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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Generation and application of hPSC-derived bone organoids based on the human skeletal development

Research Project

Project/Area Number 21J12970
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

谷 彰一郎  東京大学, 大学院医学系研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2021-04-28 – 2023-03-31
Keywordsヒト多能性幹細胞 / 骨発生 / 軟骨内骨化 / シングルセル解析 / 遺伝子制御ネットワーク / ZEB2
Outline of Annual Research Achievements

ヒト多能性幹細胞を骨格の起源細胞の一つである沿軸中胚葉(椎板細胞)へ分化させたのちに免疫不全マウス腎皮膜下へ移植することでヒト細胞によって構成される骨組織を作出し、シングルセル解析を実施した。シングルセルRNA-seqに加えてATAC-seqも加えた、シングルセルMultiome解析による結果をさらに検証し、ヒトの骨発生における骨格細胞の遺伝子制御ネットワークについて検討した。各細胞種には独自ないしは共通する転写因子群が活性化していることが明らかとなり、細胞の運命決定や分化、機能維持において様々な転写因子が協調して機能していることが示唆された。一方でこの手法の場合、検出できる転写因子の数に限度があったことから、RNA velocity解析と細胞種特異的な発現遺伝子の組み合わせによって全ての転写因子の中から骨芽細胞分化に重要な因子の抽出を試み、神経や悪性腫瘍の領域では機能がよく知られているものの、骨組織における機能が明らかでなかったZEB2を同定した。ZEB2は骨領域において骨芽細胞のマスターレギュレーターであるRUNX2やSP7と共発現し、shRNAを用いたノックダウンをヒト間葉系幹細胞に行うと、骨芽細胞分化に重要な遺伝子群の発現が低下した。加えて、骨芽細胞特異的にZEB2を欠失させるノックアウトマウスを作出したところ、胎児期ないしは新生児期において骨格の低形成が特に頭顔面部(沿軸中胚葉および神経堤由来)において顕著であることが確認された。これらの結果は、ZEB2が骨発生過程において複数の転写因子群を制御する転写制御ネットワークの一端であることを示唆していると考えられた。以上の内容を国際・国内学会で報告するとともに、国際学術誌であるCell Reportsへ投稿・掲載した。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Stem cell-based modeling and single-cell multiomics reveal gene-regulatory mechanisms underlying human skeletal development2023

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Shoko Onodera, Ryota Chijimatsu, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Xiaonan Xin, David W. Rowe, Taku Saito, Sakae Tanaka, Ung-il Chung, Shinsuke Ohba, Hironori Hojo
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 112276

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112276

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヒト多能性幹細胞由来の3次元骨組織誘導とシングルセル・マルチオーム解析を用いたヒト骨形成機構の解明2022

    • Author(s)
      谷彰一郎、岡田寛之、関真秀、鈴木穣、斎藤琢、田中栄、鄭雄一、北條宏徳、大庭伸介
    • Organizer
      日本整形外科学会
  • [Presentation] 1細胞多層解析を用いたヒト骨発生における遺伝子制御ネットワークの解明2022

    • Author(s)
      谷彰一郎、岡田寛之、斎藤琢、田中栄、鄭雄一、北條宏徳、大庭伸介
    • Organizer
      日本骨代謝学会
  • [Presentation] Elucidating gene regulatory mechanisms underlying human skeletal development using human pluripotent stem cell-derived bone tissuesand single-cell multiome analysis2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Taku Saito, Sakae Tanaka, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      European Calcified Tissue Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ELUCIDATING GENE REGULATORY NETWORKS UNDERLYING HUMAN SKELETAL DEVELOPMENT BY INTEGRATING SINGLE-CELL DYNAMICS OF CHROMATIN ACCESSIBILITY AND GENE EXPRESSION2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      International Society for Stem Cell Research
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Elucidating Gene Regulatory Networks Underlying Human Skeletal Development by Integrating a Model of Human Endochondral Bones and Single-cell Multiomics2022

    • Author(s)
      Shoichiro Tani, Hiroyuki Okada, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Ung-il Chung, Hironori Hojo and Shinsuke Ohba
    • Organizer
      American Society for Bone and Mineral Research
    • Int'l Joint Research
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 椎板細胞の製造方法および該椎板細胞の利用2022

    • Inventor(s)
      大庭伸介 , 谷彰一郎 , 北條宏徳 , 鄭雄一
    • Industrial Property Rights Holder
      大庭伸介 , 谷彰一郎 , 北條宏徳 , 鄭雄一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2022/011216
    • Overseas

URL: 

Published: 2023-12-25  

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