2023 Fiscal Year Research-status Report

Searching CMS causative gene and identifying fertility restorer gene in citrus

Research Project

Project/Area Number	21K05570
Research Institution	National Agriculture and Food Research Organization
Principal Investigator	後藤新悟国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 果樹茶業研究部門, 上級研究員 (60433215)
Project Period (FY)	2021-04-01 – 2025-03-31
Keywords	細胞質雄性不稔 / ファインマッピング / 稔性回復遺伝子
Outline of Annual Research Achievements	「ファインマッピングによる稔性回復遺伝子の同定」について、最終的に19の交配集団からなる983実生のジェノタイピングを終了し、MS-P1領域を挟むSSR00220-4とSSR00432-1間で組換えを起こしていた実生を17系統選抜することができた。また、これら系統すべての葯のサンプリングを完了させており、順次、雄性不稔性の評価を進めている。前年度までに、HT1ハプロタイプ（non-functional restorerof-fertility）ホモに持つKO14とHT6ハプロタイプ（functional restorerof-fertility）ホモに持つ口之津51号とのロングシークエンシングデータの比較解析において、2つの候補遺伝子周辺に欠損が確認されていた。さらに、データ解析を進めたところ、2つの候補遺伝子のORFにおいても欠損が確認された。これら候補遺伝子がどちらか片方、もしくは両方が稔性回復遺伝子であることが示唆された。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned. Reason MS-P1領域を挟む2つのマーカー間で組換えを起こしていた実生を17系統選抜することができ、これらの雄性不稔性評価も進んでいる。また、HT1ハプロタイプにおいて2つの候補遺伝子のORFに欠損が生じていることも明らかになっていることから、稔性回復遺伝子の同定に向けて確実に進展している。
Strategy for Future Research Activity	MS-P1領域内にマーカーをデザインし、選抜された17系統のジェノタイピングを進める。また、それらの雄性不稔性評価も合わせて行い、ファインマッピングを進めていく。ロングリードシークエンスデータを用いて2つの候補遺伝子のORFに欠損があることが示唆されたが、この欠損はPCRとシークエンスを用いて、確認していく。
Causes of Carryover	2023年7月1日から2024年6月30日までフロリダ大学にて留学予定である。そのため、この期間中科研費の課題を休止している。2024年7月1日から科研費課題を再開し、ジェノタイピングに使用する試薬代、国際学会参加費、旅費に使用する予定である。