Analysis of gene expression control mechanism by neural stem cell-specific enhancers

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K06396
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 46010:Neuroscience-general-related
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: SANOSAKA Tsukasa 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教 (40588472)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 裏山 悟司 奈良県立医科大学, 医学部, 助教 (90609976)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: エピジェネティクス / エピゲノム

Outline of Final Research Achievements

In this research project, in order to identify neural stem cell-specific enhancers, we focused on enhnacner RNA (eRNA), which is transcribed from enhancer regions, and identified 705 enhancer candidate regions. We also succeeded in identifying potential genes targeted by the enhancer in multiple regions.

Free Research Field

バイオインフォマティクス

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

エンハンサー領域の同定は、ゲノムの種間での保存割合や、ゲノムにおける転写因子の結合位置の同定といった過去の報告から予測されていたものの、実際に活性のあるエンハンサー領域の同定には至っていなかった。本研究課題ではエンハンサー領域の同定とその標的遺伝子の同定したことにより、組織特異的遺伝子の発現制御機構の一端を明らかにした。