2023 Fiscal Year Annual Research Report
Identification of cancer-specific neoantigens in organoid culture
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21H02995
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| Research Institution | Kanagawa Cancer Center Research Institute |
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Principal Investigator |
笹田 哲朗 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), がんワクチン・免疫センター, 部長 (70293967)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
星野 大輔 地方独立行政法人神奈川県立病院機構神奈川県立がんセンター(臨床研究所), その他部局等, 部長代理 (30571434)
川村 猛 東京大学, アイソトープ総合センター, 准教授 (70306835)
上田 宏生 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任講師 (70821916)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | ネオアンチゲン / オルガノイド / ペプチドミクス解析 / 遺伝子変異 / がん免疫治療 / HLA分子 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
がん細胞特異的な遺伝子変異に由来するネオアンチゲンは強い抗腫瘍免疫応答を誘導するが、ネオアンチゲンを効率的・網羅的に同定する方法は確立されていない。我々はがん細胞表面のHLA分子に提示されたネオアンチゲンペプチドを最先端の質量分析（ペプチドミクス解析）技術を用いて腫瘍組織から直接同定する手法を開発中である。本研究では、微量の腫瘍組織しか採取できないがん患者に対する臨床応用を想定して、オルガノイドとして拡大培養した腫瘍組織のペプチドミクス解析により、HLA結合ネオアンチゲンを同定する手法の確立を目的とした。
令和5年度には、① 腎がん患者（2例）および膀胱がん（5例）の手術摘出腫瘍検体からがん細胞塊を分離・回収し、オルガノイドとして拡大培養した。前年度までと合わせて、胃がん4例、腎がん8例、膀胱がん5例のオルガノイドが樹立された。② オルガノイド組織と新鮮腫瘍組織（オルガノイド作成に用いた腫瘍）から遊離・回収したHLA class I 結合ペプチドの種類を比較・検討した。③ オルガノイド細胞と同一患者に由来する腫瘍浸潤T細胞（4例）のシングルセルRNA-Seq解析によりT細胞受容体（TCR）遺伝子の種類・頻度を解析した。頻度の高いTCR遺伝子（患者ごとに20種類）を末梢血単核球（PBMC）に導入し樹立したTCR-T細胞の、同一患者由来オルガノイド細胞への反応性を評価したところ、約半数のTCRがオルガノイド細胞反応性を示した。④ オルガノイド細胞反応性を示したTCR-T細胞のネオアンチゲン（オルガノイド組織のペプチドミクス解析により同定）反応性を検討し、ネオアンチゲンの免疫原性を検証中である。
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| Research Progress Status |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(13 results)
