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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Thylakoid Membrane Remodeling and Optimization of Photosynthetic Activity

Research Project

Project/Area Number 21H02508
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

坂本 亘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (20222002)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsチラコイド膜 / 膜リモデリング / 葉緑体 / 光合成 / NTPase
Outline of Annual Research Achievements

今年度は、シアノバクテリアで構造が決定されたVIPP1のin vivoでの機能をシロイヌナズナVIPP1で検証するためのin vitroとin vivoの機能解析を行った。まずin vitro実験では、大腸菌で発現して精製したVIPP1-Hisタンパク質を用いたNTPase活性部位の解析と複合体構造の変化について、点突然変異を導入して検討した。シアノバクテリアでは、構造から明らかになったヌクレオチド結合部位に変異(E126Q/E179Q二重変異)を導入したところATPおよびGTPの加水分解活性が完全に失活していたが、シロイヌナズナに同じ変異を導入したところ、これらの加水分解活性が失活せず、むしろ野生型よりも高い活性を示すことが明らかになった。一方で、N末端側のαヘリックス内のアミノ酸、特に11番目のバリン残基にアミノ酸置換を加えたVIPP1タンパク質では活性が低下する変異が得られた。次にin vivoの実験では、シロイヌナズナvipp1ノックアウト変異(vipp1-ko)をVIPP1-GFPで相補する実験系を用いて、同様のアミノ酸変異を導入することとした。今年度は上述した変異を導入したVIPP1-GFP遺伝子を作成してvipp1-ko変異体ヘテロ個体を形質転換する実験が全て完了した。来年度以降、ホモ個体を選抜しin vitroでの結果を検証する。さらに、チラコイド膜内におけるリモデリング分子VIPP1, CURT1およびFZLの膜内局在を調べたところ、VIPP1はストロマチラコイドに主局在する一方、VIPP1とCURT1はグラナマージンに局在することが確認された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

VIPP1-His融合タンパク質を用いたATP/GTP加水分解活性の解析は、想定した変異を導入して解析が順調に進んだが、シアノバクテリアで見出されたヌクレオチド結合部位に導入した変異がシロイヌナズナでは影響なく、活性を持つことがわかった。この結果は予想外で、シロイヌナズナVIPP1は異なる活性部位を持つことを示している。これまでも、シロイヌナズナVIPP1タンパク質のネガティブ染色による電顕観察ではリング状の構造が得られていないため、シアノバクテリアと植物では異なる性質を持つことが考えられる。今年度作成中の、vipp1変異体をVIPP1-GFPで相補する実験系でも同様の変異を作っているので、来年度以降これらの結果がIn vitro活性の結果と同様であるかを検討する。

Strategy for Future Research Activity

シロイヌナズナVIPP1のNTPase活性がシアノバクテリアと異なる可能性が指摘されたので、今後、シロイヌナズナVIPP1を用いた構造解析を改めて検討する必要性が生じてきた。このため、来年度以降は、活性測定に加えて、精製VIPP1タンパク質のネガティブ染色電顕観察も試み、オリゴマー構造と活性の相関についても詳しく検討する必要がある。構造解析を進めるにあたり、VIPP1-GFPを葉緑体から精製することも今後検討し、大腸菌からの生成タンパク質だけでない構造解析についても、今後、基礎的知見を収集する。
VIPP1-GFPの相補実験系は海外研究協力者と進めており、コロナ禍の影響で若干遅れているが、来年度にはホモ個体の作成が完了する予定であり、今後、その解析を予定通り進める。
VIPP1および、CURT1, FZLのチラコイド膜局在が生化学的に明らかにできたので、来年度以降は、CURT1, FZLについてもGFP融合タンパク質を発現させる実験系を確立し、今後の機能解析にも用いる。

  • Research Products

    (11 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] 内蒙古大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      内蒙古大学
  • [Int'l Joint Research] ミュンヘン大学(LMU)/カイザースラウテルン工科大学/マールブルグ大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ミュンヘン大学(LMU)/カイザースラウテルン工科大学/マールブルグ大学
    • # of Other Institutions
      1
  • [Journal Article] Genetic analysis of chlorophyll synthesis and degradation regulated by BALANCE of CHLOROPHYLL METABOLISM2022

    • Author(s)
      Yamatani Hiroshi、Ito Takeshi、Nishimura Kenji、Yamada Tetsuya、Sakamoto Wataru、Kusaba Makoto
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 189 Pages: 431-444

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac059

  • [Journal Article] Structural basis for VIPP1 oligomerization and maintenance of thylakoid membrane integrity2021

    • Author(s)
      Gupta TK、Klumpe S、Gries K、Heinz S、Wietrzynski W、Ohnishi N、Niemeyer J、Spaniol B、Schaffer M、Rast A、Ostermeier M、Strauss M、Plitzko JM、Baumeister W、Rudack T、Sakamoto W、Nickelsen J、Schuller JM.、Schroda M、Engel BD
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 184 Pages: 3643~3659.e23

    • DOI

      10.1016/j.cell.2021.05.011

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] NB-LRR-encoding genes conferring susceptibility to organophosphate pesticides in sorghum2021

    • Author(s)
      Jing Zihuan、Wacera W. Fiona、Takami Tsuneaki、Takanashi Hideki、Fukada Fumi、Kawano Yoji、Kajiya-Kanegae Hiromi、Iwata Hiroyoshi、Tsutsumi Nobuhiro、Sakamoto Wataru
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: 19828

    • DOI

      10.1038/s41598-021-98908-7

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナFZLタンパク質によるグラナマージンにおけるチラコイド膜リモデリングの生理機能2022

    • Author(s)
      小川 由・田草川 真理・岩野 惠・Lianwei Peng・明賀 史純・鹿内 利治・坂本 亘
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] PGR5の欠損はフェレドキシンからの電子の流れを変えることによってntrc 変異株の生育阻害を回復させる2022

    • Author(s)
      桶川友季・本橋健・坂本亘
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Mapping and characterization of QTLs for sorghum seed ionome reveals differential cadmium accumulation in a recombinant inbred population2022

    • Author(s)
      Fiona W. Wacera・山崎清志・高梨秀樹・藤原徹・堤伸浩・坂本亘
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] オルガネラDNA 分解の異常はオートファジー変異体の早枯れ表現型を抑制する2022

    • Author(s)
      高見常明・Islam Md. Faridul・坂本亘
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Revisiting photo-oxidative damage of D1 protein in the PSII repair cycle.2021

    • Author(s)
      Wataru Sakamoto
    • Organizer
      Finland-Japan Seminar 2021 Understanding the integrative systems to coordinate paradoxes between enhanced efficiency and stress tolerance of photosynthesis
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Phos-tag を用いた葉緑体チラコイド膜におけるタンパク質リン酸化の解析2021

    • Author(s)
      (7)坂本 亘・西岡佳司・加藤裕介
    • Organizer
      第72回日本電気泳動学会
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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