2022 Fiscal Year Research-status Report
Comprehensive genetic analysis-based liquid biopsy for establishment of the novel tumor biomarker in dog
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21K05952
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| Research Institution | Okayama University of Science |
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Principal Investigator |
田川 道人 岡山理科大学, 獣医学部, 准教授 (00749468)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 悪性黒色腫 / メラノーマ / cell free DNA / 全エクソン解析 / バイオインフォマティクス / リキッドバイオプシー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
犬悪性黒色腫４症例より得た腫瘍組織と、同一症例の末梢血液より得たPBMCよりDNAを抽出し、両者をKOTAI社に送付し全エクソン解析を行った。得られた遺伝子配列は
犬の全ゲノム（CanFam 3.1 genome (GCF_000002285.3_CanFam3.1) ）に対してアノテーションを行い個体特有の遺伝子変異を決定した。その結果、各症例とも複数の遺伝子変異が観察され、人の悪性黒色腫に関連した変異、その他の腫瘍に関連した変異などが認められた。一方、複数の症例で同一の変異は観察されず、腫瘍マーカーとして利用可能な変異の同定には至らなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
当方の異動と一時的な休職期間により十分な研究が行えなかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
現在は得られた変異情報をもとにマーカー候補の探索を行っている。候補決定後はデジタルPCRなどでの検出系の確立を目指す。
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| Causes of Carryover |
研究の進捗が遅れているため、残高が生じている。今年度に使用する予定。
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