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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Unraveling of mechanisms of functional cluster formation of glycolipids and verification of the hierarchical structure by high-resolution single-molecule imaging

Research Project

Project/Area Number 21H02424
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

鈴木 健一  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (50423059)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords糖脂質 / GPIアンカー型タンパク質 / 細胞膜ドメイン / ラフト / 1分子観察
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、高精度1分子・超解像顕微鏡観察技術に基づき、生細胞膜上で糖脂質は糖鎖間相互作用により、GPIアンカー型タンパク質は細胞外タンパク質間相互作用により、機能性集合体を誘起し、ラフト脂質がそれを安定化するという概念を検証する。さらに、このような複合体自体を集める大きな膜領域(階層構造)が存在するかを検証する。もし、階層構造がある場合は、その形成機構を明らかにすることを目的としている。今まで、糖脂質ガングリオシド蛍光プローブがなかったために、生細胞膜上の糖脂質ガングリオシドの動態研究は皆無であった。しかし、我々は8種のガングリオシド蛍光プローブを開発し、上記課題に挑んだ。
昨年度までに、様々なGPIアンカー型タンパク質の超解像ライブセルイメージングを行い、タンパク質相互作用と側方方向の脂質相互作用がGPIアンカー型タンパク質ドメイン形成を誘起することを見出した。また、アクチン結合した内層リン脂質がドメイン形成を促進することも見出した。
当該年度は、階層構造の存在を検証するために、GPIアンカー型タンパク質のダイマー形成が膜内層リン脂質ドメインと重なる外層領域で起きやすいかどうかを調べた。そのため、内層リン脂質を超解像観察しながら、GPIアンカー型タンパク質を1分子観察した。結果、GPI-アンカー型タンパク質が、膜内層リン脂質ドメインと重なる外層領域で短寿命のホモダイマーを形成する様子が確認できた。この結果は、階層構造の存在を示唆している。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2024 2023

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 6 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Single-molecule localization microscopy reveals STING clustering at the trans-Golgi network through palmitoylation-dependent accumulation of cholesterol2024

    • Author(s)
      Kemmoku Haruka、Takahashi Kanoko、Mukai Kojiro、Mori Toshiki、Hirosawa Koichiro M.、Kiku Fumika、Uchida Yasunori、Kuchitsu Yoshihiko、Nishioka Yu、Sawa Masaaki、Kishimoto Takuma、Tanaka Kazuma、Yokota Yasunari、Arai Hiroyuki、Suzuki Kenichi G. N.、Taguchi Tomohiko
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Pages: 220

    • DOI

      10.1038/s41467-023-44317-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hierarchical supramolecular structure comprising reduction-responsive DNA microspheres and semi-artificial glycopeptide-based micro-asters2023

    • Author(s)
      Isogami Ayaka、Higashi Sayuri L.、Okumura Bioru、Shibata Aya、Hirosawa Koichiro M.、Suzuki Kenichi G. N.、Tsukiji Shinya、Matsuura Kazunori、Ikeda Masato
    • Journal Title

      Polymer Journal

      Volume: 55 Pages: 1103~1107

    • DOI

      10.1038/s41428-023-00809-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ultrafast single-molecule imaging reveals focal adhesion nano-architecture and molecular dynamics2023

    • Author(s)
      Fujiwara Takahiro K.、Tsunoyama Taka A.、Takeuchi Shinji、Kalay Ziya、Nagai Yosuke、Kalkbrenner Thomas、Nemoto Yuri L.、Chen Limin H.、Shibata Akihiro C.E.、Iwasawa Kokoro、Ritchie Ken P.、Suzuki Kenichi G.N.、Kusumi Akihiro
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology

      Volume: 222 Pages: e202110162

    • DOI

      10.1083/jcb.202110162

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of ultrafast camera-based single fluorescent-molecule imaging for cell biology2023

    • Author(s)
      Fujiwara Takahiro K.、Takeuchi Shinji、Kalay Ziya、Nagai Yosuke、Tsunoyama Taka A.、Kalkbrenner Thomas、Iwasawa Kokoro、Ritchie Ken P.、Suzuki Kenichi G.N.、Kusumi Akihiro
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology

