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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Manipulation of G12/13 signaling and and drug development strategy

Research Project

Project/Area Number 21H04791
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

井上 飛鳥  東北大学, 薬学研究科, 教授 (50525813)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 英明  東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (80805961)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2025-03-31
KeywordsGPCR / DREADD
Outline of Annual Research Achievements

G12共役型デザイナーGPCR(G12D)を肝細胞特異的に発現させたHep-G12Dマウスの個体レベルの代謝変化について、代謝ケージを用いて酸素消費量と二酸化炭素排出量を測定した。デザイナーリガンドを1週間前処置したHep-G12Dマウスにおいて呼吸商が低下していたことから、エネルギー源として脂質が使われることがわかった。ミトコンドリア活性が上昇していることを想定し、デザイナーリガンドを投与したHep-G12Dマウスの肝臓からミトコンドリアを単離し、電子伝達系複合体の活性を測定した。その結果、複合体IVの活性上昇が確認された。さらに、肝臓のRNA-seq解析を行ったところ、酸化的リン酸化が有意に変動する経路として見出された。G12Dを脂肪細胞に特異的に発現させたAdipo-G12Dマウスについて、初代培養脂肪細胞のベージュ誘導系を試したところ、個体での表現型と同様に、デザイナーリガンド処置により脱分化因子Ucp1の発現上昇が見られた。シグナル阻害剤を試したところ、G12経路下流のROCK阻害剤でUcp1発現が抑制された。
アセチルコリンM1受容体とGq複合体の構造情報から、M1骨格デザイナーGPCR(M1D-G12)とGタンパク質のC末端ヘリックスの複合体の分子動力学計算を行ったところ、G12とG13のC末端の結合様式に差異が見られた。Gタンパク質の点置換コンストラクトによる変異体解析により、G12とG13の選択性に関わるGタンパク質の残基を絞り込んだ。さらに、受容体側の変異体解析を行い、G12とG13の活性バランスが変化する変異体を見出した。GPCRの構造解析については、性状のよいFFAR2コンストラクトを構築することができ、Giとの安定的な複合体形成が観察された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画に沿って研究を実施し、計画通りの研究成果を得ることができた。当初計画外の成果として、GPCRとGタンパク質の共役選択性のインフォマティクス解析(Matic et al., Nucleic Acids Research 2022; Hauser et al., eLife 2022)、アレスチンの機能制御(Janetzko et al., Cell 2022)、Gs/G13共役型受容体GPR174の構造解析、Giサブタイプ選択性の解析手法の確立(Ono et al., Commun Biol 2023)などの成果を得た。

Strategy for Future Research Activity

Hep-G12Dマウスについて全身でのエネルギー変化が観察されたことから、肝臓におけるG12D活性化により、肝臓由来の代謝制御ホルモンが産生されるという仮説を立て、ヘパトカインに着目した解析を行う。また、肝臓からのリポタンパク質分泌についての解析を進め、初代培養細胞でG12D活性化によるリポタンパク質分泌を評価する実験系を構築する。Adipo-G12Dマウスにおける脂肪細胞のベージュ化について、個体レベルの熱産生に与える役割を寒冷刺激や高脂肪負荷時の体重増減を指標に解析を進める。また、表皮G12D発現マウスを作出し、表皮におけるG12シグナルの機能を探索する。
G13共役型DREADDの開発については、前年度に得られた構造情報を元にした変異体解析を進める。最近報告されたM3D-Gq構造を元にしたG12Dの分子動力学計算を実施する。FFAR2及び他の脂質受容体の構造解析を進め、G12/G13を含めたGタンパク質選択性の構造基盤の解析に取り組む。

  • Research Products

    (26 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (17 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Peer Reviewed: 17 results,  Open Access: 11 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Stanford University/Thomas Jefferson University/Indiana University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Stanford University/Thomas Jefferson University/Indiana University
  • [Int'l Joint Research] Chinese University of Hong Kong/Harbin Institute of Technology(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Chinese University of Hong Kong/Harbin Institute of Technology
  • [Int'l Joint Research] Indian Institute of Technology, Kanpur(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      Indian Institute of Technology, Kanpur
  • [Int'l Joint Research] Scuola Normale Superiore(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      Scuola Normale Superiore
  • [Int'l Joint Research] University of Copenhagen(デンマーク)

