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2021 Fiscal Year Research-status Report

ウイルス進化推進力分析から未来進化予測の基盤を構築する

Research Project

Project/Area Number 21K05601
Research InstitutionSaga University

Principal Investigator

大島 一里  佐賀大学, 農学部, 教授 (00176869)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywordsウイルス進化推進力 / ポティウイルス / 拡散年代 / 侵入年代 / 未来進化予測
Outline of Annual Research Achievements

応募者がこれまで独自に蓄積してきた情報に加えて,農作物や人の移動経路を考慮しながら,ウイルス病原体が起源地から世界中に拡がるハブ地となる発生中心にどのように移動し,その後世界各地域にどのように拡散したのか,また我が国にどのような経路で侵入したのか,我が国内でどのように循環しているのかなど,地球規模や全国規模での視点から明らかにすると共に,これまで課題として残されていたウイルス病原性進化に関わった推進力の爆発年代をウイルス種として調べるだけでなく属レベルまで明らかにして,次のステップとなる病原体の未来進化予測の基盤を構築することを目的とした。
ポティウイルスのウイルス種の代表的な種としてジャガイモYウイルスやカブモザイクウイルス(TuMV)の大量のゲノム情報を用い, TuMV の分子系統グループ,そしてポティウイルス属全体に焦点を当て,突然変異,組換え,再集合の進化推進力そして宿主適応などの分子進化について進化速度から爆発年代進化や拡散を地球規模で分析した。今年度は特にカブモザイク分子系統グループのスイセンのウイルスに焦点を当て補足しなければならないウイルスゲノムの塩基配列の決定を行った。分子疫学的・進化的な新知見をもとに爆発年代を伴う病原性進化を分析評価し,我が国を含めた地球規模での農作物の伝播,人の移動及び農業の発達に関わる総合的な考察を行い,応募者が独自にこれまで積み上げてきたゲノム情報を合わせて未来の病原体の未来進化予測の基盤構築のアプローチを行った。具体的にはポティウイルスの3種のスイセンのウイルスについて我が国内での拡散や侵入年代の推定を行い,投稿論文として公表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定していた投稿論文が一報受理され,現在2報目を投稿中である。

Strategy for Future Research Activity

投稿中である2報目の受理を目指し,目的としているウイルス進化推進力分析から未来進化予測の基盤を構築するためのアプローチを行う。

Causes of Carryover

現在投稿中のオープンアクセス誌があり,受理後に投稿料として使用予定である。

  • Research Products

    (2 results)

All 2022 2021

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Narcissus Plants: A Melting Pot of Potyviruses2022

    • Author(s)
      Probowati Wiwit、Kawakubo Shusuke、Ohshima Kazusato
    • Journal Title

      Viruses

      Volume: 14 Pages: 582~582

    • DOI

      10.3390/v14030582

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Molecular epidemiology and dispersal dynamics of a plant virus in global and local scale2021

    • Author(s)
      Shusuke Kawakubo・Kazusato Ohshima
    • Organizer
      日本ウイルス学会

URL: 

Published: 2022-12-28  

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