2022 Fiscal Year Annual Research Report
Development of a highly sensitive simple detection method for SARS-CoV-2 to achieve highly accurate diagnosis and elucidation of environmental dynamics
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21H03180
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
山崎 渉 京都大学, 東南アジア地域研究研究所, 教授 (70393262)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
長尾 美紀 京都大学, 医学研究科, 教授 (80523993)
松村 康史 京都大学, 医学研究科, 准教授 (80726828)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 新型コロナウイルス / 高感度検出 / 唾液 / マガキ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
新型コロナウイルスの環境動態調査：前年度からの継続していた市販マガキの調査を完了し、供試した145サンプルすべてが新型コロナウイルス陰性であることを確認した。すべてのサンプルに内部陽性対照として添加したPEDV（豚コロナウイルス）はすべてのサンプルから予想どおり検出されたことから、正しい手技によって調査が行われたことは明白である。日本では養殖マガキの喫食によって、新型コロナウイルスに感染する可能性は極めて低いことが示唆された。また、マガキが自然界における新型コロナウイルスの感染環を担っている可能性も極めて低いことが示唆された。欧州の研究者からマガキから新型コロナウイルスの遺伝子を検出したとの複数の報告がされているが、いずれもウイルス粒子と遺伝子断片を区別することなく、RNAを抽出したうえでリアルタイムRT-PCR検査を行っており、遺伝子断片を除去し、ウイルス粒子からの遺伝子検出を行った本研究とは手法が異なる。現時点でマガキの喫食による新型コロナウイルス感染の報告は全く無い。それゆえ、欧州からの既報は感染性を有しない遺伝子断片を検出し、新型コロナウイルスへの感染リスクを過大に評価している可能性が示唆された。
新型コロナウイルスの唾液からの高感度検出法の開発：前年度からの課題となっていた唾液成分に起因する濃縮阻害は、2つの前処理を行うことで解決できることが明らかになった【(1)唾液へのセミアルカリプロテネースの室温15分感作。(2)粗遠心処理（4,000-12,000 g・5分）。】。これにより検査方法の確立にむけた基礎情報を得ることができた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
マガキの調査を完了し、唾液からの新型コロナウイルスの高感度検出法の開発においても、実用化につながるデータを得ることができたため。
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| Strategy for Future Research Activity |
唾液からの新型コロナウイルスの高感度検出法の開発を完了し、性能評価を実施する。
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[Presentation] 簡易迅速なDNA抽出とLAMP検出を組み合わせた、アフリカ豚熱の高感度な ポイントオブケア検査の開発：自然感染豚の全血検体を用いたベトナムでの評価2023
Author(s)
Wataru Yamazaki, Mai Thi Ngan, Huynh Thi My Le、Vu Ngoc Dang, Trinh Thi Bich Ngoc、Le Van Phan, Nguyen Thi Hoa, Truong, Quang Lam, Nguyen Thi Lan, Yasuko Yamazaki, Kosuke Notsu, Satoshi Sekiguchi
Organizer
第14回LAMP研究会
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[Presentation] Development of a highly sensitive point-of-care test for African swine fever that combines EZ-Fast DNA extraction with LAMP detection: evaluation using naturally infected swine whole blood samples from Vietnam2022
Author(s)
Mai Thi Ngan, Huynh Thi My Le, Vu Ngoc Dang, Trinh Thi Bich Ngoc, Le Van Phan, Nguyen Thi Hoa, Truong Quang Lam, Nguyen Thi Lan, Kosuke Notsu, Satoshi Sekiguchi, Yasuko Yamazaki, Wataru Yamazaki
Organizer
ESVV2022
Int'l Joint Research
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