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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Unraveling of mechanisms of functional cluster formation of glycolipids and verification of the hierarchical structure by high-resolution single-molecule imaging

Research Project

Project/Area Number 21H02424
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

鈴木 健一  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (50423059)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsガングリオシド / GPIアンカー型タンパク質 / 1分子観察 / 超解像顕微鏡法 / ラフト
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、高精度1分子・超解像顕微鏡観察技術に基づき、生細胞膜上で糖脂質は糖鎖により、GPIアンカー型タンパク質は細胞外タンパク質により、機能性集合体を誘起し、ラフト脂質がそれを安定化するという概念を検証する。さらに、このような複合体自体を集める大きな膜領域(階層構造)が存在するかを検証する。もし、階層構造がある場合は、その形成機構を明らかにすることを目的としている。今まで、糖脂質ガングリオシド蛍光プローブが開発されていなかったために、生細胞膜上の糖脂質ガングリオシドの動態研究は皆無であった。しかし、我々は8種のガングリオシド蛍光プローブを開発済みであり、これを用いて、上記課題に挑んだ。
今年度、糖脂質の一つであるラクトシルセラミドの光学異性体間のヘテロダイマー寿命は、D体同士、L体同士のホモダイマー寿命よりもずっと短くなることを見出した。さらに全原子分子動力学計算の結果もこれを支持していた。従って、糖鎖の特異的相互作用がラクトシルセラミドのホモダイマーを誘起していることが明らかとなった。
さらに今年度、機能性分子集合体を集める大きな膜ドメイン(階層構造)の有無を検証するために、ラフト分子の2色同時超解像顕微鏡観察を行い、その画像の解析法を開発した。さらに、脂質の脂肪酸同士の膜表裏カップリングにより、大きな膜ドメインが誘起されるかどうかを調べるために、細胞膜内層分子と外層分子の2色同時超解像顕微鏡観察法と解析法も開発した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

GPIアンカー型受容体や糖脂質のホモダイマーの一般性を検証できた。また、ラクトシルセラミドの光学異性体間のヘテロダイマー寿命が、D体同士、L体同士のホモダイマー寿命よりもずっと短いことから、ラクトシルセラミドは特異的な糖鎖間相互作用でホモダイマーを形成することが明らかになった。これは、糖脂質の糖鎖間相互作用が、ホモダイマーを誘起することを確認でき、目標を達成できた。
また、階層構造があるかどうかを検証するための実験系も確立できた。すなわち、上記ラフトマーカー分子を2色同時に超解像顕微鏡観察することにより、分子同士の共局在する領域、つまり階層構造を検出することが可能になった。
また、脂質の脂肪酸同士の膜表裏カップリングの有無を検証する実験系も確立できた。すなわち、膜内層分子と外層分子を2色同時観察し、上記と同様の解析を行うことが可能になった。

Strategy for Future Research Activity

上記のように実験系を確立できたので、今後は、解析してデータを得ていく。
細胞膜外層のラフト分子同士の大きな膜ドメインでの共局在が、タンパク質相互作用によるものか、脂質相互作用だけによるものなのかを明らかにしていく。また、これらの外層分子を集める大きな膜ドメインと細胞膜内層の脂質ドメインとが共局在するかどうかを検証していく。共局在する場合、脂質相互作用だけによるのか、タンパク脂質相互作用も関与するかを明らかにしていく。

  • Research Products

    (15 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Construction of a Reduction‐responsive DNA Microsphere using a Reduction‐cleavable Spacer based on a Nitrobenzene Scaffold2022

    • Author(s)
      Higashi Sayuri L.、Isogami Ayaka、Takahashi Junko、Shibata Aya、Hirosawa Koichiro M.、Suzuki Kenichi G. N.、Sawada Shunsuke、Tsukiji Shinya、Matsuura Kazunori、Ikeda Masato
    • Journal Title

