2023 Fiscal Year Annual Research Report
複数の小規模・大規模交雑がもたらすイモリの網状進化とモザイク的な集団構造の検証
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21K06321
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
富永 篤 琉球大学, 教育学部, 教授 (60452968)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松波 雅俊 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (60632635)
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| Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | アカハライモリ / ddRAD-seq / RNA-seq |
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| Outline of Annual Research Achievements |
今年度は、ddRAD-seqの解析を進め、論文化のために原稿の執筆を進めた。おおよその原稿は出来上がりつつあり、２０２４年度中には、国際誌に投稿予定である。また、長野周辺の交雑帯をはさんだ北日本系統と中部日本系統の個体群からそれぞれ２地点、１０個体を採集し、肝臓や筋肉など多くの組織からＲＮＡを抽出し、ＲＮＡのクオリティを確認した後に、約４０個体分のサンプルのRNA-seqの解読を進めた。すでに十分な量と質のRNA-seqのデータが得られており、現在、クオリティチック、アダプター配列除去、アッセンブルまでが完了している。これらのContig配列のアノテーションを行うために必要な有尾類などのゲノム情報を集めている。アノテーションがおわれば、特定の機能遺伝子が交雑帯を超えて、選択的な遺伝子浸透が生じていないか検討する。
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