2023 Fiscal Year Annual Research Report
Genomic profiling and drug screening among organoids derived from ovarian cancer patients
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21H03074
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
織田 克利 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (30359608)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
長谷川 幸清 埼玉医科大学, 医学部, 教授 (30534193)
田口 歩 東京大学, 医学部附属病院, 届出研究員 (60756782)
谷川 道洋 東京大学, 医学部附属病院, 届出研究員 (70706944)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | オルガノイド / がん遺伝子パネル検査 / RNAシークエンス / 子宮頸癌 / 卵巣癌 / 子宮体癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【目的】2023年度は（１）子宮頸部squamocolumnar (S-C) Junctionのオルガノイド培養株を樹立し、HPV18感染の意義を解明すること、（２）主要な婦人科がんのMolecular Profilingと遺伝子変異頻度との関係を調べること、（３）本学独自のがん遺伝子パネル検査Todai OncoPanelの有用性の検証を行うことを研究目的とした。
【方法】（１）HPV-18プロモーター活性を示すS-C Junctionオルガノイド系を確立し、Single-cell RNA sequencingを行った。（２）C-CATデータベースを用いて、卵巣がん、子宮体がん、子宮頸がんの遺伝子変異プロファイル、MSI、Tumor Mutational Burden (TMB)との関連性を検討した。（３）Todai OncoPanel (TOP)解析例のうち、肺がんにおいてRNAパネルの有用性を検討した。
【成績】（１）ADNP, FHL2, NPM3 といった遺伝子が、HPV18ゲノムの維持、活性化に関わっており、NPM3が子宮頸部腺癌で高発現していた。（２）予後不良な婦人科がん（卵巣がん、子宮体がん、子宮頸がん）において、MSI-H、TMB-H、MSS (MSI陰性) 群の遺伝子変異プロファイルの違いが示された。（３）肺がんにおけるMETエクソン14スキッピングの検出率は、従来のパネル検査よりもTOPで高かった。
【結論】オルガノイド培養系とSingle-cell RNA sequencingを組み合わせることで、発がんプロセスに関わり治療標的候補となりうる因子を明らかとした。がん遺伝子パネル検査のReal World Evidenceを踏まえ、Todai OncoPanelが従来の検査法よりも優れている可能性を見出した。
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| Research Progress Status |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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