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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanisms of cellular tensional homeostasis: measurement and analysis

Research Project

Project/Area Number 21H03796
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

出口 真次  大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 教授 (30379713)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords張力ホメオスタシス / 細胞バイオメカニクス / メカノバイオロジー / FRAP / 熱力学 / 統計力学 / バイオメカニクス / パーコレーション
Outline of Annual Research Achievements

増殖が可能な細胞には張力ホメオスタシスと呼ばれる、細胞内部の物理的な張力を一定に維持する性質が備わっている。一部の細胞内シグナル分子の活性化はこの物理的張力の下流において調節されていることから、このホメオスタシスは細胞が周囲環境の変化に対して適応的に振る舞うための基盤となっている。また、本ホメオスタシスの不全は動脈硬化症を含め様々な疾患との関連をもつことが指摘されている。これらの背景のもと、本年度はこれまでに開発した改良FRAP法(Continuum mechanics-based fluorescence recovery after photobleaching, CM-FRAP法)を含め、その詳しい実験方法を記したプロトコル論文や総説論文、さらにはmacromolecular crowding(細胞内分子の混雑状況が拡散等に及ぼす影響)に関する実験論文などの執筆を行なった。さらに、本方法を空間統計学と組み合わせる新規方法についてさらなる実験的検証を進めた。これにより、細胞内の限られた部分におけるFRAP計測データに基づいて、細胞内の任意の位置、例えば、核や小胞体の位置における測定(分子拡散係数やターンオーバー速度など)を推定できるようになった。さらにFRAP測定における移流の影響を、これまでのように数値計算に基づくだけでなく、解析的計算のみによってその個別の定量性を説明できる理論的枠組みを構築した。さらに細胞内の張力ホメオスタシスの特徴を非平衡物理学の観点(パーコレーション・シミュレーション)から記述し、論文投稿を行なった。以上より、当初の予定以上の技術開発・理論構築のもと十分な研究・論文成果をもって本研究の最終年度を締めくくることができた。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Pontificia Universidad Catolica de Chile(チリ)

    • Country Name
      CHILE
    • Counterpart Institution
      Pontificia Universidad Catolica de Chile
  • [Int'l Joint Research] Niels Bohr Institute/University of Copenhagen(デンマーク)

    • Country Name
      DENMARK
    • Counterpart Institution
      Niels Bohr Institute/University of Copenhagen
  • [Journal Article] Unraveling a Key Molecular Player Governing Pulmonary Alveolar Development2024

    • Author(s)
      Ding Shihang、Deguchi Shinji、Kim Taeyoon
    • Journal Title

      American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology

      Volume: 70 Pages: 237~238

    • DOI

      10.1165/rcmb.2024-0025ED

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Advancing FRAP for cell studies: Where there is a new method, there is a new field2023

    • Author(s)
      SAITO Takumi、DEGUCHI Shinji
    • Journal Title

      Journal of Biomechanical Science and Engineering

      Volume: 18 Pages: 23-00028

    • DOI

      10.1299/jbse.23-00028

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Emergence of multiple set-points of cellular homeostatic tension2023

    • Author(s)
      Ueda Yuika、Deguchi Shinji
    • Journal Title

      Journal of Biomechanics

      Volume: 151 Pages: 111543~111543

    • DOI

      10.1016/j.jbiomech.2023.111543

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CM‐FRAP - Continuum Mechanics‐Based Fluorescence Recovery After Photobleaching2023

    • Author(s)
      Saito Takumi、Deguchi Shinji
    • Journal Title

      Current Protocols

      Volume: 3 Pages: e655

    • DOI

      10.1002/cpz1.655

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Long-term fluorescence recovery after photobleaching (FRAP)2023

    • Author(s)
      Saito, T., Matsunaga, D., Deguchi, S.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2600 Pages: 311-322

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2851-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Analyzing cellular mechanical homeostasis and adaptation2023

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Wrinkle force microscopy: Predicting cell mechanics from images2023

    • Author(s)
      Shinji Deguchi, Honghan Li, Daiki Matsunaga
    • Organizer
      6th Japan-Switzerland Workshop on Biomechanics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ストレスファイバーの張力恒常性と老化2023

    • Author(s)
      出口真次, Pirawan Chantachotikul, 松元瑛司
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Role of stress fibers in cellular adaptation and senescence2023

    • Author(s)
      Shinji Deguchi
    • Organizer
      QBIO/PEB Seminar, Yale University
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞老化のプロテオーム解析2023

    • Author(s)
      出口真次, Pirawan Chantachotikul
    • Organizer
      第62回日本生体医工学会
    • Invited
  • [Remarks] 大阪大学大学院基礎工学研究科・出口研究室

    • URL

      http://mbm.me.es.osaka-u.ac.jp

URL: 

Published: 2024-12-25  

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