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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanisms of cellular tensional homeostasis: measurement and analysis

Research Project

Project/Area Number 21H03796
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

出口 真次  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 教授 (30379713)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords張力ホメオスタシス / バイオメカニクス / メカノバイオロジー / 熱力学 / FRAP
Outline of Annual Research Achievements

増殖が可能な細胞には張力ホメオスタシスと呼ばれる、細胞内部の物理的な張力を一定に維持する性質が備わっている。これは細胞が周囲環境の変化に対して適応的に振る舞うための基盤となっており、その能力の不全は様々な疾患との関連をもつことが指摘されている。張力ホメオスタシスのメカニズムの解明のために、本年度は従来困難であった細胞内タンパク質の複数の挙動(純拡散・化学結合・移流・機械的変形)の区別を行うことができる測定法を開発した。具体的にはFRAP法(fluorescence recovery after photobleaching)のデータに対して、様々な物理化学的現象を考慮した解析モデルを構築・適用し、上記の複数挙動のそれぞれの性質を抽出した。張力ホメオスタシスを実現する条件を阻害する薬剤投与実験を行い、この改良FRAP法(連続体力学をもとに記述していることから、Continuum mechanics-based FRAP, CM-FRAP法と名付けた)をもとにそのときの細胞の状態変化について定量化を行った。さらに、張力ホメオスタシスの分子・物理機構に手がかりを得るための数値解析を行った。また、実験結果の一部に対して熱統計力学に基づく解析を行い、現象の背後にある細胞の性質について数理的な記述のもと解釈することができた。具体的には、細胞が張力ホメオスタシスを満たす条件を数式で表現し、構成要素であるactin filamentにどのような長さ分布をもつことが求められるかを理論的(統計力学および熱力学)に導き、それが実験結果と一致することを示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

成果をまとめて論文投稿を行うこともできた。

Strategy for Future Research Activity

上記の数理モデルには精度の観点から改良点が含まれていることも明らかとなった。そこで今後はモデルの改良に取り組みつつ、並行して様々な条件で実験を行い、両者の比較から細胞の性質を解釈・抽出することに取り組む。また、熱統計力学で扱う対象を広げてより普遍性の高いモデルを構築して解析を進める。

  • Research Products

    (15 results)

All 2021 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Mechanosensitive myosin II but not cofilin primarily contributes to cyclic cell stretch-induced selective disassembly of actin stress fibers2021

    • Author(s)
      Huang, W., Matsui, T.S., Saito, T., Kuragano, M., Takahashi, M., Kawahara, T., Sato, M., Deguchi, S.
    • Journal Title

      American Journal of Physiology Cell Physiology

      Volume: 320 Pages: C1153-C1163

    • DOI

      10.1152/ajpcell.00225.2020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Determining the domain-level reaction-diffusion properties of an actin-binding protein transgelin-2 within cells2021

    • Author(s)
      Saito, T., Matsunaga, D., Matsui, T.S., Noi, K., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Experimental Cell Research

      Volume: 404 Pages: 112619

    • DOI

      10.1016/j.yexcr.2021.112619

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ARHGAP4-SEPT2-SEPT9 complex enables both up- and down-modulation of integrin-mediated focal adhesions, cell migration, and invasion2021

    • Author(s)
      Kang, N., Matsui, T.S., Liu, S., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 32 Pages: ar28, 1-12

    • DOI

      10.1091/mbc.E21-01-0010

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Does durotaxis direct NE cell migration in developing lung?2021

    • Author(s)
      Kana Furukawa, Shinji Deguchi
    • Organizer
      The 11th Asian-Pacific Conference on Biomechanics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞による力学環境への適応のメカニズム2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      MMDS・AIMap研究会
    • Invited
  • [Presentation] Machine learning-based detection of cellular forces and its application to drug screening2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      International Conference on Future Healthcare and Economic Development
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] シグナル伝達, 数理モデルに基づく細胞計測2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      生物物理学会サブグループ・メカノバイオロジー研究会
  • [Presentation] バイオメカニクスの最前線ー細胞の恒常性を理解するー2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      次世代医療システム産業化フォーラム
    • Invited
  • [Presentation] Cellular adaptation to mechanical environment2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      MEI-Center Summer School 2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ストレスファイバーの熱力学2021

    • Author(s)
      出口 真次, 上田 唯花, 松井 翼, 松永 大樹
    • Organizer
      第33回バイオエンジニアリング講演会
    • Invited
  • [Presentation] Wrinkle force microscopy: a machine learning-based approach to evaluate cellular forces2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      DevMech Webinar
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞の力のホメオスタシス、細胞の力のアッセイ2021

    • Author(s)
      出口真次
    • Organizer
      京大ウイルス再生研生体材料学分野・セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Machine learning-based cellular force evaluation2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      From Research to Innovation” Symposium on the 15th Anniversary of Osaka University and University of Strasbourg
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Machine learning-based detection of cellular traction forces2021

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      LINK-J & UC San Diego Joint Webinar Series #4 with Osaka University
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 大阪大学大学院基礎工学研究科・出口研究室

    • URL

      http://mbm.me.es.osaka-u.ac.jp

URL: 

Published: 2023-12-25  

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