Construction of a database for histopathological diagnosis of bovine respiratory disease complex using whole slide images

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K05965
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 42020:Veterinary medical science-related
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: Kimura Kumiko 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 動物衛生研究部門, グループ長 (30391444)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: バーチャルスライド / 牛呼吸器病症候群 / データベース / 病理組織学的診断 / 獣医病理

Outline of Final Research Achievements

To improve the accuracy of histopathological diagnosis of bovine respiratory disease complex (BRDC), a database using whole slide images was constructed. WSIs were created from 352 tissue specimens from 111 cases, and metadata such as case information and histopathological findings were added to each image. The collected cases varied from necrotizing pneumonia, purulent pneumonia, granulomatous pneumonia, and interstitial pneumonia to a wide variety of combinations of pathogens involved. WSI images and metadata were stored on the servers of the National Agriculture and Food Research Organization. Cases can be retrieved by a search system and viewed externally via an SSL-VPN connection.

Free Research Field

獣医病理学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

バーチャルスライド（WSI）はデジタルデータとして病理組織標本全体を観察することができる。すなわち成書に掲載されている典型病変の切り取り画像とは異なり，一枚の切片上の多様性を確認することができる。牛呼吸器病症候群では複数の要因が様々に関与し，複雑な病変を形成していることからWSIを活用したデータベースの構築は，過去の様々な症例の病理組織像を比較することを可能にし，病理学的診断の効率化および標準化が可能になる。また，それぞれの画像に症例の詳細情報，病理組織学的所見および病原検査結果等がメタデータとして付与されているため，病理組織学的検査の学習用資料としても活用が可能である。