• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

回転分子モーターのイオン輸送メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 21H02409
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

村田 武士  千葉大学, 大学院理学研究院, 教授 (80415322)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsV-ATPase / 分子モーター / 構造解析 / イオン輸送 / 分子メカニズム
Outline of Annual Research Achievements

V-ATPaseは、ATPの加水分解エネルギーを回転運動に変換するV1部分と、その回転運動をH+(またはNa+)の濃度勾配エネルギーに変換するVo部分から構成される回転分子モータータンパク質/イオンポンプである。最近我々はクライオ電子顕微鏡を用いて、抗菌剤が結合した腸球菌V-ATPase全複合体の密度マップを得ることに成功した。本研究では、得られた構造・機能解析情報を統合することにより、①本酵素のNa+輸送メカニズム、②抗菌剤によるNa+輸送阻害メカニズム、③Na+輸送とH+輸送の分子メカニズムの違いを解明する。以下に本年度得られた研究成果の概要を記載する。
<1> 腸球菌V-ATPaseの構造解析---昨年度の研究により抗菌剤結合型V-ATPase膜部分の立体構造を分解能2.2Aで決定した。本年度は得られた構造を用いてMDシミュレーションを行い、aサブユニットに存在する細胞外へと続くNa+輸送路を明らかにした。
<2> 腸球菌V-ATPase変異体の機能解析と構造解析---得られた構造情報からNa+輸送に重要と示唆された残基の変異体を作製した。これらの変異体についてATPase活性測定と1分子回転実験を行ない、aサブユニットに存在する細胞内からのNa+輸送路を決定した。
<3> イオン輸送メカニズムの解明---上記で得られた構造・機能解析情報を統合することにより、①本酵素のNa+輸送メカニズム、②抗菌剤によるNa+輸送阻害メカニズム、③Na+輸送とH+輸送の分子メカニズムの違いを明らかにした。これらの成果をまとめた論文を投稿した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Arizona State University/University of Illinois(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Arizona State University/University of Illinois
  • [Int'l Joint Research] University de Lorraine(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      University de Lorraine
  • [Journal Article] Six states of Enterococcus hirae V-type ATPase reveals non-uniform rotor rotation during turnover2023

    • Author(s)
      Burton-Smith Raymond N.、Song Chihong、Ueno Hiroshi、Murata Takeshi、Iino Ryota、Murata Kazuyoshi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 755

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05110-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • Author(s)
      Yasuda Satoshi、Hayashi Tomohiko、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 10 Pages: 1159603

    • DOI

      10.3389/fmolb.2023.1159603

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Discovery of a novel inhibitor for Na+-transporting V-ATPase enables suppression of VRE colonization in mice and reveals high-resolution structure of the Na+ transport pathway2023

    • Author(s)
      Takeshi Murata
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Bioenergetics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Na+-Transporting V-ATPase Inhibitor Suppresses VRE Growth in Mice and Unveils Na+ Pathway Structure2023

    • Author(s)
      Takeshi Murata
    • Organizer
      21th IPR Retreat
    • Invited
  • [Presentation] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

    • Author(s)
      Satoshi Yasuda, Tomohiko Hayashi, Takeshi Murata and Masahiro Kinoshita
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 抗菌組成物及び医薬並びに抗菌方法2024

    • Inventor(s)
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • Industrial Property Rights Holder
      村田武士、阿部晶平、鈴木花野、後藤義幸
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2024/914
    • Overseas

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi