• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

Probing conformational changes in protein reaction sites via Raman optical activity

Research Project

Project/Area Number 21K04997
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

藤澤 知績  佐賀大学, 理工学部, 准教授 (60633493)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords低温ラマン光学活性分光 / 光受容タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

最終年度において、低温ラマン分光法を用いて種々の光受容体の反応中間体の計測を進めると同時に、これらの中間体を対象をしたラマン光学活性測定装置の開発を継続して行った。昨年度まで、低温ラマン測定の対象としたのは主に光駆動型のイオンポンプ等として働く微生物型ロドプシンや青色光センサーとして知られる光活性イエロータンパク質であったが、最終年度では動物型ロドプシンやシアノバクテリオクロムといった光受容体へと測定対象を広げた。シアノバクテリオクロムはテトラピロール発色団を結合した光受容体であり、この構造自由度の大きな発色団の解析には良質な振動スペクトルの取得が必要とされる。低温ラマン分光法によってシアノバクテリオクロムの一種であるRcaEの光反応中間体に対して、シグナル・ノイズ比の高いラマンスペクトルを取得可能であること示した。また、得られたスペクトルに基づいてRcaEの機能発現における分子機構を調査した。
上記の光受容タンパク質群の光反応中間体を対象とした低温ラマン光学活性装置の開発においては、液体窒素冷却型のクライオスタットを組み込んだラマン光学活性装置を製作し、実際に微生物型ロドプシン等の光受容タンパク質の中間体の測定を実施した。低温下で捕捉した初期中間体のラマン光学活性スペクトルに偽信号が含まれていないか、あるいは電子円二色性スペクトルとの整合性が取れるかといった観点から、得られたデータの信頼性を検討した。

  • Research Products

    (21 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] オクラホマ州立大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      オクラホマ州立大学
  • [Int'l Joint Research] チェコ科学アカデミー(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      チェコ科学アカデミー
  • [Journal Article] Near-Infrared Excited Raman Optical Activity as a Tool to Uncover Active Sites of Photoreceptor Proteins2024

    • Author(s)
      T. Fujisawa, M. Unno
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 128 Pages: 2228-2235

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.4c00094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Configurational Changes of Retinal Schiff Base during Membrane Na+ Transport by a Sodium Pumping Rhodopsin2024

    • Author(s)
      T. Fujisawa, K. Kinoue, R. Seike, T. Kikukawa, M. Unno
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 15 Pages: 1993-1998

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.3c03435

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Vibrations in Chiral Europium Complexes Revealed by Near-Infrared Raman Optical Activity2024

    • Author(s)
      T. Wu, P. Bour, T. Fujisawa, M. Unno
    • Journal Title

      Advanced Science

      Volume: 11 Pages: 2305521

    • DOI

      10.1002/advs.202305521

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spectroscopic Validation of Crystallographic Structures of a Protein Active Site by Chiroptical Spectroscopy2023

    • Author(s)
      T. Fujisawa, T. Shingae, J. Ren, S. Haraguchi, T. Hanamoto, W. D. Hoff, M. Unno
    • Journal Title

      The Journal of Physical Chemistry Letters

      Volume: 14 Pages: 9304-9309

    • DOI

      10.1021/acs.jpclett.3c01954

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Raman Optical Activity of Retinal Chromophore in Sensory Rhodopsin II2023

    • Author(s)
      K. Nishikawa, R. Kuroiwa, J. Tamogami, M. Unno, T. Fujisawa
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry B

      Volume: 127 Pages: 7244-7250

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c02391

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Raman optical activity spectroscopy of biological photoreceptors2024

    • Author(s)
      Tomotsumi Fujisawa
    • Organizer
      24th East Asian Workshop on Chemical Dynamics (EAWCD 2024)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Structure and Heterogeneity of Retinal Chromophore in Chloride Pump Rhodopsins Revealed by Raman Optical Activity2023

    • Author(s)
      Masashi Unno, Masaiku Ohya, Takashi Kikukawa, Junpei Matsuo, Takashi Tsukamoto, Ryota Nagaura, Tomotsumi Fujisawa
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Configurational change of retinal Schiff base chromophore in a sodium pump rhodopsin2023

    • Author(s)
      Tomotsumi Fujisawa, Kouta Kinoue, Ryouhei Seike, Takashi Kikukawa, Masashi Unno
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Structural analysis of the blue-absorbing form of blue/orange cyanobacteriochrome by Raman spectroscopy2023

    • Author(s)
      Ryoka Seto, Masako Hamada, Yuu Hirose, Tomotsumi Fujisawa, Masashi Unno
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Role of Lys261 in Cyanobacteriochrome RcaE Studied by Mutagenesis and Raman Spectroscopy2023

    • Author(s)
      Taisei Koga, Masako Hamada, Yuu Hirose, Tomotsumi Fujisawa, Masashi Unno
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Low-temperature spectroscopy of photoactive yellow protein from Rhodospirillum centenum2023

    • Author(s)
      Kirari Ogata, Tomotsumi Fujisawa, Wouter D Hoff, Masashi Unno
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] ラマン光学活性分光法を用いた センサリーロドプシンⅡの発色団コンフォメーションの研究2023

    • Author(s)
      藤澤知績,西川航平,黒岩亮介,田母神淳,海野雅司
    • Organizer
      第45回溶液化学シンポジウム
  • [Presentation] 低温ラマン分光法による Photoactive Yellow Proteinの L中間体の構造解析2023

    • Author(s)
      川崎翔太,藤澤知績, 海野雅司, Wouter D. Hoff
    • Organizer
      第45回溶液化学シンポジウム
  • [Presentation] Photoconversion mechanism of a green/red cyanobacteriochrome based on its molecular structure2023

    • Author(s)
      Tomotsumi Fujisawa
    • Organizer
      15th International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors in Photosynthetic Organisms
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Cryogenic Raman study of photoconversion from green to red absorbing state of the cyanobacteriochrome RcaE2023

    • Author(s)
      Yasuhiro Jyojima, Masako Hamada, Yuu Hirose, Masashi Unno, Tomotsumi Fujisawa
    • Organizer
      15th International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors in Photosynthetic Organisms
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] クライオ時間分解ラマン分光法によるナトリウムポンプロドプシンの研究: O中間体における発色団構造変化2023

    • Author(s)
      藤澤知績,木ノ上 晃汰,清家陵平,菊川 峰志,海野雅司
    • Organizer
      第17回分子科学討論会
  • [Presentation] Cryogenic Raman study of primary photointermediate of photoactive yellow protein2023

    • Author(s)
      Tomotsumi Fujisawa, Daisuke Shiga, Akihiro Baba, Wouter D. Hoff, Masashi Unno
    • Organizer
      8th Asian Spectroscopy Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Raman optical activity spectroscopy for measuring chromophore conformations in biological photoreceptors2023

    • Author(s)
      Tomotsumi Fujisawa
    • Organizer
      3rd Q-PIT photofunction integration symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 佐賀大学 海野-藤澤研究室

    • URL

      http://biophysics.chem.saga-u.ac.jp/unno-lab/homu.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi