2021 Fiscal Year Research-status Report
Selection of small molecules modulating endogenous antibodies
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21K06450
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
長野 正展 東京大学, 大学院総合文化研究科, 特任助教 (00771619)
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Project Period (FY) |
2021-04-01 – 2024-03-31
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Keywords | 抗体 / 低分子 / DEL |
Outline of Annual Research Achievements |
内在性抗体の制御素子として抗体Fc結合ドメインに結合する低分子化合物を探索する。本計画では、低分子リガンド探索ツールとしてDNA-encoded chemical library (DEL)を用いる。DELはライブラリーの増幅が困難であり、ライブラリーから効率よく非結合種・弱結合種を除くことが成功の鍵となる。そこで1年目はDELのヒット濃縮に関わる予備検討を中心に研究を実行した。具体的にはモデルリガンド-DNAコンジュゲートと既知の標的タンパク質のペアを用いて効率的な洗浄淘汰方法を検討した。種々のタンパク質固定化ビーズと低分子結合二重鎖DNAを混合し、種々の洗浄を繰り返した。洗浄後の複合体の回収率を定量PCRで見積もったところ、DELにおける最適なビーズの種類と高親和性リガンドが獲得できる洗浄方法に関する知見が得られた。本知見を元に抗体に対しDELでスクリーニングを行ったので、結果を精査している。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
DELにおける非結合種の排除はスクリーニングの成功の左右するファクターであるが、DELを取り扱うための最適な条件を整えることができた。また最適な条件でのDELを使ったスクリーニングも開始できている。
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Strategy for Future Research Activity |
スクリーニングによって得られた化合物を化学合成し、抗体への親和性を確認し、フィードバックを行いながら構造最適化を行う。共結晶構造をとることも視野に入れる。
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Causes of Carryover |
コロナにより出張費が0円となったため次年度使用額が生じた。発生した次年度使用額は物品費、および旅費の一部として使用する。
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Research Products
(3 results)