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2022 Fiscal Year Research-status Report

ハイパーラマン分光法によるタンパク質二次構造研究の新展開

Research Project

Project/Area Number 21K04975
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

奥野 将成  東京大学, 大学院総合文化研究科, 准教授 (00719065)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords非線形分光法 / ハイパーラマン分光法 / 振動分光法 / 二次構造
Outline of Annual Research Achievements

当初の計画通りモデルペプチド水溶液を用いて、ハイパーラマン(HR)分光法による二次構造の判別可能性について研究を行った。水溶液のpHおよび温度を制御することにより、ペプチドの二次構造をα-ヘリックス、β-シート、ランダムコイルに調整したポリ-L-リシン(PLL)およびポリ-L-グルタミン酸(PLGA)を測定し、HR分光法により二次構造の判別が可能であるという結論を得ることができた。HRスペクトルにおいて、アミドI、II、III、およびCαH変角振動のピーク位置およびバンド幅が二次構造により異なることを初めて見出した。
得られたHRスペクトルを可視励起ラマンスペクトルおよび既報の紫外共鳴ラマンスペクトル、既報の赤外吸収スペクトルと比較し、HRスペクトルの特徴を抽出した。本研究で使用した515 nm励起HR分光では、紫外共鳴ラマンスペクトルと似通ったスペクトルパターンが得られた。これは、HR信号においてアミド結合のπ-π*遷移への二光子共鳴効果が支配的であることを意味している。一方、赤外・可視励起ラマンスペクトルとは全く異なった信号パターンを示し、HR分光法がこれらの分光法と相補的な手法として利用できることを示唆している。
さらに、アミドIバンドのピーク位置が赤外・ラマンスペクトルにおけるピーク位置よりも優位に高波数に観測されることを発見した。これは、おおきな双極子モーメントを持つアミドIバンドにおけるノンコインシデンス効果の結果であると解釈を行った。この結果はHR分光法では赤外・ラマン分光法とは異なるスペクトル情報を得られることを意味している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

モデルペプチドとして振動分光法で広く用いられているポリ-L-リシン(PLL)水溶液およびポリ-L-グルタミン酸(PLGA)水溶液を二次構造を変化させて測定し、ハイパーラマン分光法によって二次構造が判別可能であるという結果を得ることができた。これは計画通りの実験であり、順調に計画が進展していると判断できる。二次構造の判別可能性だけでなく、予期しなかったアミドIバンドの高波数シフトが発見できた。

Strategy for Future Research Activity

これまで順調に研究が推進されているため、計画通りにさらなるペプチド分子およびタンパク質水溶液のハイパーラマン分光法による測定を行う。芳香環を持つ分子の可視光励起ハイパーラマンスペクトルには、多光子蛍光に由来すると考えられる大きな信号によりハイパーラマン信号を埋没させてしまう可能性があるため、その対応を技術的に行うことを予定している。

  • Research Products

    (7 results)

All 2023 2022

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Is Unified Understanding of Vibrational Coupling of Water Possible? Hyper-Raman Measurement and Machine Learning Spectra2023

    • Author(s)
      Inoue Kazuki、Litman Yair、Wilkins David M.、Nagata Yuki、Okuno Masanari
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 14 Pages: 3063~3068

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.3c00398

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Hyper-Raman spectroscopy of benzene and pyridine revisited2022

    • Author(s)
      Inoue Kazuki、Morimoto Tenri、Yokogawa Daisuke、Okuno Masanari
    • Journal Title

      The Journal of Chemical Physics

      Volume: 157 Pages: 054505~054505

    • DOI

      10.1063/5.0099204

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Revival of hyper-Raman spectroscopy: polarization dependence and molecular structures2022

    • Author(s)
      奥野将成
    • Organizer
      2022年度日本分光学会年次講演会
    • Invited
  • [Presentation] ハイパーラマン分光法によるイオンの水和構造の研究2022

    • Author(s)
      井上一希、奥野将成
    • Organizer
      2022年度日本分光学会年次講演会
  • [Presentation] 水のハイパーラマン信号の特異な偏光依存性と非局在化した分子振動2022

    • Author(s)
      森本天麗、奥野将成
    • Organizer
      2022年度日本分光学会年次講演会
  • [Presentation] 井上一希、奥野将成2022

    • Author(s)
      ハイパーラマン分光法による高濃度酸水溶液の研究への応用
    • Organizer
      第16回分子科学討論会
  • [Presentation] 森本天麗、奥野将成2022

    • Author(s)
      液体の水の非局在化した分子振動のハイパーラマン分光による研究
    • Organizer
      第16回分子科学討論会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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