    • Country Name
      DENMARK
    • Counterpart Institution
      University of Copenhagen
  • [Journal Article] Ectodomain shedding of EGFR ligands serves as an activation readout for TRP channels2023

    • Author(s)
      Tatsumi Manae、Kishi Takayuki、Ishida Satoru、Kawana Hiroki、Uwamizu Akiharu、Ono Yuki、Kawakami Kouki、Aoki Junken、Inoue Asuka
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 18 Pages: e0280448

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0280448

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural and dynamic insights into supra-physiological activation and allosteric modulation of a muscarinic acetylcholine receptor2023

    • Author(s)
      Xu Jun、Wang Qinggong、Hubner Harald、Hu Yunfei、Niu Xiaogang、Wang Haoqing、Maeda Shoji、Inoue Asuka、Tao Yuyong、Gmeiner Peter、Du Yang、Jin Changwen、Kobilka Brian K.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Pages: 376

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35726-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Generation of Gαi knock-out HEK293 cells illuminates Gαi-coupling diversity of GPCRs2023

    • Author(s)
      Ono Yuki、Kawakami Kouki、Nakamura Gaku、Ishida Satoru、Aoki Junken、Inoue Asuka
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 112

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04465-2

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural basis of lysophosphatidylserine receptor GPR174 ligand recognition and activation2023

    • Author(s)
      Liang Jiale、Inoue Asuka、Ikuta Tatsuya、Xia Ruixue、Wang Na、Kawakami Kouki、Xu Zhenmei、Qian Yu、Zhu Xinyan、Zhang Anqi、Guo Changyou、Huang Zhiwei、He Yuanzheng
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Pages: 1012

    • DOI

      10.1038/s41467-023-36575-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification and Functional Characterization of Fungal Chalcone Synthase and Chalcone Isomerase2023

    • Author(s)
      Furumura Sho、Ozaki Taro、Sugawara Akihiro、Morishita Yohei、Tsukada Kento、Ikuta Tatsuya、Inoue Asuka、Asai Teigo
    • Journal Title

      Journal of Natural Products

      Volume: 86 Pages: 398~405

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.2c01027

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phenotypic evaluation of constitutive GPCR/G-protein signaling in zebrafish embryos and larvae2022

    • Author(s)
      Shibata Takeaki、Kawakami Kouki、Kawana Hiroki、Aoki Junken、Inoue Asuka
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 602 Pages: 70~76

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.02.098

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Common coupling map advances GPCR-G protein selectivity2022

    • Author(s)
      Hauser Alexander S、Avet Charlotte、Normand Claire、Mancini Arturo、Inoue Asuka、Bouvier Michel、Gloriam David E
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 11 Pages: e74107

    • DOI

      10.7554/eLife.74107

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Activation and allosteric regulation of the orphan GPR88-Gi1 signaling complex2022

    • Author(s)
      Chen Geng、Xu Jun、Inoue Asuka、Schmidt Maximilian F.、Bai Chen、Lu Qiuyuan、Gmeiner Peter、Liu Zheng、Du Yang
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 2375

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30081-5

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cryo-EM structures of the β3 adrenergic receptor bound to solabegron and isoproterenol2022

    • Author(s)
      Nureki Ikko、Kobayashi Kazuhiro、Tanaka Tatsuki、Demura Kanae、Inoue Asuka、Shihoya Wataru、Nureki Osamu
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 611 Pages: 158~164

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.04.065

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Effect of Ligands and Transducers on the Neurotensin Receptor 1 Conformational Ensemble2022

    • Author(s)
      Dixon Austin D.、Inoue Asuka、Robson Scott A.、Culhane Kelly J.、Trinidad Jonathan C.、Sivaramakrishnan Sivaraj、Bumbak Fabian、Ziarek Joshua J.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 144 Pages: 10241~10250

    • DOI

      10.1021/jacs.2c00828

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] PRECOGx: exploring GPCR signaling mechanisms with deep protein representations2022

    • Author(s)
      Matic Marin、Singh Gurdeep、Carli Francesco、De Oliveira Rosa Natalia、Miglionico Pasquale、Magni Lorenzo、Gutkind J. Silvio、Russell Robert、Inoue Asuka、Raimondi Francesco
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 50 Pages: W598~W610

