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2021 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝子改変技術によるロタウイルス感染制御基盤の確立

Research Project

Project/Area Number 21H02739
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

小林 剛  大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (90324847)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsロタウイルス / ワクチン
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ロタウイルスの感染性ならびに病原性に関わるウイルス側、宿主側因子の解析を行うことで、ロタウイルスにおける感染機構ならびに下痢症発症機構を明らかにする。本年度は以下の成果が得られた。
サルロタウイルスSA11株はスパイクタンパク質により、細胞表面のシアル酸に結合する。シアル酸に結合するアミノ酸を変異させた組換えウイルスの作製を試みた結果、シアル酸結合部位変異ウイルスの作製に成功したことから、スパイクタンパク質のシアル酸結合部位はウイルス増殖において必須ではないことが示された。この変異ウイルスの培養細胞での増殖性は野生型と比較し、低下していたことからシアル酸結合部位はウイルス複製において重要な役割を担っていることが示唆された。
ロタウイルス感染症に関与する宿主因子についてはほとんど明らかにされていない。そこで、ヒト結腸癌由来HT29細胞およびSA11株を用いてCRISPR-Cas9スクリーニングを行った。得られたスクリーニングの結果をもとに候補遺伝子をノックダウン、ノックアウトした細胞を作製し、解析を行った結果、ロタウイルス感染性の低下に関与する宿主因子を複数同定した。
ロタウイルスNSP4タンパク質は糖タンパク質である。NSP4の2か所の糖鎖付加部位に変異を加えたウイルスの作製を試みた。その結果、目的の変異ウイルスの作製に成功したことからNSP4の糖鎖付加部位はウイルス複製において必須ではないことが明らかになった。作製した変異ウイルスの培養細胞における増殖性を解析した結果、2か所の糖鎖付加部位に変異を加えたウイルスでは野生型と比較して、増殖性が低下していたことから、NSP4の糖鎖付加部位はウイルス複製において重要な役割を担っていることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度はVP4タンパク質内のシアル酸結合部位に変異を加えた組換えウイルスを作製し、シアル酸への結合がロタウイルス感染に重要な役割を担っていることを明らかにした。CRISPR-Cas9スクリーニング系を用いて、ロタウイルスの感染に重要な宿主因子の同定を試み、その結果、ロタウイルス感染に関わる候補因子を複数見出すことができた。さらにNSP4タンパク質内の糖鎖結合部位に変異を加えたウイルスを作製し、増殖性に影響を及ぼすことを明らかにした。
上記の成果が得られたことから、研究計画の進捗状況についてはおおむね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

シアル酸結合部位変異ウイルスの解析についてはiPS細胞由来ヒト腸管上皮細胞等での増殖能および糖鎖分子結合能について詳細な解析を行い、既知受容体のロタウイルス感染機構における結合意義を解明する。また、動物モデルを用いたin vivo実験も検討する。
ロタウイルス感染に相互作用する宿主因子の同定研究については、引き続き、得られた候補因子に対するノックダウン、ノックアウト細胞を用いてロタウイルスの増殖機構における各種候補因子の機能を明らかにする。
NSP4変異ウイルスの解析については感染細胞における各ウイルス増殖サイクルへの影響を詳細に調べる。さらに乳飲みマウスに経口感染することで下痢症を発症する動物モデルを用いて、下痢症発症の経時的変化とウイルス量を測定する。

  • Research Products

    (19 results)

All 2022 2021

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] An increasing trend of human sapovirus infection in Japan, 2009 to 2019: An emerging public health concern2022

    • Author(s)
      Hoque S. A., Nishimura K, Thongprachum A. , Khamrin P. ,Ngan Thi Kim Pham, Islam M. T. , Khandoker n. , Okitsu S, Onda-Shimizu Y , Dey S. K. ,Maneekarn N. , Kobayashi T, Hayakawa S, Ushijima H.
    • Journal Title

