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2022 Fiscal Year Research-status Report

非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構

Research Project

Project/Area Number 21K06053
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

千葉 志信  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (20523517)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsYidC / タンパク質膜挿入
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質を膜に組み込む膜組込装置には、孔(チャネル)を持つタイプと持たないタイプがある。チャネル型膜組込装置の分子機構の理解は比較的すすんでいるが、非チャネル型タンパク質膜組込装置の分子機構はその多くが不明である。本研究では、非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構と生理機能を理解するために、変異解析や阻害剤のスクリーニングを行うことを計画した。
2022年度は、昨年度に引き続き、YidCの阻害剤の探索をさらに進めた。候補化合物について、YidCの変異株に対する効果を見たところ、いくつかの阻害剤は、その阻害効果を喪失した。このことから、これらの阻害剤の直接のターゲットがYidCであることが強く示唆された。
一方で、昨年度から行っている、枯草菌YidCの新規基質の探索をさらに進めた。枯草菌膜タンパク質とMifMとを融合した各種レポーターを作成し、その膜挿入のSpoIIIJ依存性を検討し、結果として、複数のYidC基質と思われるものを同定した。さらに、これらの膜挿入がSpoIIIJの溝の塩基性残基に依存している事が示された。このことは、SpoIIIJの溝の塩基性が普遍的に重要であることを示している。一方、各基質間で、膜挿入に重要な性質がそれぞれ異なることも明らかになった。このことから、YidCは、基質特異的な相互作用も合わせてタンパク質の膜挿入を促進していることが示唆された。これらについて、必要なデータを揃え、論文としてまとめ、投稿した。
YidCの細胞質領域の変異解析をより詳細に進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

YidCの阻害剤について、有力と思われる化合物が複数見出された。また、YidCの新規基質を複数同定し、それらの成果をまとめ、論文投稿を行った。その中で、YidCの塩基性残基の普遍的な重要性と基質固有の相互作用の存在を報告した。
以上の成果が得られたことから、研究計画がおおむね順調に進行していると判断出来る。

Strategy for Future Research Activity

YidCの細胞質領域の変異解析を進め、YidCと基質とのどのような相互作用を介して膜挿入が促進されるのかについての知見を得る予定である。

Causes of Carryover

当初の計画よりも、消耗品の使用量を低く抑えることができたため、その分を2023年度に回すことにした。2023年度は、YidCの細胞質領域の変異解析に、依然として多数のDNAプライマーが必要であるため、2022年度分の繰越請求した分と2023年度分とを併せて使用することで、着実に計画を遂行する。

  • Research Products

    (20 results)

All 2023 2022

All Journal Article (1 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Nascent chain-mediated translation regulation in bacteria: translation arrest and intrinsic ribosome destabilization2023

    • Author(s)
      Chiba Shinobu、Fujiwara Keigo、Chadani Yuhei、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 173 Pages: 227~236

    • DOI

      10.1093/jb/mvad007

  • [Presentation] 非チャネル型タンパク質膜挿入装置YidCの解析2023

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      サントリー生命科学財団セミナー
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質局在化装置に関連した翻訳アレスト因子の探索と解析2022

    • Author(s)
      千葉志信、吉田真悠、辻奈緒子、藤原圭吾
    • Organizer
      第68回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] 放線菌由来の新規アレスト因子の探索と解析2022

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      第68回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] TnDR 法による新生鎖の動的挙動のプロテオームワイドな検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第68回日本生化学会近畿支部例会
  • [Presentation] タンパク質局在化装置と翻訳アレスト因子の進化的な繋がり2022

    • Author(s)
      千葉志信、崎山歌恋、吉田真悠、下川-千葉直美、藤原圭吾
    • Organizer
      第18回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] TnDR-seq による新生鎖の動的挙動の網羅的検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、赤岡大暉、千葉志信
    • Organizer
      第18回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 微生物における新規翻訳品質管理機構 RQC の分子メカニズムの解明2022

    • Author(s)
      高田啓、藤原圭吾、Gemma C. Atkinson、Vasili Hauryliuk、千葉 志信
    • Organizer
      第18回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 枯草菌における翻訳途上鎖依存的な翻訳終了現象の解析2022

    • Author(s)
      赤岡大暉、高田啓、藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第18回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 放線菌の新規翻訳アレスト因子の探索と解析2022

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      第18回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 真正細菌の翻訳アレスト因子の網羅的探索2022

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第15回 小胞体ストレス研究会
  • [Presentation] モデル細菌における新生鎖ダイナミクスの網羅的検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第15回 小胞体ストレス研究会
  • [Presentation] 放線菌由来の翻訳アレスト因子の探索と in vitro での解析2022

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      2022年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
  • [Presentation] 枯草菌における新生鎖依存的な翻訳終了現象2022

    • Author(s)
      赤岡大暉、高田啓、藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      2022年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
  • [Presentation] TnDR-seq による新生鎖挙動の検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      2022年度グラム陽性菌ゲノム機能会議
  • [Presentation] TnDR-seq による新生鎖挙動の網羅的検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 微生物翻訳研究のこれから2022

    • Author(s)
      高田啓、藤原圭吾、千葉 志信
    • Organizer
      第1回マルチファセットプロテインズ・若手ワークショップ
  • [Presentation] 真正細菌における翻訳アレストの解析と応用2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第1回マルチファセットプロテインズ・若手ワークショップ
  • [Presentation] 機能性翻訳途上鎖の生理機能と分子機構2022

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第3回マルチファセットプロテインズ領域会議
  • [Presentation] TnDR-seqによる新生鎖挙動の検出2022

    • Author(s)
      藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第3回マルチファセットプロテインズ領域会議

URL: 

Published: 2023-12-25  

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