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2022 Fiscal Year Research-status Report

ストレス応答欠如による根の伸長阻害を回復した突然変異植物の遺伝子機能解析

Research Project

Project/Area Number 21K05524
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

金 俊植  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (60769610)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsNOBIRO / 小胞体ストレス応答 / 根の身長制御 / ストレス応答性成長制御
Outline of Annual Research Achievements

この研究の目標は、3つのnobiro変異系統の原因変異を単離し、その分子生物学的メカニズムを解明することです。今年度は、①前年度に発見されたnobiro1原因変異候補を証明するために多重変異株を作成し、②nobiro9の原因遺伝変異を探索して多重変異株を作成し、そして③「先進ゲノム支援」の支援を受けて、本課題の対象ではないnobiro系統の原因変異を発見しました。
① nobiro1原因変異の候補を証明するために、bz1728とnobiro1を含む三重機能欠損変異株bz1728nbr1を作成しました。そのために、T-DNA挿入によるnobiro1単一機能欠損変異株とbz1728の交雑、またはnobiro1遺伝子をターゲットにしたbz1728植物へのCRISPR/Cas9ゲノム編集を行いました。bz1728nbr1の根の伸長成長をbz1728やnobiro1単一変異株と比較することで多重変異の効果を評価しました。その結果、bz1728nbr1の根はbz1728よりも長く、nobiro1と同程度の伸長成長を示したため、発見した遺伝変異が単一原因変異であることが証明されました。
② nobiro9についても、nobiro1と同様の研究を行いました。その結果、三重変異株bz1728nbr9の根はbz1728よりも長かったものの、nobiro9よりも短い伸長成長を示しました。この結果から、nobiro9の原因変異は単一(nbr9-1)ではなく、他の原因変異も存在することが示唆されました。
③本研究課題を基盤に、先進ゲノム支援の支援を受けて、他の7つのnobiro系統の原因遺伝変異を探索しました。その結果、5つのnobiro系統から論理的に合致する原因変異を発見しました。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

上記概要で記載しました通り、本研究は当初の研究計画に沿って順調な進捗を示しています。

Strategy for Future Research Activity

先に解析を一段落させたnobiro6の例を参考にして、nobiro1およびnobiro9-1の根の伸長成長を裏付ける遺伝解析を行います。明らかになった原因遺伝子の既知の分子活性に基づき、網羅的な遺伝子発現解析をはじめとする機能解析を行います。さらに、他のnobiro系統の候補変異を証明するために、遺伝学的実験を行います。

Causes of Carryover

想定以上に長引くコロナ禍による旅行制限のため、予定していた国内外の出張が叶いませんでした。発生した次年度使用額は、これから解除が見込まれる国内出 張費に充てます。

  • Research Products

    (1 results)

All 2022

All Journal Article (1 results)

  • [Journal Article] ER Stress and the Unfolded Protein Response: Homeostatic Regulation Coordinate Plant Survival and Growth2022

    • Author(s)
      Kim June-Sik、Mochida Keiichi、Shinozaki Kazuo
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 11 Pages: 3197~3197

    • DOI

      10.3390/plants11233197

URL: 

Published: 2023-12-25  

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