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2023 Fiscal Year Annual Research Report

非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構

Research Project

Project/Area Number 21K06053
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

千葉 志信  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (20523517)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2024-03-31
KeywordsYidC / タンパク質膜挿入
Outline of Annual Research Achievements

膜タンパク質を膜に組み込む膜組込装置には、孔(チャネル)を持つタイプと持たないタイプがある。チャネル型膜組込装置の分子機構の理解は比較的すすんでいるが、非チャネル型タンパク質膜組込装置の分子機構はその多くが不明である。本研究では、非チャネル型タンパク質膜組込装置YidCの分子機構と生理機能を理解するために、変異解析や阻害剤のスクリーニングを行うことを計画した。
2023年度は、昨年度に探索したYidCの阻害剤についての解析を進めるとともに、別の研究グループから報告された、別種YidCの活性を阻害するとされた物質について、枯草菌での効果を調べた。その結果、既知の阻害剤では、枯草菌YidCに対する強い阻害効果は観察されず、YidC阻害剤の種特異性が明らかになった。YidCの構造の柔軟性がこのような種特異性を生み出す原因である可能性が考えられる。
一方で、昨年度までに同定した枯草菌YidCの新規基質についての解析を、論文投稿していたが、そのリバイスなどを行い、出版まで到達した。
さらに、YidCの細胞質領域の変異解析を進めた。特に、塩基性残基の数や分布が基質の膜挿入にどのような影響を与えるのかについて解析を行った。その結果、細胞質領域の塩基性の一般的な重要性が明らかになった。この重要性は、異なる基質においても共通であることを示唆する結果を得た。一方、塩基性残基の空間的配置の重要性は基質によって多様である事も示唆された。

  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] ハンブルク大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ハンブルク大学
  • [Journal Article] The SecM arrest peptide traps a pre-peptide bond formation state of the ribosome2024

    • Author(s)
      Gersteuer Felix、Morici Martino、Gabrielli Sara、Fujiwara Keigo、Safdari Haaris A.、Paternoga Helge、Bock Lars V.、Chiba Shinobu、Wilson Daniel N.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Pages: 1~16

    • DOI

      10.1038/s41467-024-46762-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RAPP-containing arrest peptides induce translational stalling by short circuiting the ribosomal peptidyltransferase activity2024

    • Author(s)
      Morici Martino、Gabrielli Sara、Fujiwara Keigo、Paternoga Helge、Beckert Bertrand、Bock Lars V.、Chiba Shinobu、Wilson Daniel N.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 15 Pages: 1~16

    • DOI

      10.1038/s41467-024-46761-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of Bacillus subtilis YidC Substrates Using a MifM-instructed Translation Arrest-based Reporter2023

    • Author(s)
      Shiota Narumi、Shimokawa-Chiba Naomi、Fujiwara Keigo、Chiba Shinobu
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 435 Pages: 168172~168172

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2023.168172

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 翻訳アレストを介した細胞の機能制御2024

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第2回タンパク質関連シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 海洋性バクテリア Alteromonas macreodii の多様な翻訳アレスト因子2024

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      第18回日本ゲノム微生物学会年会
  • [Presentation] 機能性翻訳途上鎖の生理機能と分子機構2023

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第4回マルチファセットプロテインズ領域会議
  • [Presentation] 新規翻訳アレスト因子のバクテリアワイドな探索2023

    • Author(s)
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • Organizer
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] アルテロモナス属由来新規翻訳アレスト因子の下流遺伝子発現制御機構の解析2023

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、千葉志信
    • Organizer
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] クロストリジウム綱に由来する新規翻訳アレスト因子の分子機構の解明2023

    • Author(s)
      吉田真悠、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      第19回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] 翻訳アレストを利用した細胞の機能制御の分子機構2023

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第23回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] Bacteria-wide search for translational arrest peptides2023

    • Author(s)
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • Organizer
      第24回日本RNA学会年会
  • [Presentation] Identification of Novel Translation Arrest Peptides with RAPP and RGPP sequence Motifs2023

    • Author(s)
      Tsuji Naoko,_Fujiwara Keigo, Takada Hiraku_, Chiba Shinobu
    • Organizer
      第24回日本RNA学会年会
  • [Presentation] タンパク質局在化装置に関連する翻訳アレスト因子のバクテリアワイドサーチ2023

    • Author(s)
      藤原圭吾、辻奈緒子、吉田真悠、千葉志信
    • Organizer
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [Presentation] クロストリジウム綱由来の新規アレスト因子の分子機構と下流遺伝子制御の解明2023

    • Author(s)
      吉田真悠、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [Presentation] 配列モチーフの探索による新規アレスト因子の同定2023

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      マルチファセットプロテインズ領域会議・第2回若手の会
  • [Presentation] 機能性翻訳途上鎖の生理機能と分子機構2023

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      第5回マルチファセットプロテインズ領域会議
  • [Presentation] RAPP様配列を含む新規翻訳アレスト因子の同定2023

    • Author(s)
      辻奈緒子、藤原圭吾、高田啓、千葉志信
    • Organizer
      第96会日本生化学会大会
  • [Presentation] Regulated translation arrest: a regulation mechanism of genes for bacterial protein localization machinery2023

    • Author(s)
      Shinobu Chiba
    • Organizer
      BACELL2023
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 新生ポリペプチド鎖によるタンパク質バイオジェネシスのモニタリング2023

    • Author(s)
      千葉志信
    • Organizer
      新資源生物変換研究会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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