      Journal of Infection and Public Health

      Volume: 15 Pages: 315~320

    • DOI

      10.1016/j.jiph.2022.01.019

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] SARS-CoV-2 infection triggers paracrine senescence and leads to a sustained senescence-associated inflammatory response2022

    • Author(s)
      Tsuji S, Minami S, Hashimoto R, Konishi Y, Suzuki T, Kondo T, Sasai M, Torii S, Ono C, Shichinohe S, Sato S, Wakita M, Okumura S, Nakano S, Matsudaira T, Matsumoto T, Kawamoto S, Yamamoto M, Watanabe T, Matsuura Y, Takayama K, Kobayashi T, Okamoto T, Hara E.
    • Journal Title

      Nature Aging

      Volume: 2 Pages: 115~124

    • DOI

      10.1038/s43587-022-00170-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ultrasensitive detection of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein using large gold nanoparticle-enhanced surface plasmon resonance2022

    • Author(s)
      Yano T, Kajisa T, Ono M, Miyasaka Y, Hasegawa Y, Saito A, Otsuka K, Sakane A, Sasaki T, Yasutomo K, Hamajima R, Kanai Y, Kobayashi T, Matsuura Y, Itonaga M, Yasui T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-022-05036-x

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Species A rotavirus reverse genetics: Achievements and prospects2021

    • Author(s)
      Kobayashi T, Patton J.T., Desselberger U.
    • Journal Title

      Virus Research

      Volume: 306 Pages: 198583~198583

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2021.198583

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of an entirely plasmid-based reverse genetics system for 12-segmented double-stranded RNA viruses2021

    • Author(s)
      Nouda R, Minami S, Kanai Y, Kawagishi T, Nurdin JA, Yamasaki M, Kuwata R, Shimoda H, Maeda K, Kobayash T.
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Pages: e2105334118

    • DOI

      10.1073/pnas.2105334118

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Monoreassortant Rotaviruses of Multiple G Types Are Differentially Neutralized by Sera From Infants Vaccinated With ROTARIX and RotaTeq2021

    • Author(s)
      J. R. Diller, M. H. Carter, Kanai Y, S. V. Sanchez, Kobayashi T, K. M. Ogdena.
    • Journal Title

      The Journal of Infectious Diseases

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/infdis/jiab479

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The Detection of Rotavirus Antigenemia by Immunochromatographic Kits: a Case Series2021

    • Author(s)
      Ushijima H, Hikita T, Kobayashi M, Ngan TKP, Onda-Shimizu Y, Kawagishi T, Okitsu S, Kanai Y, Kobayashi T, Tung P, Ariful SH, Takanashi S, Komoto S, Kattareeya K, Taniguchi K, Niwat M, Hayakawa S, Pattara K.
    • Journal Title

      Clinical Laboratory

      Volume: 67 Pages: 2275~2282

    • DOI

      10.7754/Clin.Lab.2021.210125

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] FAST Proteins: Development and Use of Reverse Genetics Systems for Reoviridae Viruses2021

    • Author(s)
      Kanai Y, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Annual Review of Virology

      Volume: 8 Pages: 515~536

    • DOI

      10.1146/annurev-virology-091919-070225

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epidemiology and genetic diversity of group A rotavirus in pediatric patients with acute gastroenteritis in Thailand, 2018-20192021

    • Author(s)
      Nutthawadee J, Kattareeya K, Arpaporn Y, Kanai Y, Okitsu S, Kobayashi T, Nuthapong U, Ushijima H, Niwat M, Pattara K.
    • Journal Title

      Infection, Genetics and Evolution

      Volume: 95 Pages: 104898~104898

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2021.104898

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] DsRNA Sequencing for RNA Virus Surveillance Using Human Clinical Samples2021

