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2023 Fiscal Year Annual Research Report

スクランブラーゼの作用機構とフリッパーゼの基質特異性の解明

Research Project

Project/Area Number 21H04770
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

長田 重一  大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任教授(常勤) (70114428)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 瀬川 勝盛  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (20542971)
櫻木 崇晴  大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任助教(常勤) (10867906)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2024-03-31
Keywordsフリッパーゼ / スクランブラーゼ / リン脂質 / 三次構造 / 基質特異性
Outline of Annual Research Achievements

脂質二重層からなる細胞膜においてリン脂質は外層と内層で非対称的に分布している。特に、フォスファチジルセリン(PtdSer)はATP依存的に作用するフリッパーゼによりその全てが細胞膜内層に局在する。このリン脂質の非対称的な局在はアポトーシスや細胞融合、活性化された血小板などさまざまな生物現象で崩壊、暴露されたPtdSerがシグナル分子として作用する。このリン脂質の非対称性を崩壊させる分子としてリン脂質ATP非依存的に通過させるスクランブラーゼが考えられていた。私達は これまでに、2個のP4-ATPases(ATP11AとATP11C)を細胞膜に存在するフリッパーゼとして、TMEM16FおよびXKR8をCa2+あるいはアポトーシス時に活性化されるカスパーゼによって活性化されるスクランブラーゼとして同定した。そして、XKR8はBasiginと呼ばれるType I 膜タンパク質と会合していることを突き止めた後、XKR8-Basigin複合体の構造をCryo-EM法を用いて解析した。その結果、XKR8の分子内部に親水性のアミノ酸が階段状に配置されていることを見出し、リン脂質がこれらアミノ酸をstepping stoneとして通過する可能性を指摘した。本年度、XKR8-Basigin複合体を ナノデイスク(脂質二重層をスキャフォールドタンパク質MSPで固定した構造物)に包埋後、CryoEM法によりその構造を解析した。その結果、XKR8のC-末端部位が分子の底辺にプラグのように結合、分子がスクランブラーゼとして作用することを抑制していることが判明した。実際、このプラグ部位に点変異を導入するとその変異体は構成的にスクランブラーゼ活性を示した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 7 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Cloning of human Type I interferon cDNAs2024

    • Author(s)
      Nagata, S.
    • Journal Title

      Proceedings of the Japan Academy, Series B

      Volume: 100 Pages: 1~14

    • DOI

      10.2183/pjab.100.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The role of the C-terminal tail region as a plug to regulate XKR8 lipid scramblase2024

    • Author(s)
      Sakuragi, T., Kanai, R., Otani, M., Kikkawa, M., Toyoshima, C., Nagata, S.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 300 Pages: 105755~105755

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2024.105755

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Regulation of phospholipid distribution in the lipid bilayer by flippases and scramblases2023

    • Author(s)
      Sakuragi, T., Nagata, S.
    • Journal Title

      Nature Reviews Molecular Cell Biology

      Volume: 24 Pages: 576~596

    • DOI

      10.1038/s41580-023-00604-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Regulation of phospholipid distribution in the lipid bilayer by flippases and scramblases2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      第2回国際臨床免疫シンポジウム (鎌倉)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ブタの肝臓から50年2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      第1回「AKIRA塾」(大阪)
    • Invited
  • [Presentation] Regulation of phospholipid distribution by flippase and scramblase2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      The 3rd Japan and Australia Meeting on Cell Death 2023(Melbourne, Australia)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 細胞膜フリッパーゼとスクランブラーゼとその異常2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      実験動物中央研究所 講演会(横浜)
    • Invited
  • [Presentation] 生化学に魅せられた50年ー豚の肝臓から細胞の死2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      大隅基礎科学創成財団 第7期 第1回創発セミナー(On-line)
    • Invited
  • [Presentation] Regulation of phospholipid distribution in the lipid bilayer by flippases and scramblases2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      The 18th International Symposium of The Institute Network for Biomedical Sciences(Tokyo)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 生化学に魅せられて2023

    • Author(s)
      長田 重一
    • Organizer
      第96回日本生化学会大会(福岡)
    • Invited
  • [Remarks] 長田重一研究室

    • URL

      http://biochemi.ifrec.osaka-u.ac.jp/

  • [Remarks] 大阪大学免疫学フロンティア研究センター News & Topics Research

    • URL

      https://www.ifrec.osaka-u.ac.jp/jpn/research/20230512-0800.htm

URL: 

Published: 2024-12-25  

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