2023 Fiscal Year Annual Research Report
日本産地衣類の総合的なデータベースの整備とウェブ公開
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21K01006
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| Research Institution | Natural History Museum and Institute, Chiba |
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Principal Investigator |
原田 浩 千葉県立中央博物館, その他部局等, 研究員(移行) (60250148)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
原 光二郎 秋田県立大学, 生物資源科学部, 准教授 (10325938)
坂田 歩美 千葉県立中央博物館, その他部局等, 研究員(移行) (40597324)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 地衣類 / 図鑑 / 博物館 / 標本 / DNAバーコーディング / 地衣成分 / データベース / LC-MS |
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| Outline of Annual Research Achievements |
日本産地衣類に関して，証拠標本を千葉県立中央博物館で保管しつつ，（１）ウェブ図鑑，（２）地衣成分（化学成分），（３）DNAの３つからなる総合的なデータベースを整備することを目的として本研究を実施した．
前年度までに野外調査を実施し収集した地衣類標本（千葉県立中央博物館で保管）約200点について，化学成分分析（予備実験としてTLC，本実験としてLC-MS）を進めデータの解析を進めるとともに，抽出後の残渣（地衣類片）からDNAの抽出を進め，次世代シーケンサーでの解析を進めた．また，これと並行して，標本の写真撮影，同定・分類学的検討を行った．
（１）ウェブ図鑑．撮影装置下および実体顕微鏡下での拡大写真を合わせて（更にその他の標本の写真を加え），ウェブ図鑑コンテンツ「日本の地衣類（ウェブ図鑑）」に600種以上の画像を掲載している（5年度末）．また，これらの種の記載を300種以上についてまとめた．本コンテンツの，サブコンテンツと関連コンテンツについても，同様に整備を進めた．図鑑を補足する分類等の論文として，13報を発表した．
（２） 地衣成分（化学成分）のデータベース．特に海岸生地衣類のなかでも，ダイダイゴケ科，ウメノキゴケ科，広義スミイボゴケ属についてLC-MSによる化学分析を行った．この成果は，本研究で公開したウェブコンテンツ「地衣成分」の中の「日本産地衣類の地衣成分データベース」への反映の準備を進めているところである．
（３）DNAデータベース．本件の収集標本（あるいは近年の）約400点の試料をLC/MS用として地衣成分を抽出後，残渣試料よりDNAを抽出し，菌類のDNAバーコード配列であるリボソームDNAのITS1またはITS2領域の配列を次世代シーケンサーにより決定した。得られた成果のうち，8科21属31種のDNA情報をウェブおよび公共データベース上で公開し，追加の公開を進めている．
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| Remarks |
本研究の成果として「日本の地衣類（ウェブ図鑑）」とサブコンテンツ，関連するコンテンツのウェブ図鑑を更新し，関連する専門用語を「地衣類って何？」に追加した．
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