      Chemistry Asian Journal

      Volume: 17 Pages: e202200142

    • DOI

      10.1002/asia.202200142

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Formation of Supramolecular Nanostructures through in Situ Self‐Assembly and Post‐Assembly Modification of a Biocatalytically Constructed Dipeptide Hydrazide2022

    • Author(s)
      Shintani Yuki、Ohtomi Taku、Shibata Aya、Kitamura Yoshiaki、Hirosawa Koichiro M.、Suzuki Kenichi G. N.、Ikeda Masato
    • Journal Title

      Chemistry A European Journal

      Volume: 28 Pages: 202104421

    • DOI

      10.1002/chem.202104421

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional Reconstitution of Dopamine D2 Receptor into a Supported Model Membrane in a Nanometric Confinement2021

    • Author(s)
      Nagai Rurika、Sugimachi Ayane、Tanimoto Yasushi、Suzuki Kenichi G. N.、Hayashi Fumio、Weikert Dorothee、Gmeiner Peter、Kasai Rinshi S.、Morigaki Kenichi
    • Journal Title

      Advanced Biology

      Volume: 5 Pages: 2100636

    • DOI

      10.1002/adbi.202100636

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 1粒子・超解像動画同時観察による細胞外小胞の動態解明2021

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第8回日本細胞外小胞学会
    • Invited
  • [Presentation] 超解像・1分子可視化解析を用いた細胞外小胞の分類と生細胞での細胞外小胞の取り込み機構の解明2021

    • Author(s)
      廣澤幸一朗、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第8回日本細胞外小胞学会
  • [Presentation] 細胞外小胞の標的細胞への結合制御:1粒子解析法による解明2021

    • Author(s)
      磯貝樹、廣澤幸一朗、正彩乃、木塚康彦、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      第8回日本細胞外小胞学会
  • [Presentation] Mechanisms of selective binding of small extracellular vesicles to recipient cells as revealed by single-particle tracking2021

    • Author(s)
      Tatsuki Isogai, Koichiro M. Hirosawa, Ayano Sho, Yasuhiko Kizuka, Yasunari Yokota, Kenichi G. N. Suzuki
    • Organizer
      The 59th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • [Presentation] Subtypes pf small extracellular vesicles and their uptake routes as revealed by super-resolution microscopy and single-particle tracking2021

    • Author(s)
      Koichiro M. Hirosawa, Yasunari Yokota, Kenichi G. N. Suzuki
    • Organizer
      The 59th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • [Presentation] Mechanisms of homodimer formation of gangliosides as revealed by single-molecule imaging and simulation2021

    • Author(s)
      Kenichi G. N. Suzuki
    • Organizer
      Pacifichem2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Membrane dynamics of exosomes as revealed by single-molecule imaging2021

    • Author(s)
      Kenichi G. N. Suzuki
    • Organizer
      Pacifichem2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ラボ訪問2021

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第17回糖鎖科学中部拠点若手の力フォーラム
    • Invited
  • [Presentation] 超解像顕微鏡観察による細胞膜内層シグナリングプラットフォームの可視化解析2021

    • Author(s)
      森俊貴、廣澤幸一朗、笠井倫志、田口友彦、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Presentation] 2色同時超解像顕微鏡観察によるGPIアンカー型タンパク質の階層構造と膜表裏カップリングの検証2021

    • Author(s)
      川合登偉、笠井倫志、廣澤幸一朗、森俊貴、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Presentation] GPCRの細胞膜内層脂質ドメインへの局在の超解像動画・1分子同時可視化解析2021

    • Author(s)
      市川大悟、笠井倫志、廣澤幸一朗、横田康成、鈴木健一
    • Organizer
      令和3年度生物物理学会中部支部講演会
  • [Book] EVs 細胞外小胞の生物学 第4章3.1分子・超解像イメージングによる細胞外小胞動態解明2021

    • Author(s)
      鈴木健一、廣澤幸一朗、磯貝樹
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0399-2

URL: 

Published: 2022-12-28  

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