Functional analysis of the Trap Clone Accumulated Area (TCAA).

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K05999
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 42040:Laboratory animal science-related
• Research Institution: Kumamoto University
• Principal Investigator: Araki Masatake 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 准教授 (80271609)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 吉信 公美子 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 助教 (20274730) ; 荒木 喜美 熊本大学, 生命資源研究・支援センター, 教授 (90211705)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: 遺伝子トラップ / マウス / ES細胞 / スーパーエンハンサー / 分化多能性

Outline of Final Research Achievements

A region of gene trap clones accumulated in the absence of genes was found and named TCAA (Trap Clone Accumulated Area). Mouse chromosomes 1~19 and X were analysed and 1104 TCAAs were identified. Experimental data obtained with mouse ES cells and information from databases were used to predict the function of TCAA.
The results indicate that TCAAs may play an important role in maintaining ES cell pluripotency. In addition, 120 (51.9%) of the 231 super-enhancers that regulate the function of important genes in ES cells were matched to TCAAs.

Free Research Field

分子生物学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ゲノム上には、遺伝子では無い部分に重要な情報が隠されていることがあります。今回発見したTCAAは、本来遺伝子を捕まえる方法である遺伝子トラップで、スーパーエンハンサーの様な遺伝子の働きを制御している領域が同定できることを示しました。マウスのES細胞だから行うことができた解析ですが、ヒトゲノムにも同様な領域が隠されている可能性があり、原因不明の難病や発癌に関係している可能性もあります。