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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Studying co-evolution of flowering time diversification and delayed fertilization in Fagaceae

Research Project

Project/Area Number 21H04781
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

佐竹 暁子  九州大学, 理学研究院, 教授 (70506237)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 金岡 雅浩  名古屋大学, 理学研究科, 講師 (10467277)
三輪 京子  北海道大学, 地球環境科学研究院, 准教授 (50570587)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2025-03-31
Keywords植物フェノロジー / 受精遅延 / ブナ科 / 環境応答 / 遺伝子発現 / ゲノム / 花粉管
Outline of Annual Research Achievements

引き続き福岡県に分布するマテバシイ属マテバシイ(2年成)とアラカシ(1年成)を対象に同一環境に生息し、開花時期と受精遅延期間が異なるブナ科樹木近縁種ペアを対象に、野外トランスクリプトーム解析を実施した。前年度に解読されたアラカシとマテバシイゲノムの遺伝子予測において、複数の重要な遺伝子が予測されていないという問題があったため、より精度の高い遺伝子予測を行った結果、それぞれゲノムサイズは800から900Mbであり遺伝子数は39,750個と34,059個であると予測された。OrthoFinderを用いてオルソログを推定した結果、アラカシとマテバシイの遺伝子のうち半数以上が1:1ペアのオルロログであることが明らかとなった。この1:1ペアの遺伝子を対象に、野外における遺伝子発現ダイナミクスの種間比較を実施することにした。日本には1年成のマテバシイ属は分布していないが、台湾南部には1年成マテバシイの小規模な集団が存在する。今年度は台湾との共同研究として調査を開始し、台湾に生息する1年成マテバシイを対象とした貴重なサンプルの採取を実施した。さらに、マテバシイとアラカシの雌花を解剖し切片の作成・観察を進めることで、花粉管のイメージングを実施した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

・国内のフィールド調査と遺伝子発現解析は引き続き順調に進んでいる。
・台湾に生息する1年成マテバシイを対象としたフィールド調査を順調に推進している。
・極めて硬い雌花を対象とした切片の作成は困難であったが、実験プロセスを工夫することで花粉管のイメージングが可能となった。

Strategy for Future Research Activity

マテバシイとアラカシの花粉管のイメージングの準備が整ったため、本成果をもとに異なる季節に採取されたより多くのサンプルを用いた分析を実施する。シリブカガシやスダジイへも対象を広げた種間比較を行うことで、花粉管が伸長を停止するタイミングと場所を特定する。

  • Research Products

    (13 results)

All 2023 2022

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Latitudinal cline of flowering and fruiting phenology in Fagaceae in Asia2023

    • Author(s)
      Quenta Araye, Tetsukazu Yahara, Akiko Satake
    • Journal Title

      bio TROPICA

      Volume: 55 Pages: 277-285

    • DOI

      10.1111/btp.13184

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Seasonal gene-expression signatures of delayed fertilization in Fagaceae2023

    • Author(s)
      Akiko Satake, Kayoko Ohta, Noriko Takeda-Kamiya, Kiminori Toyooka, Junko Kusumi
    • Journal Title

      Molecular Ecology

      Volume: 32 Pages: 4801-4813

    • DOI

      10.1101/2023.03.02.530775

  • [Journal Article] Impacts of climate change on reproductive phenology in tropical rainforests of Southeast Asia2022

    • Author(s)
      Shinya Numata, Koharu Yamaguchi, Masaaki Shimizu, Gen Sakurai, Ayaka Morimoto, Noraliza Alias, Nashatul Zaimah Noor Azman, Tetsuro Hosaka, Akiko Satake
    • Journal Title

      communications biology

      Volume: 10:11 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/s42003-022-03245-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] MASTREE+: Time-series of plant reproductive effort from six continents2022

    • Author(s)
      Andrew Hacket-Pain, Jessie J. Foest, Ian S. Pearse, Jalene M. LaMontagne, Walter D. Koenig, Giorgio Vacchiano, Michal Bogdziewicz, Thomas Caignard, Paulina Celebias, Joep van Dormolen, Marcos Fernandez-Martinez, Jose V. Moris, Ciprian Palaghianu, Mario Pesendorfer, Akiko Satake
    • Journal Title

      Global Change Biology

      Volume: 28 Pages: 3066-3082

    • DOI

      10.1111/gcb.16130

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Resource allocation strategies in the reproductive organs of Fagaceae species2022

    • Author(s)
      Yufei Wang, Qingmin Han, Kaoru Kitajima, Hiroko Kurokawa, Takuya Shimada, Tamaho Yamaryo, Daisuke Kabeya, Tatsuro Kawasaki, Akiko Satake
    • Journal Title

      ECOLOGICAL RESEARCH

      Volume: 38 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1111/1440-1703.12350

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Analyses of gene copy number variation in diverse epigenetic regulatory gene families across plants: Increased copy numbers of BRUSHY1/TONSOKU/MGOUN3 (BRU1/TSK/MGO3) and SILENCING DEFECTIVE 3 (SDE3) in long-lived trees2022

    • Author(s)
      Yuta Aoyagi Blue, Akiko Satake
    • Journal Title

      Plant Gene

      Volume: 32 Pages: 100384

    • DOI

      10.1016/j.plgene.2022.100384

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Molecular phenology in trees2022

    • Author(s)
      Akiko Satake
    • Organizer
      PHENOLOGY 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A cross-scale approach toward a mechanistic understanding of plant phenology2022

    • Author(s)
      Akiko Satake
    • Organizer
      INTECOL
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 気候変動下にある森林生態系の分子フェノロジー2022

    • Author(s)
      佐竹暁子
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Invited
  • [Presentation] 温暖化に伴う開花フェノロジーシフト:鍵となる春化とジベレリン合成経路2022

    • Author(s)
      幸元秀行、秦有輝、経塚淳子、梶田結衣、遠山弘法、永濱藍、佐竹暁子
    • Organizer
      第54回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] ブナ科コナラ属の1年成・2年成はどちらが祖先形質か?2022

    • Author(s)
      夫婦石千尋、今井亮介、矢原徹一、佐竹暁子
    • Organizer
      第54回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] Integration of Theoretical and Empirical Approaches on Starch Metabolism to Unravel the Adaptive Mechanism for Seasonal Environment in Plants2022

    • Author(s)
      Shuichi Kudo, Anthony Artins, Carolina Bello, Camila Caldana, Akiko Satake
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] ブナ科コナラ属の1年成・2年成はどちらが祖先形質か?2022

    • Author(s)
      夫婦石千尋、今井亮介、矢原徹一、佐竹暁子
    • Organizer
      第70回日本生態学会大会

URL: 

Published: 2024-12-25  

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