    • DOI

      10.1093/nar/gkac426

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure of the human galanin receptor 2 bound to galanin and Gq reveals the basis of ligand specificity and how binding affects the G-protein interface2022

    • Author(s)
      Heo Yunseok、Ishimoto Naito、Jeon Ye-Eun、Yun Ji-Hye、Ohki Mio、Anraku Yuki、Sasaki Mina、Kita Shunsuke、Fukuhara Hideo、Ikuta Tatsuya、Kawakami Kouki、Inoue Asuka、Maenaka Katsumi、Tame Jeremy R. H.、Lee Weontae、Park Sam-Yong
    • Journal Title

      PLOS Biology

      Volume: 20 Pages: e3001714

    • DOI

      10.1371/journal.pbio.3001714

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Endogenous ligand recognition and structural transition of a human PTH receptor2022

    • Author(s)
      Kobayashi Kazuhiro、Kawakami Kouki、Kusakizako Tsukasa、Miyauchi Hirotake、Tomita Atsuhiro、Kobayashi Kan、Shihoya Wataru、Yamashita Keitaro、Nishizawa Tomohiro、Kato Hideaki E.、Inoue Asuka、Nureki Osamu
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 82 Pages: 3468~3483

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2022.07.003

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Allosteric modulation of GPCR-induced β-arrestin trafficking and signaling by a synthetic intrabody2022

    • Author(s)
      Baidya Mithu、Chaturvedi Madhu、Dwivedi-Agnihotri Hemlata、Ranjan Ashutosh、Devost Dominic、Namkung Yoon、Stepniewski Tomasz Maciej、Pandey Shubhi、Baruah Minakshi、Panigrahi Bhanupriya、Sarma Parishmita、Yadav Manish K.、Maharana Jagannath、Banerjee Ramanuj、Kawakami Kouki、Inoue Asuka、et al
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 4634

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32386-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural insights into the G protein selectivity revealed by the human EP3-Gi signaling complex2022

    • Author(s)
      Suno Ryoji、Sugita Yukihiko、Morimoto Kazushi、Takazaki Hiroko、Tsujimoto Hirokazu、Hirose Mika、Suno-Ikeda Chiyo、Nomura Norimichi、Hino Tomoya、Inoue Asuka、Iwasaki Kenji、Kato Takayuki、Iwata So、Kobayashi Takuya
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Pages: 111323~111323

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111323

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Enhanced membrane binding of oncogenic G protein αqQ209L confers resistance to inhibitor YM-2548902022

    • Author(s)
      Randolph Clinita E.、Dwyer Morgan B.、Aumiller Jenna L.、Dixon Alethia J.、Inoue Asuka、Osei-Owusu Patrick、Wedegaertner Philip B.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102538~102538

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102538

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Membrane phosphoinositides regulate GPCR-β-arrestin complex assembly and dynamics2022

    • Author(s)
      Janetzko John、Kise Ryoji、Barsi-Rhyne Benjamin、Siepe Dirk H.、Heydenreich Franziska M.、Kawakami Kouki、Masureel Matthieu、Maeda Shoji、Garcia K. Christopher、von Zastrow Mark、Inoue Asuka、Kobilka Brian K.
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 185 Pages: 4560~4573

    • DOI

      10.1016/j.cell.2022.10.018

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 結合様式の違いによる beta アレスチンの機能的、構造的差異2022

    • Author(s)
      桑原 莉来、川上 耕季、井上 飛鳥
    • Organizer
      日本生化学会東北支部第88回例会
  • [Presentation] G12共役型DREADDを用いたG12シグナルの脂肪肝抑制作用の評価とその機構解析2022

    • Author(s)
      荒井魁斗、小野雄基、井上飛鳥
    • Organizer
      第17回 GPCR研究会
  • [Presentation] デザイナーGPCRを用いたG12シグナルの表皮における機能解析2022

    • Author(s)
      平井夏実、古川史歩、小野雄基、井上飛鳥
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
  • [Remarks] 東北大学分子細胞生化学分野ホームページ

    • URL

      http://www.pharm.tohoku.ac.jp/~seika/2020/index.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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