2023 Fiscal Year Annual Research Report
シングルセルRNA-seqを用いた抗HIV抗体投与による寛解メカニズムの解析
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21K05989
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
桑田 岳夫 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 特任准教授 (70346063)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 抗体 / SHIV / カニクイザル / RNA-seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、抗HIV-1抗体の投与によってHIV-1感染が寛解状態に至るメカニズムの解明である。SHIV感染カニクイザル・モデルにおいて、抗HIV抗体の3回投与によってウイルス増殖を持続的に抑制したサルと、抑制しなかったサルが認められた。昨年度までに、抗体投与後に採取したリンパ節のsingle cell RNA sequencingを行って、カニクイザルでの細胞群特定の新たなマーカー遺伝子の同定を行った。その結果、T細胞、B細胞、centroblast、centrocyte、plasmablast、NK細胞、単球、myeloid DC、plasmacytoid DC、innate lymphoid cellに細胞群を分類することが可能になった。ウイルス抑制群と非抑制群の比較では、ウイルス感染で直接影響されるCD4+ T細胞と、proliferating T細胞で有意な差はみられた。遺伝子発現の解析ては、CD4+ T細胞でTIGIT, APOD, GIPC2, PLAC8, MYL9, RAB11FIP1などの遺伝子発現がウイルス抑制群で上昇していたが有意な差ではなく、細胞の採取日時や凍結の影響が大きくて、ウイルス抑制に特異的な遺伝子発現の上昇や抑制をみつけることはできなかった。寛解状態に至るメカニズムとして細胞性免疫の誘導が重要であることが分かっているが、CD8+ T細胞でもTIGIT, ITM2A, RPL22L1, IL7R, KLRB1などの発現上昇がウイルス抑制群で見られるものの有意な差ではなかった。抗原提示に重要な役割を果たしているDC細胞は細胞数が少なく、十分な解析ができなかった。寛解誘導メカニズムの解明には、このような少数の細胞群を個別に解析していく必要があることが示唆された。
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