2023 Fiscal Year Annual Research Report
LTR型レトロトランスポゾンの配列特異型転移特性の進化機構の解明
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21K06284
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| Research Institution | Kyoto Sangyo University |
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Principal Investigator |
河邊 昭 京都産業大学, 生命科学部, 教授 (10582405)
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2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 動原体 / トランスポゾン / アブラナ科 / シロイヌナズナ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
アブラナ科植物におけるトランスポゾンファミリーの存在様式の調査をおこなった。シロイヌナズナ属で見つかった動原体領域をターゲットとするトランスポゾンファミリーについて、アブラナ科の植物を対象として、進化解析をおこない、類似の配列が広く存在することを確認していたが、このうちいくつかに関して、コピーのゲノム上での分布を調査した。多くの種で動原体領域に局在するが、幾つかの種で動原体領域とそうでない領域に存在するグループが共存し、また動原体領域には全く局在しない種も少数見いだされた。今後、系統間の違いや発現解析をしていくことで動原体をターゲットとする機構の進化様式と分子機構の解明を目指したい。
またシロイヌナズナを材料として、これまでに研究が進んでいた系統とは別の系統で新たなグループを調査している。すでに系統間で挿入位置が異なる配列が多くみられるグループや、最近コピー数を増やしたと思われるグループを複数見出している。今後はこれらの系統について低メチル化剤処理や低メチル化変異の導入によるトランスポゾンの活性化を試みることで、転移可能なコピーの特定、その特性の調査をおこなっていきたいと考えている。
他にもｒRNA遺伝子をターゲットにするグループを新たにみいだした。これらはアブラナ科に広く分布するわけではなく特定の種（属）だけに限って同じグループのトランスポゾンがrRNAをターゲットとしているように見える。今後このグループに関して、分子生物学的・進化学的に詳細な解析を進めていく予定である。
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