイド関連解析（GWAS）を実施し、マツノザイセンチュウの病原性に関与する遺伝子群を探索する。
本年度は、マツノザイセンチュウの約200株についてマイクロサテライトマーカーを用いた解析を実施した。そのうちの約100株についてクロマツへの接種試験により病原力を評価するとともに菌糸上での増殖力を調査した。また、これら100株からDNAを抽出して全ゲノムシークエンス解析に供した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
解析予定の約200株のうち、全株でマイクロサテライトマーカーを用いた解析が完了し、半数の約100株で表現型形質の評価と全ゲノムシークエンスが完了したことから、おおむね順調に進んでいるものと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、残りの約100株について本年度と同様に表現型形質の評価と全ゲノムシークエンスを実施する。全ゲノムシークエンスの結果からSNP情報が明らかになる予定であり、最終年度にこれらのデーターを用いてGWAS解析を実施する。
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