Development of an analysis method for protein-protein interactions using the cell surface as a sensing platform

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K05130
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 34020:Analytical chemistry-related
• Research Institution: Kyushu Institute of Technology
• Principal Investigator: Sueda Shinji 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授 (00325581)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: タンパク質相互作用解析 / 蛍光イメージング / 培養細胞 / 平衡結合解析

Outline of Final Research Achievements

In the present work, we have developed an analysis method for protein-protein interactions using the cells surface as a sensing platform. In this method, the target protein was displayed on the cell surface by expressing it as a fusion protein with a membrane protein, while its binding partner labeled with a fluorescent dye was applied on the cell surface harboring the target protein. The binding analysis was conducted by monitoring the fluorescence from the labeled protein on the cell surface. With this method, we successfully obtained a binding parameter of a protein-protein interaction by equilibrium analysis based on the fluorescence imaging data.

Free Research Field

生物分析化学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

タンパク質間の詳細な相互作用解析には一般にセンサーチップをベースとした分析手法が活用されているが、この場合、タンパク質を固定化したセンサーチップをうまく調製できない場合があり、このことが解析の妨げとなっている。本手法では培養細胞の表層に標的タンパク質を提示し、その培養細胞の表層でそのまま相互作用解析を実施するため、センサーチップ上への固定化が困難なタンパク質についても解析を行うことが可能である。したがって本手法はこれまで詳細な相互作用解析データの取得が困難であった系に対して有効な解析手法になり得るものと期待される。