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2022 Fiscal Year Annual Research Report

ヒト骨発生機構の理解に基づく組織再生研究基盤の構築

Research Project

Project/Area Number 21H04952
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

鄭 雄一  東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (30345053)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大庭 伸介  大阪大学, 大学院歯学研究科, 教授 (20466733)
酒井 崇匡  東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 教授 (70456151)
北條 宏徳  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 准教授 (80788422)
Project Period (FY) 2021-04-05 – 2025-03-31
Keywords骨再生 / 幹細胞 / 一細胞解析
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ヒト骨発生機構の理解に基づく骨再生研究基盤の構築を目指し、以下の4つのプロジェクトを遂行する:1.ヒト骨発生機構の解析、2.ヒト骨発生制御シグナル因子群の抽出、3.シグナル因子群の機能・階層性の検証、4.ヒト骨再生性シグナルと足場材料の統合と骨欠損モデルを用いたPOC検証。
本年度は昨年度に引き続き上記1,2のプロジェクトを進めた。当研究室で開発したヒト多能性幹細胞由来三次元骨組織を用いた遺伝子制御ネットワークの解析を行った。ヒト多能性幹細胞から椎板細胞(骨軟骨前駆細胞)へのStepwise分化誘導と、誘導細胞の免疫不全マウス腎被膜下への移植により三次元骨組織を誘導する。誘導した骨組織から細胞を回収した後、細胞核を抽出し、一細胞マルチオーム解析(Single Cell RNA-seq+Single Cell ATAC-seq)を行った。本解析では、クロマチン状態と遺伝子発現を一細胞単位で同時に検出することが可能である。クロマチンが開いている状態は、遺伝子発現を正に制御するエンハンサー活性と高い相関があることから、ヒト骨発生におけるダイナミックなエンハンサー活性と遺伝子発現機構の解明に取り組んだ。マルチモーダルなクラスタリング解析により、骨組織に存在する骨格前駆細胞、軟骨・肥大軟骨細胞、骨芽細胞に相当する10の細胞集団の特徴を明らかにした。得られた細胞種特異的なシグナルー転写因子群を同定するため、オープンクロマチン領域におけるモチーフ活性と遺伝子発現を統合解析し、有意水準以上の転写因子群と関連するシグナル因子を抽出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定通り有望因子の絞り込みが進んでいる。これまでの研究成果も発表できた。

Strategy for Future Research Activity

計画通り有望因子の機能解析実験を中心に研究を進める。

  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] 南カリフォルニア大学/コネティカット大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      南カリフォルニア大学/コネティカット大学
  • [Journal Article] Stem cell-based modeling and single-cell multiomics reveal gene-regulatory mechanisms underlying human skeletal development2023

    • Author(s)
      Tani Shoichiro、Okada Hiroyuki、Onodera Shoko、Chijimatsu Ryota、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Xin Xiaonan、Rowe David W.、Saito Taku、Tanaka Sakae、Chung Ung-il、Ohba Shinsuke、Hojo Hironori
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 112276~112276

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112276

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell?cell interactions underlying the bone repair process2022

    • Author(s)
      Nakayama Mika、Okada Hiroyuki、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Chung Ung-il、Ohba Shinsuke、Hojo Hironori
    • Journal Title

      Regenerative Therapy

      Volume: 21 Pages: 9~18

    • DOI

      10.1016/j.reth.2022.05.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Sp7 Action in the Skeleton: Its Mode of Action, Functions, and Relevance to Skeletal Diseases2022

    • Author(s)
      Hojo Hironori、Ohba Shinsuke
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 23 Pages: 5647~5647

    • DOI

      10.3390/ijms23105647

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Runx2 regulates chromatin accessibility to direct the osteoblast program at neonatal stages2022

    • Author(s)
      Hojo Hironori、Saito Taku、He Xinjun、Guo Qiuyu、Onodera Shoko、Azuma Toshifumi、Koebis Michinori、Nakao Kazuki、Aiba Atsu、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Okada Hiroyuki、Tanaka Sakae、Chung Ung-il、McMahon Andrew P.、Ohba Shinsuke
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 40 Pages: 111315~111315

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111315

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Orally administrable peptides derived from egg yolk promote skeletal repair and ameliorate degenerative skeletal disorders in mouse models2022

    • Author(s)
      Kitaura Yoshiaki、Nakamura Utano、Awada Chihiro、Yamaguchi Motonori、Kim Mujo、Ikeda Yuki、Matsuo Yuki、Moriishi Takeshi、Sawase Takashi、Chung Ung-il、Hojo Hironori、Ohba Shinsuke
    • Journal Title

      Regenerative Therapy

      Volume: 21 Pages: 584~595

    • DOI

      10.1016/j.reth.2022.11.002

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Elucidating gene regulatory mechanisms underlying human skeletal development using human pluripotent stem cell-derived bone tissuesand single-cell multiome analysis2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Taku Saito, Sakae Tanaka, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      ECTS 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ELUCIDATING GENE REGULATORY NETWORKS UNDERLYING HUMAN SKELETAL DEVELOPMENT BY INTEGRATING SINGLE-CELL DYNAMICS OF CHROMATIN ACCESSIBILITY AND GENE EXPRESSION2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      ISSCR 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidating Gene Regulatory Networks Underlying Human Skeletal Development by Integrating a Model of Human Endochondral Bones and Single-cell Multiomics2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Taku Saito, Sakae Tanaka, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      ASBMR 2022
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-12-25  

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