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2023 Fiscal Year Annual Research Report

mRNA chemical modification in activity-dependent establishment of neural circuits

Research Project

Project/Area Number 21H02580
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

王 丹  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (50615482)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsepidecodeR / reader protein / YTHDF1
Outline of Annual Research Achievements

「遺伝子」と「環境」の相互作用によって機能を獲得する脳のメカニズムは神経科学の重要な課題である。これまで、相互作用の場として、DNAやヒストンの化学修飾によるエピジェネティクスが研究の中心になってきたが、我々は最近、シナプスの形成と機能を制御する精神疾患関連遺伝子のRNAがメチル化修飾をうける現象を発見した (Nat Neurosci, 2018; Oxford handbook, 2020; TINS, 2020)。既存モデルと比べ、RNA修飾は、より迅速かつ柔軟に環境変化に対して応答できる。局所での環境変化を素早く検出し、遺伝子発現を迅速に制御しうるRNA化学修飾は、活動依存的に回路発達を制御する全く新しく、かつ根源的なメカニズムの可能性がある。本研究では、mRNA上にもっとも豊富なメチル化アデノシン塩基(m6A)に注目し、神経細胞微小管動的末端における局所翻訳制御を通して、活動依存的な回路形成と精神機能に繋がるRNAメチル化修飾の役割を明らかにする目的で研究を行った。
2023年度には我々は特に軸索における局所翻訳に注目し、m6Aの読み取るタンパク質YTHDF1の役割について検討した。その結果YTHDF1はm6A修飾に依存的にAdenomatosis Polyposis Coli (APC)mRNAに結合して、その翻訳を促進することを見いだした。APCタンパク質はbeta-actin mRNAを含め、多くの細胞骨格制御に関わるタンパク質の発現に必要であることから、発達中の神経細胞でYTHDF1が欠損すると、APCタンパク質の発現が不足になり、その軸索伸長突起に異常が起きることを見出した。
さらにヒト精神疾患におけるDNA、RNA、タンパク質の修飾の異常を探索するためにバイオインフォマティクスツールを開発し発表した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] epidecodeR: a functional exploration tool for epigenetic and epitranscriptomic regulation2024

    • Author(s)
      Joshi Kandarp、Wang Dan O
    • Journal Title

      Briefings in Bioinformatics

      Volume: 25 Pages: -

    • DOI

      10.1093/bib/bbad521

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Crocetin antagonizes parthanatos in ischemic stroke via inhibiting NOX2 and preserving mitochondrial hexokinase-I2023

    • Author(s)
      Wu Hao、Li Ying、Zhang Qian、Wang Hanxun、Xiu Wenyu、Xu Pu、Deng Yujie、Huang Wanxu、Wang Dan Ohtan
    • Journal Title

      Cell Death & Disease

      Volume: 14 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41419-023-05581-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RNA G-quadruplex organizes stress granule assembly through DNAPTP6 in neurons2023

    • Author(s)
      Asamitsu Sefan、Yabuki Yasushi、Matsuo Kazuya、Kawasaki Moe、Hirose Yuki、Kashiwazaki Gengo、Chandran Anandhakumar、Bando Toshikazu、Wang Dan Ohtan、Sugiyama Hiroshi、Shioda Norifumi
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 9 Pages: -

    • DOI

      10.1126/sciadv.ade2035

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] m6A RNA modification and its reader proteins at neuronal synapses2023

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Organizer
      Jacque Monod Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] m6A RNA modification and its reader proteins at neuronal synapses2023

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Organizer
      Neurochemistry Society
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] m6A RNA modification and its reader proteins at neuronal synapses2023

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Organizer
      FAOP meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] m6A RNA modification and its reader proteins at neuronal synapses2023

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Organizer
      46th JNS meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] m6A RNA modification and its reader proteins at neuronal synapses2023

    • Author(s)
      Dan Ohtan Wang
    • Organizer
      2nd CJK meeting
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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