2023 Fiscal Year Final Research Report
Genomic profiling and drug screening among organoids derived from ovarian cancer patients
| Project/Area Number |
21H03074
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
|
| Allocation Type | Single-year Grants |
|---|
| Section | 一般 |
|---|
| Review Section |
Basic Section 56040:Obstetrics and gynecology-related
|
|---|
| Research Institution | The University of Tokyo |
|---|
Principal Investigator |
Oda Katsutoshi 東京大学, 医学部附属病院, 教授 (30359608)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
長谷川 幸清 埼玉医科大学, 医学部, 教授 (30534193)
田口 歩 東京大学, 医学部附属病院, 届出研究員 (60756782)
谷川 道洋 東京大学, 医学部附属病院, 届出研究員 (70706944)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
|
| Keywords | がん遺伝子パネル検査 / マルチオミクス解析 / オルガノイド / 卵巣癌 / 子宮体癌 / 子宮頸癌 / リアルワールドデータ / Todai Oncopanel |
|---|
| Outline of Final Research Achievements |
Whole exome sequencing showed that both the original small cell carcinoma and its organoid shared 19 somatic mutations, including KRAS p.G12D pathogenic variant. RNA-seq revealed that HPV18 was integrated into chromosome 8q24.21, resulting in over- expression of the proto-oncogene MYC. Drug sensitivity testing revealed that a KRAS pathway inhibitor exerted strong anti-cancer effects in the xenograft model.
Data from DNA and RNA panels in Todai OncoPanel were analyzed in 198 and 191 patients, respectively. One hundred and four samples (53%) harbored gene alterations with potential treatment implications. Twenty-two samples (11.1%) harbored 30 fusion transcripts or MET exon 14 skipping by the RNA panel.
C-CAT database analysis illustrated the genomic landscape of three major gynecological cancers (endometrial, cervical and ovarian cancer) in the Japanese cohort. The prevalence and correlation between TMB and MSI may influence future immunotherapy, including combination therapies.
|
| Free Research Field |
産婦人科学
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
婦人科がんにおけるPrecision Medicineの発展に資することを目的に、基礎的・臨床的観点から研究成果を報告した。オルガノイド培養系による基礎的な研究では、薬剤感受性試験やCarcinogenesisの解明に有用であることを示した。また、がん遺伝子パネル検査を用いた解析では、リアルワールドデータをもとに新規治療法の開発を進めていける可能性を示した。我々が先進医療Bとして実施したTodai OncopanelはGenMineTOPとして現在保険適用となっており、今後の実地臨床での活用により日本のがんゲノム医療が一層進むことが期待される。
|