    • Author(s)
      Izum T, Morioka Y, Urayama S, Motooka D, Tamura T, Kawagishi T, Kanai Y, Kobayashi T, Ono C, Morinaga A, Tomiyama T, Iseda N, Kosai Y, Inokuchi S, Nakamura S, Tanaka T, Moriishi K, Kariwa H, Yoshizumi T, Mori M, Matsuura Y, Fukuhara T.
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 13 Pages: 1310~1310

    • DOI

      10.3390/v13071310

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Rotavirus reverse genetics systems: Development and application2021

    • Author(s)
      Kanai Y, Kobayashi T.
    • Journal Title

      Virus Research

      Volume: 295 Pages: 198296~198296

    • DOI

      10.1016/j.virusres.2021.198296

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Combining machine learning and nanopore construction creates an artificial intelligence nanopore for coronavirus detection2021

    • Author(s)
      Taniguchi M, Minami S, Ono C, Hamajima R, Morimura A, Hamaguchi S, Akeda Y, Kanai Y, Kobayashi T, Kamitani W, Terada Y, Suzuki K, Hatori N, Yamagishi Y, Washizu N, Takei H, Sakamoto O, Naono N, Tatematsu K, Washio T, Matsuura Y, Tomono K.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 3726~3726

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24001-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] A genome-wide CRISPR-Cas9 screening approach to identify host factors for rotavirus infection CRISPR-Cas9法によるロタウイル ス感染に関与する宿主因子のゲノムワイドスクリーニング2021

    • Author(s)
      山﨑 萌子、浜島 りな、金井 祐太、小瀧 将裕、南 昌平、納田 遼太郎、Nurdin Jeffery、小林 剛
    • Organizer
      第68回ウイルス学会学術集会
  • [Presentation] Altered infectivity of rotaviruses in mice treated with antibiotics 抗生物質を投与したマウスにおけるロタウイルスの増殖能2021

    • Author(s)
      金井 祐太、Jeffery Nurdin、南 昌平、納田 遼太郎、山崎 萌子、小林 剛
    • Organizer
      第68回ウイルス学会学術集会
  • [Presentation] Development of an entirely plasmid-based reverse genetics system for 12-segmented double-stranded RNA virus.2021

    • Author(s)
      Ryotaro Nouda, Shohei Minami, Yuta Kanai, Takahiro Kawagishi, Jeffery A. Nurdin, Moeko Yamasaki, Ryusei Kuwata, Hiroshi Shimoda, Ken Maeda, Takeshi Kobayashi.
    • Organizer
      第68回ウイルス学会学術集会
  • [Presentation] Determining the role of rotavirus NSP4 N-glycosylation sites using reverse genetics approach2021

    • Author(s)
      Jeffery A. Nurdin, Yuta Kanai, Tomohiro Kotaki, Takahiro Kawagishi, Shohei Minami, Ryotaro Nouda, Moeko Yamasaki, Takeshi Kobayashi.
    • Organizer
      第68回ウイルス学会学術集会
  • [Presentation] Analysis of intestinal epithelial cells differentiated from human induced pluripotent stem cells as a more suitable tool for the study of SARS-CoV-22021

    • Author(s)
      Shohei Minami, Naomi Matsumoto, Ryotaro Nouda, Jeffery Nurdin, Moeko Yamasaki, Tomohiro Kotaki, Yuta Kanai, Shintaro Sato, Takeshi Kobayashi.
    • Organizer
      第68回ウイルス学会学術集会
  • [Book] 医学のあゆみ280巻9号 ウイルスを創る,ウイルスを視る2021

    • Author(s)
      金井祐太、納田遼太郎、小林 剛
    • Total Pages
      911-915
    • Publisher
      医歯薬出版株式会社
  • [Book] 創薬研究者がこれだけは知っておきたい最新のウイルス学2021

    • Author(s)
      金井祐太、納田遼太郎、山﨑萌子、小林 剛
    • Total Pages
      40-49
    • Publisher
      技術情報協会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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