      Volume: 222 Pages: e202110160

    • DOI

      10.1083/jcb.202110160

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Recently developed glycosphingolipid probes and their dynamic behavior in cell plasma membranes as revealed by single-molecule imaging2023

    • Author(s)
      Suzuki Kenichi G. N.、Komura Naoko、Ando Hiromune
    • Journal Title

      Glycoconjugate Journal

      Volume: 40 Pages: 305~314

    • DOI

      10.1007/s10719-023-10116-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cholesterol- and actin-centered view of the plasma membrane: updating the Singer?Nicolson fluid mosaic model to commemorate its 50th anniversary<sup>†</sup>2023

    • Author(s)
      Kusumi Akihiro、Tsunoyama Taka A.、Tang Bo、Hirosawa Koichiro M.、Morone Nobuhiro、Fujiwara Takahiro K.、Suzuki Kenichi G. N.
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 34 Pages: pl1

    • DOI

      10.1091/mbc.E20-12-0809

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] N-acetylglucosaminyltransferase-V (GnT-V)-enriched small extracellular vesicles mediate N-glycan remodeling in recipient cells2023

    • Author(s)
      Hirata Tetsuya、Harada Yoichiro、Hirosawa Koichiro M.、Tokoro Yuko、Suzuki Kenichi G.N.、Kizuka Yasuhiko
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26 Pages: 105747~105747

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105747

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Molecule Imaging of Ganglioside Probes in Living Cell Plasma Membranes2023

    • Author(s)
      Suzuki Kenichi G. N.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2613 Pages: 215~227

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2910-9_17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design of supramolecular hybrid nanomaterials comprising peptide-based supramolecular nanofibers and <i>in situ</i> generated DNA nanoflowers through rolling circle amplification2023

    • Author(s)
      Sugiura Shintaro、Shintani Yuki、Mori Daisuke、Higashi Sayuri L.、Shibata Aya、Kitamura Yoshiaki、Kawano Shin-ichiro、Hirosawa Koichiro M.、Suzuki Kenichi G. N.、Ikeda Masato
    • Journal Title

      Nanoscale

      Volume: 15 Pages: 1024~1031

    • DOI

      10.1039/d2nr04556g

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Refinement of Singer-Nicolson fluid-mosaic model by microscopy imaging: Lipid rafts and actin-induced membrane compartmentalization2023

    • Author(s)
      Suzuki Kenichi G.N.、Kusumi Akihiro
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

      Volume: 1865 Pages: 184093~184093

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2022.184093

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Mechanisms of ganglioside dimer formation and receptor activity regulation as revealed by single-molecule imaging.2024

    • Author(s)
      K. G. N. Suzuki
    • Organizer
      ADVANCES IN GLYCOSCIENCES.
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 糖鎖間相互作用によるEGF受容体活性制御機構:高精度1分子観察による解明2024

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第129回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Unraveling of regulation mechanisms of Ras signaling by single-molecule imaging and super-resolution microscopy.2023

    • Author(s)
      K. G. N. Suzuki
    • Organizer
      The 82nd Annual Meeting of the Japanese Cancer Association.
    • Invited
  • [Presentation] Digging into caveolae by lipid and protein interactions2023

    • Author(s)
      K. G. N. Suzuki
    • Organizer
      The 75th Annual Meeting of the Japan Society for Cell Biology.
    • Invited
  • [Presentation] 1分子・超解像動画観察による細胞膜内層脂質ドメインでのシグナル伝達の可視化解析2023

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Organizer
      第65回日本脂質生化学会
    • Invited
  • [Presentation] Regulation mechanisms of receptor activity by gangliosides as revealed by single-molecule imaging.2023

    • Author(s)
      K. G. N. Suzuki
    • Organizer
      Canadian Glycomics Symposium 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 実験医学増刊号 良い炎症・悪い炎症から捉えた腫瘍免疫学 「STING炎症シグナルの1分子・超解像イメージング」2024

    • Author(s)
      鈴木健一
    • Total Pages
      7
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] 実験医学増刊号 治療標的が見えてきた脂質疾患学 「脂質の高解像度な観察技術-1分子解析と脂質プローブ」2023

    • Author(s)
      田口友彦、鈴木健一
    • Total Pages
      6
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2024-12-25  

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