2021 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive genetic and morphological analysis for sudden cardiac death autopsy cases
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21H03211
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| Research Institution | University of Toyama |
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Principal Investigator |
畑 由紀子 富山大学, 学術研究部医学系, 准教授 (30311674)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
西田 尚樹 富山大学, 学術研究部医学系, 教授 (10315088)
一萬田 正二郎 富山大学, 学術研究部医学系, 助教 (60849355)
廣野 恵一 富山大学, 学術研究部医学系, 講師 (80456384)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 法医学 / 突然死 / エクソーム解析 / 病理組織学的検索 / 遺伝子変異 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、心臓突然死例のエクソーム解析を中心に研究を行い、いくつかの症例について学会発表を行った。
本年度の補助金は、主に前述の研究を遂行するための遺伝子解析、遺伝子解析ソフト及びバリアントの機能解析に用いる遺伝子導入システム購入の費用にあてられた。
1. 心臓突然死症例の病理組織学的検索は、微細な病理学的変化を明らかにすることを目的に、死因、肉眼所見を問わず刺激伝導系の切り出しを含め常に15ヶ所以上の心臓組織標本を作製し観察を行った。加えて、その他主要臓器については2ヶ所以上、脳については20ヶ所以上標本を作製して観察を行った。
2. 心臓突然死症例の遺伝子解析は、剖検時採取した血液からDNAを抽出し、エクソーム解析を施行した。また、説明・同意をえられた家族については、スワブで採取した口腔粘膜細胞からDNA抽出し、エクソーム解析を施行した。心臓突然死剖検例に対する遺伝子検索手法の確立を目指すために、検出されたバリアントについて、1) 日本人の稀少変異(頻度1%以下)の抽出、2) 疾患データベースのClinVar、HGMDを用いた検索、3) 米国臨床遺伝・ゲノム学会のガイドラインに従った評価、4) 機能予測ツールを用いて病原性を評価した。検出したバリアントについては、Human Phenotype Ontology (HPO)やOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)などを用いて疾患関連遺伝子で分類した。
前述1. 及び2. について、肉眼から組織学的観察および遺伝子検査の診断プロトコールを作成するために、全症例について行っている。学会発表を行った症例は、生前の心電図、刺激伝導系の病理組織学的検索、遺伝子解析の結果についてまとめたものである。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度予定していた症例数の遺伝子解析数は満たしたものの、バリアントの評価が遅れているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、本年度同様当教室で施行された症例について病理組織学的検索および遺伝子解析を行っていく。また、検出されたバリアントの機能解析を行う予定である。これまでの成果をもとに、学会発表及び論文投稿を行っていく予定である。
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