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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Understanding the mechanism underlying splicing termination with mRNA re-splicing repressor

Research Project

Project/Area Number 21K06024
Research InstitutionFujita Health University

Principal Investigator

前田 明  藤田医科大学, がん医療研究センター, 名誉教授 (50212204)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
Keywords遺伝子発現制御 / スプライシング / 癌 / TSG101 / mRNA再スプライシング / エクソン接合部複合体(EJC) / mRNA品質管理 / スプライシング完了機構
Outline of Annual Research Achievements

癌細胞で起こるmRNA再スプライシング現象をモデルにして、今まで未知だったmRNA前駆体のスプライシング完了機構を解明できた。スプライシング後のmRNAに結合するエクソン接合部複合体(EJC, Exon Junction Complex)が、成熟mRNAの再スプライシングを抑制している事実を証明した。実際に、中核3因子(eIF4A3, MAGOH, Y14/RBM8A)を正常細胞でノックダウンすると、正常細胞で本来起こらないmRNA再スプライシングが誘導できる。
そのmRNA再スプライシング抑制のメカニズムを、エキシトロン(エクソン内の選択的イントロン)をモデルとして解析した。そのエキシトロンを除くスプライシング(以後エキシトロン・スプライシング)は、EJC中核3因子(eIF4A3, MAGOH, Y14/RBM8A)のノックダウンで促進するので、mRNA再スプライシングを再現できる系となる。以前に、成熟mRNAはEJCが、SRやhnRNP蛋白質を中心とする多くのRNA結合蛋白質の結合を誘導し、コンパクトなmRNA蛋白質複合体(mRNP)を形成することが知られていた。そこで、私たちはEJCが結合しないと成熟mRNAはコンパクト構造をとれなくなり、スプライシング複合体(スプライソソーム)の再形成を許してしまう、と予想した。
HNRNPM遺伝子を使い、そのエキシトロンを含むエクソンと両端のイントロンから構成されるミニ・レポーター遺伝子を作成した。この両端のイントロンを取り除くと、エキシトロン・スプライシングが促進した。よって両端イントロンでのスプライシング完了に伴うEJC結合が、エキシトロン・スプライシングを抑制していることが示唆された。そこでエキシトロン両端にテザリングでEJC中核因子を結合させると、実際にエキシトロン・スプライシングの抑制を再現できた。EJCが誘導するmRNPのコンパクト構造が、スプライソソームの再形成を阻止し、mRNA再スプライシングの抑制を導いていることが明らかとなった。

  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ウイーン天然資源大学/応用遺伝学・細胞生物学科(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      ウイーン天然資源大学/応用遺伝学・細胞生物学科
  • [Journal Article] Structural differences between the closely related RNA helicases, UAP56 and URH49, fashion distinct functional apo-complexes.2024

    • Author(s)
      K-I. Fujita, M. Ito, M. Irie, K. Harada, N. Fujiwara, Y. Ikeda, H. Yoshioka, T. Yamazaki, M. Kojima, B. Mikami, A. Mayeda, S. Masuda
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Pages: 455

    • DOI

      10.1038/s41467-023-44217-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Terminal regions of UAP56 and URH49 are required for their distinct complex formation functioning to an essential role in mRNA processing and export.2024

    • Author(s)
      K-I. Fujita, T. Yamazaki, A. Mayeda, S. Masuda
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 703 Pages: 149682

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2024.149682

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] RBM17 expression Is associated with the efficacy of ICI monotherapy in NSCLC with low PD-L1 expression.2023

    • Author(s)
      H. Nagamine, M. Yashiro, N. Yoshimoto, M. Izumi, A. Sugimoto, K. Nakahama, K. Ogawa, Y. Matsumoto, K. Sawa, Y. Tani, H. Kaneda, S. Mitsuoka, K. Yamada, T. Watanabe, K. Aasai, K. Fukumura, A. Mayeda, T. Kawaguchi
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: 43 Pages: 4663~4672

    • DOI

      10.21873/anticanres.16662

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SAP30BP interacts with RBM17/SPF45 to promote splicing in a subset of human short introns.2023

    • Author(s)
      K. Fukumura, L. Sperotto, S. Seuss, H-S. Kang, M. R. Yoshimoto, M. Sattler, A. Mayeda
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Pages: 113534

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.113534

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNPS1 in PSAP complex controls periodic pre-mRNA splicing over the cell cycle.2024

    • Author(s)
      K. Fukumura, A. Masuda, J.-i. Takeda, K. Ohno, A. Mayeda
    • Organizer
      The 29th Annual Meeting of the RNA Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identified RBM17 (SPF45)-SAP30BP interaction promotes non-canonical splicing in a subset of human short introns.2023

    • Author(s)
      K. Fukumura, L. Sperotto, Stefanie Seuss, H-S. Kang, R. Yoshimoto, M. Sattler, A. Mayeda
    • Organizer
      The 28th Annual Meeting of the RNA Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Splicing in a subset of human short introns is promoted by SAP30BP-RBM17 but not by canonical U2AF2-UFAF1.2023

    • Author(s)
      K. Fukumura, L. Sperotto, S. Seuss, H.-S. Kang, R. Yoshimoto, M. Sattler, A. Mayeda
    • Organizer
      The 24th Annual Meeting of the RNA Society of Japan
  • [Presentation] EJC core-triggered compacted mRNP structure represses cancer-specific splicing in exitron.2023

    • Author(s)
      K.-I. Fujita, Y. Otani, T. Kameyama, P. Venhuizen, M. Kalyna, A. Mayeda
    • Organizer
      Eukaryotic mRNA Processing Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] エクソン接合部複合体(EJC)から形成されるmRNP密集構造はエキシトロン(エクソン内イントロン)で起こる異常スプライシングを抑制している.2023

    • Author(s)
      藤田 賢一, 大谷勇太, 亀山俊樹, P. Venhuizen, M. Kalyna, 前田 明
    • Organizer
      第46回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] SAP30BP-RBM17 interaction is an essential process to splice out a subset of human short introns.2023

    • Author(s)
      福村和宏, L. Sperotto, S. Seuss, H.-S. Kang, 芳本玲, M. Sattler, 前田 明
    • Organizer
      第46回 日本分子生物学会年会
  • [Book] スプライシング制御① mRNA転写・プロセシング・核外輸送・品質管理における相互連携の重要性: mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用2023

    • Author(s)
      藤田 賢一, 堀 史人, , 鵜飼 生望, 前田 明, 増田 誠司
    • Total Pages
      411
    • Publisher
      技術情報協会
    • ISBN
      978-4-86104-937-8
  • [Remarks] 研究室のホームページ

    • URL

      http://www.fujita-hu.ac.jp/~mayeda/

URL: 

Published: 2024-12-25  

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